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Catégorie : COVID-19 et monde animal

 Depuis le début de l'épidémie de COVID-19, une rubrique spécifique a été  régulièrement mise à jour jusqu'en mai 2022, fournissant des liens et des références d'articles vous informant sur les relations entre le virus responsable et le monde animal, sauvage et domestique.

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Catégorie : COVID-19 et monde animal
Les références d'articles sont présentées de la plus récente à la plus ancienne.
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     Auteurs : Allendorf V. et al..
     Source : One Health

     Date de publication : 29 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 avril 2022)

Les auteurs font état d’une évaluation quantitative du risque qu’un chat domestique, infecté par le SARS-CoV-2 par l’intermédiaire d’un humain, transmette le SARS-CoV-2 à d’autres personnes de la même maisonnée. A cette fin, ils ont recueilli l’avis d’experts par une méthode Delphi modifiée. Ils en ont conclu que ce risque est très faible à négligeable, et est fonction de l’intensité des interactions entre chat et personnes.

     Auteurs : Yen H-L. et al..
     Source : THE LANCET

     Date de publication : 12 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)

Résultats de l’enquête conduite à Hong Kong (Rép. pop. de Chine) sur les cas d’infection par le SARS-CoV-2 apparus chez des hamsters dorés importés et mis en vente dans différents établissements, qui ont eu pour origine une souche du variant Delta n’ayant pas circulé précédemment sur le territoire. Ces résultats conduisent à penser que des hamsters infectés ont transmis le virus à des personnes au moins en deux circonstances, puis celui-ci s’est propagé entre personnes. Par ailleurs aucun des hamsters nains, lapins, cochons d’Inde, chinchillas ou souris entretenus dans ces établissements ne s’est révélé infecté.

     Auteurs : Pickering B. et al..
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 25 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

Dans le cadre de la surveillance du SARS-CoV-2 dans la faune sauvage au Canada, les chercheurs ont mis en évidence chez les cerfs de Virginie un variant du virus très différent de ceux isolés précédemment. Les mutations constatées signent une adaptation à l’espèce. L’analyse phylogénétique de ce variant a montré qu’un cas humain de COVID-19 lui était lié épidémiologiquement, étant apparu dans la même zone géographique et la même période de prélèvement.

     Auteurs : Tan C. et al..
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 17 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)

Les auteurs ont étudié les génomes des souches de SARS-CoV-2 collectées chez les visons et les cerfs de Virginie, espèces chez lesquelles de multiples transmissions indépendantes homme – animal se sont produites avec ensuite transmission d’animal à animal, pour rechercher par analyse génétique les mutations potentiellement indicatives d’une pression de sélection dans ces espèces animales différant de celle existant dans la population humaine. Ils concluent que les mutations adaptatives du génome viral identifiées chez le vison et le cerf de Virginie semblent ne conférer au SARS-CoV-2 qu’un avantage mineur pour circuler dans la population humaine.

     Auteurs : Kok K-H. et al..
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 9 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)

L’article donne des détails sur les probables chaînes de transmission du variant Delta du SARS-CoV-2 à Hong Kong (Rép. pop. de Chine) entre des hamsters dorés importés des Pays-Bas et des personnes découvertes infectées par ce même variant. En outre, en utilisant l’épreuve RT-PCR, trois hamsters nains se sont révélés infectés par la lignée B.1.258 du SARS-CoV-2 qui a circulé en Europe de mars 2020 à décembre 2021.

     Auteur : ProMED
     Source : ProMED

     Date de publication : 26 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Dans cette page sont présentés les arguments que les autorités sanitaires de Hong Kong (République populaire de Chine) ont considéré comme confortant l’hypothèse selon laquelle les cas humains de COVID-19 apparus récemment sur ce territoire pouvaient être attribués à l’infection de hamsters importés. On y trouve aussi des arguments complémentaires fournis par un professeur de microbiologie de l’université de Hong Kong dans un communiqué de presse.

     Auteur : ProMED.
     Source : ProMED

     Date de publication : 19 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Les autorités sanitaires de Hong Kong (République populaire de Chine) ont procédé le 18/01/2022 à l’euthanasie de tous les hamsters de compagnie (environ 2 000) présents sur ce territoire après qu’un agrégat de cas humains de COVID-19 eut été relié à un employé travaillant dans une animalerie où 11 de ces animaux ont présenté des résultats positifs à la recherche du SARS-CoV-2. (Voir le site de l’OIE pour des informations complémentaires sur cet événement).
 
     Auteurs : Zhou J. et al..
     Source : Cell Reports

     Date de publication : 18 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Les auteurs s’intéressent au support moléculaire conduisant à l’adaptation du SARS-CoV-2 au vison et au furet et mettent en évidence les mutations qui interviennent au sein du spicule viral pour favoriser l’attachement à l’ACE2 des mustélidés. Ils évoquent aussi les raisons qui les conduisent à conclure qu’il est peu probable que les souches de SARS-CoV-2 adaptées à ces espèces constituent un danger accru pour la population humaine.

     Auteurs : Wei C. et al..
     Source : Journal of Genetics and Genomics

     Date de publication : 24 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2021)

Les auteurs explicitent les arguments d’analyse génétique qui les conduisent à émettre l’hypothèse d’une origine murine du variant Omicron du SARS-CoV-2.

     Auteurs : Rabalski L. et al..
     Source : Clinical Microbiology and Infection

     Date de publication : 15 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2021)

Les auteurs décrivent le passage à l'Homme d'une souche du SARS-CoV-2 dont l'adaptation au vison d'élevage a duré au moins trois mois. Ils décrivent les mutations constatées dans divers gènes d'un isolat viral provenant d'un homme infecté asymptomatique appartenant au personnel d'un élevage.

     Auteur : Worobey M.
     Source : Science

     Date de publication : 18 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

L’auteur développe l’ensemble des arguments et données sur les cas humains précoces de COVID-19 qui conduisent à considérer que l’épidémie trouve indubitablement son origine sur le marché d’animaux vivants de Huanan dans la ville de Wuhan, en République populaire de Chine.
 
     Auteurs : Ren W. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 8 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)

Dans cette étude, les auteurs montrent que la mutation Y453F, située dans le domaine de liaison au récepteur de la souche du SARS-CoV-2 responsable du « cluster 5 » qui a circulé entre des personnes et des visons d’élevage au Danemark, constitue une mutation adaptative qui favorise la liaison à l’ACE2 du vison et des autres mustélidés tout en ne compromettant pas, et même en renforçant la capacité du virus à utiliser l’ACE2 de l’être humain en tant que porte d’entrée cellulaire.
 
     Auteurs : Gass J. D. et al.
     Source : medRxiv

   Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 28 septembre 2021– (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Mise au point d’un système d’enquête standardisé destiné à décrire les interactions Homme – animal pendant la pandémie de COVID-19 et à évaluer les facteurs de risque biologiques, comportementaux et spatio-temporaux associés à la transmission du SARS-CoV-2 de l’un à l’autre au sein des foyers familiaux et d’autres milieux où ceux-ci entrent en contact étroit.
 
     Auteurs : Katoh K. et Standley D. M.
     Source : Communications Biology

     Date de publication : 22 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

Les auteurs ont repéré les sites où s’exprime la diversité la plus élevée dans l’alignement multiple de séquences de la protéine de spicule des coronavirus les plus proches du SARS-CoV-2 ayant infecté les chauves-souris et les pangolins avant la pandémie de COVID-19. Constatant une correspondance forte avec les mutations apparues dans les différentes lignées de SARS-CoV-2 infectant l’Homme, ils soutiennent qu’il est possible d’en déduire les variants de ce virus susceptibles d’apparaître dans le futur.
 
