Chaque mois, un épidémiologiste francophone de l’AEEMA met en avant un article scientifique de son choix. 

Ce mois-ci, Natalie Moyen, qui obtenu sa thèse d'université en épidémiologie au Royal Veterinary College à Londres et est maintenant coordinatrice One Health à Mott MacDonald (UK), vous propose l'article "Emergence of fluoroquinolone-resistant Campylobacter jejuni and Campylobacter coli among Australian chickens in the absence of fluoroquinolone use" écrit par Abraham et al. et publié dans  le journal Applied and Environmental Microbiology en 2020.

Cet article est disponible ici. 

Pouvez-vous nous résumer brièvement l’article ?

Pourquoi avoir choisi de mettre en avant cet article ?

On entend très souvent que l’utilisation excessive d’antibiotiques dans les élevages est une cause importante de l’augmentation des taux de résistance observée dans le monde. Cet article, par contre, décrit une situation où les résistances observées chez les bactéries présentes chez les volailles ne sont probablement pas le résultat de pratiques d’élevage, et présente d’autres hypothèses à explorer. Cependant, pour confirmer ou infirmer l’hypothèse de la contamination des volailles par l’eau, les hommes, ou les animaux sauvages ou domestiques, les études complémentaires ainsi que l’interprétation de leurs résultats et leur transformation en recommandation nécessiteraient la participation de nombreux décisionnaires et acteurs. Cela contribue à souligner l’importance d’une approche multisectorielle de la surveillance de l’antibiorésistance, ainsi qu’une approche qui inclut l’intégralité des filières alimentaires. De plus, cet article utilise diverses techniques d’analyses de laboratoire, depuis la bactériologie classique au séquençage génétique, tout en montrant leur complémentarité ce que je trouve intéressant car cela montre que les nouvelles technologies ne remplacent pas entièrement les méthodes classiques, qui ont de la valeur. Enfin, cet article démontre l’intérêt de connaitre les données d’utilisation des antibiotiques en élevage pour interpréter les résultats de surveillance de l’antibiorésistance.

Y a-t-il des points abordés dans l’article qui vous ont laissé perplexe ou que vous auriez aimé voir plus développés ?

L’hypothèse selon laquelle aucun acteur de la filière aviaire n’utilise de fluoroquinolones n’est pas discutée, ni vérifiée par des tests complémentaires tels que des recherches de traces de fluoroquinolones dans l’alimentation des volailles, et de résidus dans la viande. Il aurait aussi été intéressant de discuter comment ces résultats peuvent être utilisés pour informer la surveillance de la résistance aux fluoroquinolones chez C. jejuni et C. coli, ou à d’autres antibiotiques chez d’autres pathogènes. Enfin, l’utilisation de ces conclusions par les acteurs de la filière aviaire et les services vétérinaires aurait aussi pu être discutée.

Merci à Natalie Moyen ( Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.) pour sa contribution.

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A noter qu’il n’y a pas de comité de lecture pour cette rubrique et que le contenu n’engage que le contributeur du mois.