     Auteurs : Devaux C. A. et al.
     Source : Frontiers in Microbiology

    Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 20 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont réexaminé la question des variants du SARS-CoV-2 ayant circulé parmi les visons d’élevage en Europe en s’intéressant en particulier aux récepteurs cellulaires dans cette espèce et chez l’Homme ainsi qu’aux mutations intervenues dans la protéine de spicule du virus. Ils en tirent des conclusions sur le diagnostic de l’infection et la vaccination ainsi que sur la capacité qu’a le virus à infecter l’Homme ou l’animal et à se propager.
 
     Auteurs : Sánchez C. A. et al.
     Source : medRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 14 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

Considérant les connaissances actuelles sur les coronavirus de chauves-souris de type SRAS, les auteurs émettent des hypothèses sur leur distribution probable et la fréquence des contacts de la population humaine avec ces animaux pour estimer le nombre de personnes infectées annuellement par des coronavirus en Asie du Sud et du Sud-Est, dans l’objectif de faciliter la mise en place de programmes de surveillance et de prévention ciblés sur l’éventuel franchissement de la barrière d’espèce par de tels virus.
 
     Auteurs : Pekar J. et al.
     Source : Virological.org

     Date de mise sur un forum de discussion : 3 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

 Les SARS-CoV-2 ayant circulé dans la population humaine fin 2019 – début 2020 appartiennent à deux lignées dites A et B et l’idée jusqu’ici admise était que l’une avait évolué à partir de l’autre. Les auteurs remettent en cause cette assertion sur la base d’analyses génomiques. Cela amène à penser que le franchissement de la barrière d’espèce de l’animal à l’Homme ne se serait pas produit une seule mais plusieurs fois, éliminant par là-même l’hypothèse d’une fuite de laboratoire.
 
     Auteurs : Castelli M. et al.
     Source : bioRxiv

    Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 11 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)

En utilisant des techniques de simulation destinées à déterminer les caractéristiques fonctionnelles des spicules du SARS-CoV-2 et du coronavirus RaTG13 de la chauve-souris Rhinolophus affinis, les auteurs montrent que ces spicules ont une affinité élevée et très voisine pour le récepteur cellulaire (ACE2) de l’Homme et de cette chauve-souris, ce qui signifie que la barrière d’espèce est presque inexistante en ce qui concerne la question de l’attachement viral.
 
     Auteurs : de Rooij M. M. T. et al.
     Source : Occupational & Environmental Medicine

     Date de publication : 30 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Investigations conduites aux Pays-Bas dans des fermes de visons afin de détecter la présence de l’ARN du SARS-CoV-2 dans des prélèvements d’air, de litière et d’autres supports matériels.
 
     Auteurs : Kang L. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 6 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Les auteurs se sont intéressés aux modifications génétiques nécessaires pour que le coronavirus animal à l’origine du SARS-CoV-2 ait pu s’adapter à l’Homme. Ils ont trouvé des modifications dans le gène codant pour la protéine de spicule du virus qui ont très vraisemblablement joué un rôle critique dans le franchissement de la barrière d’espèce.
 
     Auteurs : Gorailchuk I. V. et al.
     Source : Virus Research

     Date de publication : 9 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

L’article passe en revue l’état des connaissances scientifiques et évoque les inconnues subsistant sur le caractère zoonotique du SARS-CoV-2 et les possibilités de transmission inverse du virus, c’est-à-dire de l’homme aux animaux.
 
     Auteurs : Wang L. et al.
     Source : The Innovation

    Date de publication : 7 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

A partir des séquences génomiques du SARS-CoV-2 disponibles dans le domaine public provenant d’isolats de visons ou de personnes obtenus au Danemark et aux Pays-Bas, les auteurs ont conduit des analyses phylogéniques qu’ils ont combinées à un système d’inférence statistique bayésienne au sein d’un modèle épidémiologique. Ils ont ainsi démontré que la transmission interhumaine du virus « vison » était bien survenue dans un certain nombre de cas.
 
     Auteurs : Rulli M. C. et al..
     Source : Nature Food

     Date de publication : 31 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs identifient les territoires du monde à risque élevé de transmission à l’Homme de coronavirus de type SARS en prenant en compte les données détaillées disponibles sur la couverture forestière, la répartition des zones céréalières, la densité du cheptel, la répartition de la population humaine et des espèces de chauves-souris ainsi que les modifications d’usage des zones où vivent les rhinolophes d’Asie.
 
     Auteur : Konishi T.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 26 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Discussion par l’auteur des différentes souches variantes du SARS-CoV-2 apparues chez les visons au Danemark et aux Pays-Bas, des mutations intervenues par comparaison aux souches humaines, et du caractère plus ou moins infectieux pour les êtres humains de ces souches isolées chez les visons.
 
     Auteur : Burkholz S. et al.
     Source : Infection, Genetics and Evolution

     Date de publication : 7 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Les auteurs examinent les mutations du génome du SARS-CoV-2 associées à sa transmission de l’Homme aux visons au Danemark, aux États-Unis et aux Pays-Bas et au retour du virus à l’Homme. Ils s’inquiètent des futurs virus mutants pouvant se propager entre espèces, ce qui peut avoir des conséquences importantes sur l’efficacité des vaccins et des thérapeutiques à base d’anticorps monoclonaux.
 
     Auteurs : Maurin M. et al..
     Source : Microorganisms

     Date de publication : 17 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)

Cet article résume les informations disponibles sur le volet zoonotique des infections par le SARS-CoV-2, les conditions optimales pour que celles-ci se produisent, le développement de la maladie chez les animaux à la suite d’une infection naturelle ou expérimentale, les réservoirs et hôtes intermédiaires animaux possibles, et les voies de transmission entre populations humaines et animales. Il soulève un certain nombre de questions quant à de nouveaux hôtes intermédiaires du virus, aux possibilités de zoonose inverse, à l’étendue de l’infection chez les animaux de compagnie, etc.

     Auteurs : OMS, OIE et PNUE
     Source : OMS

     Date de publication : 12 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 mai 2021)

L’objectif de ce document est de fournir aux autorités chargées de la sécurité sanitaire des aliments des lignes directrices en vue de réduire le risque de transmission de la COVID-19 et d’autres zoonoses à partir des marchés alimentaires traditionnels sur lesquels sont vendus des animaux sauvages vivants en vue de leur consommation.
 
     Auteur : Centers for Disease Control en Prevention (Etats-Unis)
     Source : Centers for Disease Control en Prevention

     Date de publication : 2 avril 2021 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Dans cette page du site internet, les CDC fournissent des recommandations sur les précautions à prendre par leurs détenteurs dès lors que des animaux de compagnie se révèlent atteints du virus responsable de la COVID-19 (animaux ayant simplement une sérologie positive ou bien malades). Ces précautions sont en particulier les mesures à mettre en place pour éviter la contamination d'autres animaux et celles destinées à éviter que les animaux domestiques atteints transmettent la maladie à l'Homme.

     Auteurs : Hoffmann M. et al.
     Source : Cell Reports

     Date de publication : 2 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 mai 2021)

Examen des différentes mutations du SARS-CoV-2 rencontrées fréquemment chez le vison, capacité de ces souches mutantes à entrer dans les cellules humaines, et évaluation du pouvoir d’inhibition de l’ACE2 soluble. La neutralisation par un anticorps autorisé pour le traitement de la COVID-19 ou par des sérums/plasmas provenant de patients convalescents s’avère réduite avec la mutation Y453F, ce qui suggère que ces thérapies sont inefficaces avec ce mutant.
 
     Auteurs : Bayarri-Olmos R. et al.
     Source : Journal of Biological Chemistry

     Date de publication : 11 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Les auteurs présentent des données sur le variant du SARS-CoV-2 dit « cluster 5 » apparu au Danemark dans des élevages de visons. Ils montrent que ce variant n’affecte pas le pouvoir inhibiteur de sérums provenant d’individus convalescents ni le pouvoir neutralisant de la réponse immunitaire obtenue chez la souris avec un vaccin faisant appel au spicule ou au domaine d’attachement de la souche virale originelle de Wuhan.
 
     Auteurs : Larsen H. D. et al.
     Source : Eurosurveillance

     Date de publication : 4 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Les auteurs décrivent les foyers de SARS-CoV-2 apparus au Danemark dans des élevages de visons ainsi que l’apparition d’une souche variante du virus chez ces animaux et de cas humains de COVID-19 dus à cette souche, ce qui a conduit le gouvernement à décider l’élimination complète des élevages de visons du pays.
 
     Auteur : Lee M.
     Source : National Collaborating Centre for Environmental Health (Canada)

     Date de publication : 2 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

La page Web fait le point sur les connaissances sur le SARS-CoV-2 et l’élevage du vison, notamment en matière de risque pour la santé publique et de transmission du virus à la faune sauvage.
 
     Auteur : Lee M.
     Source : National Collaborating Centre for Environmental Health (Canada)

     Date de publication : 2 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)

La page Web fait le point sur les connaissances en matière de SARS-CoV-2 et élevage du vison, notamment en matière de risque pour la santé publique et de transmission du virus à la faune sauvage.
 
     Auteur : ProMED, d’après le Guardian
     Source : ProMED

     Date de publication : 26 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Au vu des hypothèses sur l’origine de la COVID-19, les autorités de la République populaire de Chine ont décidé de compléter la législation nationale sur la santé animale selon trois axes principaux : classification des maladies animales en fonction des risques qu’elles font courir à la santé humaine ou de leur impact économique, mesures de quarantaine applicables aux animaux sauvages, et renforcement des capacités de surveillance et d’intervention sur le terrain.
 
     Auteur : ProMED
     Source : ProMED

     Date de publication : 24 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)

ProMED fait état de la découverte de coronavirus dans des crèmes glacées fabriquées dans un établissement de Tientsin (République populaire de Chine), conduisant les autorités du pays à rechercher les personnes ayant consommé ces produits. La page ProMED fait aussi le point sur ce qu’on sait de l’éventuelle transmission du SARS-CoV-2 via des aliments ou leurs emballages.
 
     Auteurs : FAO, OIE et OMS
     Source : FAO, OIE et OMS

     Date de publication : 20 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)

Il s’agit d’une évaluation conduite à l’initiative des trois organisations internationales sur les différents risques résultant de l’éventuelle présence du SARS-CoV-2 dans les élevages de visons européens, que ce soit dans le domaine socio-économique, en santé publique et sur la faune sauvage locale. Sont envisagés les différents volets de l’épidémiologie de la maladie dans ces élevages (introduction du virus, propagation, transmission à l’Homme ainsi qu’aux populations animales sauvages).
 
     Auteurs : Banerjee A. et al.
     Source : Cell Host & Microbe

     Date de publication : 13 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Les auteurs s’intéressent à la transmission possible de souches variantes du SARS-CoV-2 de l’Homme aux animaux, aux risques qui peuvent résulter de leur persistance dans la faune sauvage et à l’impact potentiel que cela peut avoir sur l’efficacité de la protection conférée par les vaccins.
 
     Auteur : Statens Serum Institut (Danemark)
     Source : ProMED

     Date de publication : 13 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Point sur l’évolution au Danemark des foyers de COVID-19 dans les élevages de visons ainsi que sur les cas humains en relation avec ces élevages, notamment dans les établissements qui ont traité les peaux des visons sacrifiés. Des informations sont aussi fournies sur les cas d’infection chez les chats vivant dans les élevages de visons et le statut des chats libres capturés aux alentours.
 
     Auteurs : Sooksawasdi Na Ayudhya S. et Kuiken T.  
     Source : Veterinary Pathology

     Date de publication : 9 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Les auteurs comparent la pandémie actuelle de COVID-19 avec la pandémie de grippe due au virus influenza H1N1 en 2009, cette comparaison pouvant aider à une meilleure appréciation des conséquences possibles de tels événements en matière de santé publique et de santé animale, notamment en ce qui concerne le franchissement de la barrière d’espèce, l’établissement d’un nouveau réservoir de virus, etc..
 
     Auteur : OMS  
     Source : OMS

     Date de publication : 3 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Point sur l’évolution au Danemark des foyers de COVID-19 dans les élevages de visons ainsi que des cas humains en relation avec ces élevages, et recommandations plus développées de l’OMS sur ce sujet.
 
     Auteurs : Académie nationale de médecine et Académie vétérinaire de France
     Source : Académie nationale de médecine et Académie vétérinaire de France

     Date de publication : 25 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les deux académies passent en revue les espèces animales sensibles au SARS-CoV-2 et émettent plusieurs recommandations sur les actions à mener en conséquence de l’apparition d’un virus mutant dans certains élevages de visons.
 
     Auteurs : Brugère-Picoux J. et al.
     Source : Académie nationale de médecine et Académie vétérinaire de France

     Date de publication : 24 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Examen des connaissances sur la sensibilité des animaux domestiques et sauvages vis-à-vis du SARS-CoV-2 et conséquences à en tirer en matière de santé publique.
 
     Auteur : Koopmans M.
     Source : The Lancet Infectious Diseases

     Date de publication : 20 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

L’auteur présente la problématique posée par l’apparition de souches mutantes du SARS-CoV-2 dans des élevages de visons au Danemark.
 
     Auteurs : Taylor C. A. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 19 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)

Cette étude conduite aux Etats-Unis tend à démontrer qu’en matière de COVID-19 les abattoirs ont un impact sur la propagation de la maladie qui va bien au-delà des établissements concernés et de leurs employés. Cet impact varie en fonction de plusieurs facteurs, tels que la taille de l’abattoir, la vitesse de la chaîne d’abattage, l’envergure de l’entreprise d’appartenance, etc.. 
 
     Auteurs : Hammer A. S. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 18 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Examen du génome et étude phylogénique des souches de SARS-CoV-2 isolées chez des visons de différents élevages au Danemark ainsi que des souches retrouvées chez des personnes à leur contact.
 
     Auteurs : van Dorp L. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Les auteurs se sont intéressés aux séquences du génome des souches de SARS-CoV-2 isolées chez le vison qui ont été publiées et y ont repéré des mutations récurrentes qui ne se retrouvent que rarement dans les souches de SARS-CoV-2 humaines, ce qui signifie une adaptation en cours du virus à l’espèce vison.
 
     Auteur : Lassaunière R. et al.
     Source : Statens Serum Institut (Danemark)

     Document accessible sur le Web depuis le : 16 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

L’étude examine les changements intervenus dans la composition en amino-acides de la glycoprotéine de spicule du SARS-CoV-2 dans les foyers de COVID-19 apparus dans les élevages de visons du Danemark ainsi que leur impact sur les caractéristiques antigéniques du virus.
 
     Auteur : Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de publication : 16 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

De l’avis des scientifiques, l’existence des souches mutantes du SARS-CoV-2 trouvées à ce jour chez les visons ne remettrait pas en question l’efficacité des vaccins.
 
     Auteur : Lesté-Lasserre C.
     Source : Science

     Date de publication : 13 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

L’auteur explicite les enjeux en matière de santé publique qui sous-tendent la décision prise par le gouvernement du Danemark d’éliminer tous les élevages de visons du pays à la suite de l’apparition en leur sein d’une souche mutante du SARS-CoV-2 (désormais appelée en anglais le ΔFVI-spike mutant).
.    
     Auteur : ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control)
    Source : ECDC

    Date de publication : 12 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

 L’évaluation de risque fait suite à la circulation d’une souche mutante particulière du SARS-CoV-2 chez des visons et des personnes au Danemark (« Cluster 5 »), qui se caractérise par des modifications marquées dans les domaines fonctionnels de la protéine de spicule, ce qui pourrait affecter les traitements, certaines épreuves de diagnostic et les caractéristiques antigéniques du virus.
 
     Auteurs :Oude Munnink B. B. et al.
    Source : Science

    Date de publication : 10 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Les recherches conduites dans 16 élevages de visons néerlandais, sur la base du séquençage complet du génome du SARS-CoV-2, sur les animaux et les personnes à leur contact, permettent aux auteurs de montrer ce qui s’est produit en matière de circulation du virus.
 
     Auteurs : Académie nationale de médecine et Académie vétérinaire de France
     Source : Académie nationale de médecine

     Date de publication : 5 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Alerte conjointe et recommandations émises par les deux académies à la suite de mutations problématiques du SARS-CoV-2 apparues dans cinq élevages danois de visons.
 
     Auteurs : Pang X. et al.
     Source : National Science Review

     Date de publication : 23 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les auteurs ont conduit une enquête épidémiologique pour déterminer l’origine d’une résurgence de la COVID-19 à Pékin en juin 2020 et ont conclu que des produits importés sous le régime du froid de pays à risque élevé de maladie et manipulés sur un grand marché local pouvaient en être responsables.
 
     Auteurs : Pang X. et al.
     Source : National Science Review

     Date de publication : 23 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les auteurs ont conduit une enquête épidémiologique pour déterminer l’origine d’une résurgence de la COVID-19 à Pékin en juin 2020 et ont conclu que des produits importés sous le régime du froid de pays à risque élevé de maladie et manipulés sur un grand marché local pouvaient en être responsables.
 
     Auteur : ANSES
     Source : ANSES

     Date de publication : 16 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Il s’agit d’un état des connaissances au 30 septembre 2020 sur le rôle éventuel des animaux dans la propagation de la COVID-19 : les coronavirus dans différentes espèces, positionnement phylogénique du SARS-CoV-2, réceptivité et sensibilité à ce virus de différentes espèces animales domestiques ou sauvages.
 
     Auteur : Gouvernement des Pays-Bas          
     Source : ProMED

     Date de publication : 14 septembre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 septembre 2020)  

Dans cette page de ProMED, le modérateur fournit une traduction en anglais des deux paragraphes intitulés « Santé publique » figurant dans la lettre adressée le 28 août 2020 par le Ministre de l’agriculture et celui de la santé au parlement des Pays-Bas sur les risques de transmission du SARS-CoV-2 aux êtres humains à partir des foyers apparus dans les élevages de visons.
 
     Auteur : International Commission on Microbiological Specifications for Foods (ICMSF)
     Source : International Commission on Microbiological Specifications for Foods (ICMSF)

     Date de publication : 3 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Cette commission internationale non-gouvernementale passe en revue les connaissances actuelles et conclut qu’il n’y pas à ce jour d’élément indiquant que les aliments, leurs emballages ou leur manipulation pourraient être une source ou une voie importante de dissémination du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : OIE et IUCN
     Source : OIE et IUCN

     Date de publication : 25 août 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2020)

Il s'agit de Recommandations faites en vue de diminuer le risque de transmission du virus de la COVID-19 de l'Homme aux mammifères sauvages.
 
     Auteur : Centers for Disease Control and Prevention (CDC, États-Unis)
     Source : Centers for Disease Control and Prevention

     Date de publication : 12 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Recommandations formulées par les CDC pour que les cliniques vétérinaires gèrent le risque posé par le SARS-CoV-2 dans leur pratique journalière.
 
     Auteur : OIE (Organisation mondiale de la santé animale)
     Source : OIE

     Date de publication : 29 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 août 2020)

Cette page du site Internet de l'OIE donne un aperçu des groupes de travail et groupes ad hoc mis en place par cette Organisation en réponse à l'émergence du SARS-CoV-2 ; elle résume les recommandations élaborées par son groupe de travail sur la faune sauvage en matière de commerce international des animaux sauvages en lien avec les maladies zoonotiques émergentes. En complément, l'OIE indique avoir lancé un programme ambitieux destiné à aider ses pays membres à gérer la santé de la faune sauvage, en vue de réduire et maîtriser les risques d'épisodes de transmission de maladies entre celle-ci, le bétail et l'Homme, tout en assurant la protection de la biodiversité.
 
     Auteurs : Ministère danois de l'environnement et de l'alimentation, site Web de l'administration danoise vétérinaire et alimentaire, AFP via Al Arabiya pour les Pays-Bas
     Source : ProMED

     Date de publication : 3 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)

L'OMS soupçonne une transmission du virus de l'animal à l'Homme chez deux travailleurs, dans un élevage de visons néerlandais. Sont également listées toutes les précautions sanitaires à prendre dans de tels élevages.
 
     Auteur : Commission européenne
     Source : Journal officiel de l’Union européenne

     Date de publication : 3 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)

Depuis 2000, une directive européenne (directive 2000/54/CE), régulièrement mise à jour, énonce des règles visant à protéger les travailleurs qui, du fait de leur activité professionnelle, sont exposés ou risquent d’être exposés à des agents biologiques (notamment dans l'agriculture, l'industrie agroalimentaire, les cliniques vétérinaires) ; elle indique les mesures à prendre pour toute activité susceptible de présenter un risque d’exposition à de tels agents, et pour déterminer la nature, le degré et la durée de l’exposition des travailleurs auxdits agents. La directive (UE) 2020/739 vient ajouter en urgence le SARS-CoV-2 à l’annexe III de la directive précitée, annexe qui dresse la liste des agents biologiques connus pour provoquer des maladies infectieuses chez l’Homme, classés selon leur niveau de risque d’infection.
 
     Auteurs : Bondad-Reantaso M. G. et al.  
     Source : Asian Fisheries Science

     Date de publication : 20 avril 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 octobre 2020)

L’article développe les arguments disponibles pour affirmer que la probabilité de contamination des animaux aquatiques et de leurs produits par le SARS-CoV-2 est négligeable.
 
     Auteur : ANSES
     Source : ANSES

     Date de publication : 14 avril 2020  - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)

Cet avis fait le point sur le rôle potentiel des animaux de compagnie, des animaux de rente et des aliments dans la transmission du SARS-CoV-2 (pas de preuve que les animaux domestiques jouent un rôle épidémiologique dans la diffusion du SARS-CoV-2).
 
    Auteur : Académie vétérinaire de France
    Source : Académie vétérinaire de France
    Date de publication : 2 avril 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 

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De nombreux articles de ce thème portent sur des sujets (développement de traitements ou de vaccins destinés à un usage dans la population humaine, etc.) qui s'éloignent des préoccupations des membres de l'AEEMA. Par suite, à partir du 22 février 2021, seuls les articles mentionnant l’emploi d’animaux de laboratoire et présentant de l'intérêt pour une meilleure connaissance de l'épidémiologie du SARS-CoV-2 ont été référencés dans ce thème.
 
 
 
     Auteurs : Blaurock C. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 20 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Les hamsters dorés étant utilisés en tant que modèle pour des recherches sur le SARS-CoV-2, les auteurs ont déterminé quel inoculum viral était optimal pour réaliser des infections expérimentales. Par ailleurs, sachant que des millions de hamsters dorés sont élevés en tant qu’animaux de compagnie, ils ont établi quelle dose infectieuse en culture cellulaire (DICT) était suffisante pour induire une excrétion virale chez les hamsters dorés ; ils ont constaté qu’elle était équivalente à la dose minimale infectieuse estimée chez l’être humain. Ils en tirent la conclusion que les hamsters dorés infectés par le SARS-CoV-2 pourraient constituer une source de contamination pour la population humaine. 
 
      Auteurs : Xu Y. et al.
      Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 13 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)

Les données de nature biochimique fournies par cette étude confirment la grande affinité des sous-variants BA.1 et BA.2 du variant Omicron du SARS-CoV-2 avec l’ACE2 de la souris et du chat, ce qui n’était le cas que pour le chat avec la souche originelle du virus. Pour ce qui est de la souris, trois mutations essentielles à cette affinité ont été repérées. Les auteurs en concluent que la souris pourrait jouer un rôle dans l’évolution du variant Omicron et de ses sous-variants. Ils imaginent un cycle épidémiologique hypothétique du virus passant de l’être humain au chat, du chat à la souris avec finalement un retour à l’être humain. 

     Auteurs : Mohandas S. et al.
     Source : eBioMedicine

    Date de publication : 8 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)

Étude du pouvoir pathogène, de la sévérité de la maladie et de la réponse immunitaire générée chez le hamster doré soumis à une épreuve virulente avec le variant Omicron du SARS-CoV-2, par comparaison avec une épreuve avec le variant Delta. A aussi été examiné le pouvoir neutralisant des sérums de hamsters dorés infectés par le variant Omicron sur d’autres variants préoccupants (Alpha, Bêta et Delta).

Characterisation and natural progression of SARS-CoV-2 infection in ferrets
     Auteurs : Au G. G. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 5 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 avril 2022)

Résultats de l’infection expérimentale de furets par une souche australienne de SARS-CoV-2 : suivi clinique, excrétion virale, lésions anatomo-pathologiques, etc. Des particules virales infectieuses n’ont été retrouvées que dans la sphère oro-pharyngée de ces animaux, pendant trois à sept jours après épreuve. 
 
     Auteurs : Thakur N. et al.
     Source : Journal of General Virology

     Date de publication : 4 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)

Par la technique du pseudotypage à l’aide d’un lentivirus, les auteurs examinent si l’émergence de différents variants préoccupants du SARS-CoV-2 a rendu possible son attachement au récepteur ACE2 d’espèces animales considérées jusque-là comme réfractaires à la souche originelle du virus. Cela s’avère être en particulier le cas pour différentes espèces (souris, rat, furet, civette) selon les variants étudiés. Les auteurs s’interrogent en conséquence sur la possible constitution de nouveaux réservoirs animaux du virus.
 
     Auteurs : Field C. J. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 25 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Cette expérience conduite avec des hamsters dorés démontre qu’après une première infection par le SARS-CoV-2, une immunité et une protection vis-à-vis d’une seconde épreuve s’installent chez ces animaux pour au moins six mois. Cependant, il peut s’avérer que dans de rares cas un sujet, qui possède pourtant des titres en anticorps aussi élevés que ses congénères, manifeste des symptômes de maladie avec multiplication virale dans son système respiratoire pouvant conduire à sa mort.
     Auteurs : Martins M. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

      Date de publication : 21 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Étude en laboratoire des caractéristiques de l’infection de jeunes cerfs de Virginie par le SARS-CoV-2 : période d’incubation, excrétion virale, transmission entre congénères, organes de multiplication du virus.
 
Reduced Pathogenicity of the SARS-CoV-2 Omicron Variant in Hamsters
     Auteurs : McMahan K. et al.
     Source : Med

     Date de publication : 17 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Les auteurs montrent que le variant Omicron est moins pathogène chez le hamster doré que la souche originelle et les variants précédents du SARS-CoV-2. La charge virale dans les cornets nasaux se révèle plus élevée qu’avec la souche originelle et moins élevée dans le parenchyme pulmonaire ; par ailleurs, les animaux ne perdent pas de poids. 
 
     Auteurs : Tabynov K. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 14 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Résultats obtenus dans la mise au point d’un vaccin à sous-unité dirigé contre le SARS-CoV-2, qui est destiné aux chats.
 
     Auteurs : Laghi V. et al.
     Source : Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

     Date de publication : 11 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Tentative d'infection de larves de poisson zèbre par le SARS-CoV-2. Ces larves s'avèrent réfractaires, si ce n'est au niveau de la vessie natatoire, où une augmentation modeste du titre en ARN viral est observée.
 
     Auteurs : Carossino M. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 5 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Les auteurs montrent que chez la souris de souche (humanisée) K18-hACE2, la létalité est systématiquement associée à une migration virale par le neuroépithélium olfactif ainsi qu’à la neuropathie qui en résulte, alors que l’inflammation pulmonaire reste modérée.
 
     Auteurs : Hansen F. et al.
     Source : Cell Reports

     Date de publication : 21 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 mars 2022)

Les auteurs ont utilisé le hamster doré comme modèle pour évaluer l’effet d’une réinfection avec la souche homologue WA1 (souche originelle) et les souches hétérologues B.1.1.7 (Alpha) et B.1.351 (Beta) du SARS-CoV-2. Dans chaque cas de réinfection, l’immunité conférée par l’infection primaire évite aux hamsters de manifester des signes cliniques ou de présenter des lésions pulmonaires, et aucune réplication virale ne se produit dans leur système respiratoire profond. Cependant, cette réinfection conduit à la réplication du virus dans le système respiratoire supérieur avec possibilité d’excrétion.
 
     Auteurs : Virtanen J. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)

Les auteurs indiquent que l’infection expérimentale de visons d’élevage avec le variant Omicron du SARS-CoV-2 provoque chez ces animaux des symptômes modérés et des lésions pulmonaires. Il est possible de détecter chez eux de l’ARN viral pendant plusieurs jours, et ils peuvent transmettre le variant à des congénères naïfs maintenus dans des cages situées à quelque distance d’eux. 
 
     Auteurs : Kapczynski D. R. et al.
     Source : Virology

     Date de publication : 12 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)

En vue d’établir un modèle prédictif sur la sensibilité de diverses espèces animales au SARS-CoV-2 à partir de cultures cellulaires, les auteurs ont exprimé les gènes de l’ACE2 et de la protéase TMPRSS2 de ces espèces dans des lignées de fibroblastes aviaires. Ils montrent que les résultats auxquels ils aboutissent sont en accord avec ceux obtenus par épreuves virales réalisées à ce jour chez le chat, le cheval, le porc, la chèvre et le hamster doré. Cela ouvre la voie à l’étude facilitée de la sensibilité au virus d’autres espèces.
 
     Auteurs : Armando F. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 1er février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 février 2022)

L’article confirme que le variant Omicron du SARS-CoV-2 a un pouvoir pathogène moindre que la souche originelle ou les variants préoccupants Delta et Gamma sur l’appareil respiratoire supérieur et inférieur du hamster doré.
 
     Auteurs : Abdelnabi R. et al.
     Source : Antiviral Research

     Date de publication : 21 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

En comparant chez le hamster doré le pouvoir infectieux du variant Omicron du SARS-CoV-2 à celui de la souche originelle de ce virus (D614G), il apparaît que la charge en ARN détectée dans les poumons avec le premier est inférieure de 3 log10 à celle mesurée avec le second. Aucune particule virale vivante du variant Omicron n’a été détectée dans ces poumons. En outre, aucune inflammation circumbronchique ni bronchopneumonie n’a été observée dans les poumons des hamsters inoculés avec le variant Omicron.
 
     Auteurs : Halfmann P. J. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 21 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Les expérimentations effectuées sur plusieurs souches de souris et de hamsters avec différents isolats du variant Omicron du SARS-CoV-2 ont conduit à une plus faible perte de poids, une charge virale moindre dans les tractus respiratoires supérieur et inférieur ainsi que des signes cliniques et des lésions moins marqués qu’avec les autres variants du virus.
 
     Auteurs : Speranza E. et al.
     Source : Life Science Alliance

     Date de publication : 17 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Expérimentation utilisant le macaque rhésus comme modèle pour caractériser la relation entre l’âge et les réponses immunitaires de l’hôte en cas d’infection par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Muñoz-Fontela C. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 13 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Dans cet article, le groupe d’experts sur la modélisation de la COVID-19 mis en place par l’OMS donne en particulier un avis sur l’utilisation des modèles animaux pour évaluer la virulence des variants du SARS-CoV-2, leur transmission ainsi que leur capacité à échapper aux défenses immunitaires.
 
     Auteurs : Kuiper M. J. et al.
     Source : ILAR Journal

     Date de publication : 12 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

En combinant modélisation biomoléculaire et données expérimentales disponibles, les auteurs cherchent à expliquer comment des mutations intervenues chez certains variants préoccupants du SARS-CoV-2 ont fait que les souris de laboratoire tout venant y sont devenues sensibles. Considérant le risque de créer par là un nouveau réservoir du virus, ils suggèrent d’exercer une surveillance sur le terrain, des souris dans des pays ou territoires où elles sont susceptibles de venir au contact de personnes hébergeant ces variants.
 
     Auteurs : Furuyama W. et al.
     Source : mBio

     Date de publication : 11 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Mise au point d’un vaccin ayant pour support le virus de la stomatite vésiculeuse et exprimant différentes protéines du SARS-CoV-2, et résultats obtenus après administration à des macaques rhésus par voie intramusculaire ou voie intranasale.
 
     Auteurs : Port J. R. et al.
     Source : Nature Microbiology

     Date de publication : 11 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Évaluation de l’efficacité de la transmission par aérosol du SARS-CoV-2 à différentes distances et en fonction du temps en utilisant des hamsters dorés maintenus dans des cages séparées mais reliées entre elles.
 
     Auteurs : Kim Y-I. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 10 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)

Après inoculation expérimentale du SARS-CoV-2, on retrouve chez les furets âgés (> 3 ans) une charge virale plus élevée, une excrétion virale plus durable par voie nasale et une inflammation plus sévère des tissus pulmonaires que chez les furets juvéniles (≤ 6 mois) et les jeunes adultes (1–2 ans). De plus, des furets naïfs contaminés par contact avec des sujets âgés infectés excrètent plus de particules virales que d’autres mis au contact de juvéniles ou de jeunes adultes infectés. 
 
     Auteurs : Bentley E. G. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 30 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)

Par comparaison aux infections expérimentales par la souche initiale apparue au Royaume-Uni (Pango B) et la souche Delta, les infections de souris humanisées (K18-hACE2) par le variant Omicron (B.1.1.529) du SARS-CoV-2 se traduisent par des signes cliniques atténués, une charge virale moindre dans le tractus respiratoire supérieur et inférieur et une évolution de la maladie vers la guérison. 
     Auteurs : Pan T. et al.
     Source : Signal Transduction and Targeted Therapy

     Date de publication : 14 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Les auteurs démontrent en laboratoire que le variant bêta du SARS-CoV-2 (B.1.351) est capable de se multiplier chez la souris commune et d’induire chez cet animal des lésions pulmonaires sévères ainsi qu’une intense réponse inflammatoire. En outre, les souris infectées par ce variant sont capables de le transmettre à des congénères par simple contact.
 
     Auteurs : Zeiss C. J. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 23 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

En utilisant le coronavirus responsable de la sialodacryoadénite du rat, les auteurs tentent de déduire dans quelle mesure la protection immunitaire conférée par une infection naturelle préalable ou bien la vaccination influe sur l'excrétion du SARS-CoV-2 et sa transmission à des congénères après une nouvelle exposition au virus. 
 
     Auteurs : Horiushi S. et al.
     Source : Science Immunology

     Date de publication : 26 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Les auteurs démontrent que l’infection de hamsters par le SARS-CoV-2 provoque une réponse immunitaire innée retardée mais solide par mobilisation de lymphocytes B et T. Ceux-ci, associés à une rapide génération d’anticorps neutralisants, permettent de maîtriser une réinfection avec la souche initiale ou un variant préoccupant chez les animaux guéris mais n’évitent pas une transmission du virus à des congénères naïfs ou séropositifs.  
 
     Auteurs : Ku M-W. et al.
     Source : EMBO Molecular Medicine

     Date de publication : 25 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Mise au point d’un vaccin à vecteur lentiviral codant pour la glycoprotéine de spicule de la souche originelle du SARS-CoV-2. Celui-ci assure une parfaite protection non seulement du tractus respiratoire mais aussi de l’encéphale de souris humanisées (hACE2) vis-à-vis de cette souche originelle du virus ainsi que du variant préoccupant Gamma (P.1).
 
An alphavirus replicon-based vaccine expressing a stabilized Spike antigen induces protective immunity and prevents transmission of SARS-CoV-2 between cats
     Auteurs : Langereis M. A. et al.
     Source : npj Vaccines

     Date de publication : 20 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Mise au point d’un candidat vaccin dirigé contre le SARS-CoV-2 pour administration au chat. Ce vaccin est dérivé d’une souche atténuée du virus de l’encéphalite équine vénézuélienne exprimant la protéine de spicule du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Hawks S. A. et al.
     Source : mBio

     Date de publication : 19 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

En utilisant le hamster comme modèle d’infection par le SARS-CoV-2, les auteurs démontrent que le virus est émis dans des particules d’aérosol avant et pendant l’apparition des premiers symptômes et que le virus est principalement contenu dans des particules d’une taille inférieure à 5 μm, taille qui leur permet de rester dans l’air et d’être inhalées. 
 
     Auteurs : Roozendaal R. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 7 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Efficacité de long terme chez le macaque rhésus d’un vaccin unidose utilisant comme vecteur un adénovirus et codant pour la protéine de spicule du SARS-CoV-2. Ce vaccin confère chez ces animaux une protection solide des voies respiratoires profondes, sans toutefois éviter une certaine réplication du virus dans les voies respiratoires supérieures. 
 
     Auteurs : Wu X. et al.
     Source : Cell Reports

     Date de publication : 5 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Après avoir vacciné un alpaca avec la protéine de spicule du SARS-CoV-2, les auteurs ont récupéré et assemblé des nanoparticules ayant un pouvoir de neutralisation du virus qui, administrées par voie intranasale à des souris hACE2, leur ont conféré une protection totale contre l’infection. Jusqu’à cet article, l’efficacité de telles nanoparticules n’avait été montrée qu’in vitro. 
 
     Auteurs : Abdelnabi R. et al.
     Source : EBioMedicine

     Date de publication : 23 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Démonstration de l’effet antiviral obtenu grâce à la combinaison de deux médicaments (Molnupiravir et Favipiravir) administrés au hamster doré utilisé comme modèle lorsque celui-ci est infecté par le SARS-CoV-2. En outre ce traitement prévient presque complètement toute transmission du virus à des congénères utilisés comme sentinelles.
 
     Auteurs : Valkenburg S. A. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 23 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont étudié la cinétique de survie du SARS-CoV-2 chez des souris transgéniques (K18 hACE2) après leur mort et montré qu’en cinq jours la présence du virus infectieux déclinait de plus de 96 % dans le poumon et celle d’exemplaires de l’ARN de plus de 48 %. 
 
     Auteurs : Chandrashekar A. et al.
     Source : Science Translational Medicine

     Date de publication : 21 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

 Cette étude montre que l’immunité naturelle conférée chez des macaques rhésus par la souche originelle du SARS-CoV-2 (souche de Wuhan ou WA1/2020) ne confère qu’une protection incomplète contre les variants B.1.1.7 (alpha) et B.1.351 (bêta).
 
     Auteurs : Bewley K. R. et al.
     Source : Science Advances

     Date de publication : 10 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Recherches visant à montrer l’absence d’accident de vaccination se traduisant par une facilitation de l'infection, tel qu’il s’en produit avec le SARS-CoV-1 et le MERS, en testant chez le furet et le macaque rhésus un vaccin à virus inactivé et adjuvé dirigé contre le SARS-CoV-2. 
 
     Auteurs :Tostanoski L. H. et al.
     Source : Science Translational Medicine

    Date de publication : 7 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs montrent que l’infection de hamsters dorés par la souche WA1/2020 protège ceux-ci d’une épreuve virulente ultérieure avec des souches hétérologues du SARS-CoV-2. Cette même protection est obtenue quand les hamsters reçoivent le vaccin Ad.26.COV2.S (vaccin à adénovirus sérotype 26) avant épreuve virulente.
 
     Auteurs : Port J. R. et al.
     Source : Nature Communications

    Date de publication : 17 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Comparaison chez le hamster doré de l’effet de différentes voies d’exposition au SARS-CoV-2 (par inoculation intranasale, aérosol, supports inanimés) en matière de pathologie respiratoire, de charge virale, de perte de poids et d’excrétion virale.
 
      Auteurs : Martins M. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Effet de l’âge sur la sensibilité au SARS-CoV-2 du furet utilisé comme modèle, en comparant excrétion virale et séroconversion chez des animaux recevant une inoculation par voie intranasale à l’âge de 6 mois ou bien à 18 - 39 mois.
 
     Auteurs : Huang H. et al.
     Source : Cell Death & Differentiation

     Date de publication : 13 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs s’inquiètent du fait que les variants du SARS-CoV-2 dont la protéine de spicule porte la mutation N501Y peuvent infecter les cellules de souris dotées du récepteur ACE2 normal (et non du récepteur humain hACE2). Ces résultats, convergents avec ceux d’autres chercheurs, leur font craindre que les souris puissent jouer un rôle dans la propagation chez l’Homme des variants préoccupants portant cette mutation. 
 
     Auteurs : Nouailles G. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 11 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Il s’agit d’analyses spatio-temporelles des processus cellulaires et moléculaires en jeu au niveau pulmonaire chez le hamster doré infecté par le SARS-CoV-2, qui, lorsqu’on les compare à des jeux de données provenant de patients atteints de la COVID-19, montrent une remarquable concordance de ces processus entre les deux espèces. 
 
     Auteurs : Shang C. et al.
     Source : Frontiers in Microbiology

    Date de publication : 10 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Les auteurs ont évalué chez les hamsters dorés l’impact d’une première infection par le SARS-CoV-2 sur leur protection ultérieure vis-à-vis de ce virus et leur capacité à le transmettre à leurs congénères. Leurs recherches montrent notamment que ces animaux restent réceptifs au virus et sont capables par contact direct d’infecter des hamsters naïfs.
 
     Auteurs : Bessière P. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 9 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Démonstration de l’efficacité chez le hamster doré d’un traitement par interféron juste avant ou juste après l’infection par le SARS-CoV-2, et de l’inefficacité de ce traitement dès l’apparition des premiers symptômes de la maladie.
 
     Auteurs : Cao X. et al.
     Source : The FASEB Journal

     Date de publication : 8 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Après avoir fabriqué un lentivirus doté à sa surface du tropisme de la protéine de spicule du SARS-CoV-2, les auteurs montrent que, chez une lignée de souris (type sauvage C57BL/6J), cette protéine peut, à elle seule, avoir un effet pathogène sur les cellules, notamment en induisant une réaction inflammatoire aiguë.
 
     Auteurs : Zabaleta N. et al.
     Source : Cell Host & Microbe

     Date de publication : 7 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Démonstration de l’immunité conférée chez les souris de souches BALB/C et C57BL/6 et des macaques rhésus après administration d’une seule dose de deux candidats vaccins à adénovirus exprimant divers antigènes du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Rudd J. M. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 5 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

 Cet article rapporte la mise au point d'un modèle chat pour l'étude de l'infection par le SARS-CoV-2 : l'administration à cet animal d'un inoculum important par voie intratrachéale conduit à l'apparition de symptômes et de lésions histopathologiques similaires à ce qu'on observe dans les cas humains sévères de COVID-19.
 
     Auteurs : Park J-G. et al.
     Source : iScience

     Date de publication : 3 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Résultats obtenus grâce à l’administration par voie intranasale à des souris et des hamsters d’un vaccin vivant préparé avec le virus de la maladie de Newcastle exprimant la protéine de spicule du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : van Doremalen N. et al.
     Source : Science Translational Medicine

     Date de publication : 27 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Résultat de l’administration du vaccin ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222 par voie intranasale à des hamsters dorés et des macaques rhésus sur l’excrétion du SARS-CoV-2 (souche mutante D614G).
 
     Auteurs : Lee J. S. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 27 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Evolution des caractéristiques des populations de macrophages présents dans les liquides de lavage broncho-alvéolaire des poumons de furets infectés expérimentalement par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Malherbe D. C. et al.
     Source : npj Vaccines

     Date de publication : 22 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Efficacité chez le hamster doré d’un vaccin unidose utilisant le virus de la stomatite vésiculeuse comme vecteur et exprimant la sous-unité S1 de la protéine de spicule du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Wu Y. et al.
     Source : Science Translational Medicine

     Date de publication : 20 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Les auteurs considèrent ce candidat vaccin comme très prometteur car, après deux ou trois injections, il a généré de hauts titres en anticorps chez les souris, les hamsters et les primates non-humains. En outre, les hamsters vaccinés n’ont subi aucune perte pondérale et n’ont manifesté aucun symptôme de COVID-19 après épreuve virulente.
 
     Auteurs : Francis M. E. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 15 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Les auteurs ont évalué l’effet de l’âge et du sexe chez des furets infectés par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Dias de Melo G. et al.
     Source : EMBO Molecular Medicine

     Date de publication : 12 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Évaluation des effets de l’ivermectine chez des hamsters dorés auxquels a été inoculé le SARS-CoV-2 par voie intranasale. Sans effet sur la charge virale, cette molécule semble néanmoins prometteuse car il a été observé une atténuation marquée des symptômes de la maladie.
 
     Auteurs : Dampalla C. S. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 1er juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Des souris de souche K18-hACE2 infectées à dose létale par le SARS-CoV-2 survivent de façon prolongée lorsqu’elles sont traitées à l’aide de dérivés d’un inhibiteur du virus appelé GC376 qui ont été chargés en deutérium.
 
     Auteurs : Bricker T. L. et al.
     Source : Cell Reports

     Date de publication : 28 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Protection conférée par un vaccin à adénovirus du chimpanzé codant pour la protéine de spicule du SARS-CoV-2 administré par voie intranasale ou intramusculaire au hamster doré.
 
     Auteurs : Li D. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 18 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Par épreuve virale chez la souris et des primates non-humains, les auteurs montrent que des anticorps humains dirigés contre des parties différentes de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 peuvent être protecteurs chez ces animaux alors que des évaluations in vitro laissent penser que certains de ces anticorps favorisent l’expression de la maladie.
 
     Auteurs : Yinda C. K. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 14 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 juin 2021)

Des hamsters infectés une première fois en utilisant un aérosol avec une souche humaine du SARS-CoV-2 (celle circulant classiquement dans la population humaine aux Etats-Unis) peuvent être réinfectés avec la souche B.1.351 (dite sud-africaine) ; les signes cliniques restent alors modérés, sans lésion pulmonaire, l’excrétion virale est seulement transitoire, et ces hamsters ne transmettent pas le virus à des congénères.
 
     Auteurs : Zhang C. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 11 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 juin 2021)

Étude de la taille des particules d’aérosol contenant le SARS-CoV-2 et de la durée d’excrétion du virus chez des macaques crabiers infectés expérimentalement par différentes voies.
 
     Auteurs : Aicher S-M. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 31 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Après avoir mis au point des lignées cellulaires provenant de plusieurs espèces de chauves-souris d’intérêt pour la recherche sur les coronavirus, les auteurs montrent l’impossibilité de les infecter avec le SARS-CoV-2, même si elles expriment un niveau détectable d’ACE2. Si l’entrée du virus dans des cellules de chauves-souris de lignées « humanisées » est possible, celui-ci ne peut pas s’y multiplier.
 
     Auteurs : He X. et al.  
     Source : Cell

     Date de publication : 31 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Ayant démontré précédemment la protection du vaccin Ad26.COV2.S chez le macaque rhésus (voir Mercado N. B. et al, Nature, 30 juillet 2020), les auteurs ont évalué le pouvoir immunogène et la protection apportée par des doses réduites de ce vaccin dans cette même espèce. Ils constatent que, pour protéger le tractus respiratoire supérieur des animaux, il convient d’utiliser une dose plus élevée que pour la protection du tractus respiratoire profond.
 
     Auteurs : Gultom M. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 26 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Utilisation d’une banque de cellules épithéliales des voies respiratoires à l’état différencié provenant de différentes espèces d’animaux domestiques ou sauvages pour évaluer leur sensibilité au SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Tian J. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 23 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Un traitement par l’acide γ-aminobutyrique (GABA) chez la souris réduit la charge virale dans leurs poumons, limitant ainsi les dommages causés par l’infection par le SARS-CoV-2, ce qui conduit à envisager un nouveau type de traitement qui viserait les récepteurs de GABA des cellules immunitaires et de l’épithélium pulmonaire pour y limiter la réplication virale.
 
     Auteur : Spencer A. J. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 17 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

 Données détaillées sur la réponse immunitaire obtenue chez la souris après vaccination contre le SARS-CoV-2 à l’aide d’un vaccin à auto-amplification de l’ARN ou un vaccin ayant pour vecteur un adénovirus.
 
     Auteurs : Tiboni M. et al.
     Source : International Journal of Pharmaceutics

     Date de publication : 6 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Revue générale des vaccins contre le SARS-CoV-2 actuellement disponibles ou en cours de développement. Cette revue met en particulier l’accent sur les avantages et inconvénients de ceux administrables par voie nasale, avec les résultats obtenus lors des essais sur animaux.
 
    Auteur : Rosselkhoznadzor (Service fédéral pour la surveillance vétérinaire et phytosanitaire de Russie)
     Source : Rosselkhoznadzor

     Date de publication : 30 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Fabrication en Russie d’un vaccin contre le SARS-CoV-2, dénommé Carnivac-CoV, pour un usage chez les animaux. 
  
     Auteurs : Solforosi L. et al.
     Source : Journal of Experimental Medicine

     Date de publication : 28 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Évaluation comparée de l’immunité obtenue après administration du vaccin Ad26.COV2.S avec ou sans seconde injection chez des macaques rhésus dans la force de l’âge ou bien âgés.
 
     Auteurs : Noy-Porat T. et al.
     Source : iScience

     Date de publication : 26 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Efficacité chez la souris de souche hACE2 d’anticorps monoclonaux d’origine humaine ciblant trois épitopes distincts du domaine N-terminal de la sous-unité S1 de la protéine de spicule du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Arunachalam P. S. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 19 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Démonstration de l’efficacité chez des primates non-humains d’un vaccin adjuvé sous-unitaire comprenant le domaine de liaison de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 exprimé sur une nanoparticule protéique à deux composantes.
 
     Auteurs : Sun Y. J. et al.
     Source : The Journal of Clinical Investigation

     Date de publication : 12 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

L’avoralstat inhibe l’entrée et la réplication du SARS-CoV-2 dans les cellules épithéliales du système respiratoire de l’Homme. Cette molécule utilisée en tant que traitement chez des souris sensibles au virus réduit significativement les titres viraux dans leurs tissus pulmonaires et limite leur perte de poids, indiquant qu’elle pourrait être utilisée dans le traitement de la COVID-19 chez l’Homme.

     Auteurs : Patel D. R. et al.
     Source : Journal of Virology

     Date de publication : 7 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)

L’article montre que les contacts directs entre furets constituent la voie principale de transmission d’une souche de référence du SARS-CoV-2 aux USA, que ces animaux sont protégés d’une réinfection pendant au moins 56 jours, même quand leurs niveaux d’anticorps sont faibles ou indétectables, et que leur vaccination par voie intramusculaire conduit bien à la production d’anticorps mais n’empêche pas l’infection de leurs voies respiratoires supérieures.
 
     Auteurs : Brustolin M. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 7 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)

L’article montre qu’une première infection par le SARS-CoV-2 du hamster soumis à une nouvelle épreuve avec le virus originel ou le mutant D614 ne confère pas une immunité complète chez cet animal, une réplication virale se produisant dans ses voies respiratoires supérieures sans que survienne une pneumopathie.
 
     Auteurs : Ho J. S. Y. et al.  
     Source : Cell

     Date de publication : 31 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Essai, chez la souche de souris transgénique hACE2 et le hamster doré, d’un médicament déjà approuvé par la FDA pour son effet inhibiteur de la topoisomérase 1, facteur connu pour activer certains gènes en cas d’infection par des virus ou des bactéries, en vue de supprimer l’effet létal résultant de la cascade inflammatoire induite par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Jia Q. et al.
     Source : npj Vaccines

     Date de publication : 30 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Essai d’un vaccin bactérien atténué (dérivé de l’agent responsable de la tularémie et utilisé pour la vaccination contre plusieurs maladies) exprimant des protéines de structure du SARS-CoV-2, et évaluation de son efficacité chez le hamster doré.
 
     Auteurs : De Gasparo R. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 25 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Mise au point par simulations informatiques d’une molécule bispécifique de type IgG1 fabriquée à partir de deux anticorps obtenus à partir de personnes atteintes par la COVID-19 en convalescence, qui s’avère protectrice dans un nouveau modèle de souris humanisée et prévient tout processus d’échappement viral.
 
     Auteurs : Kurup D. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 25 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Développement d’un vaccin contre le SARS-CoV-2 ayant pour vecteur le virus rabique inactivé et résultats après épreuve chez le hamster.
 
     Auteurs : Ren W. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 24 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)

Les auteurs s’intéressent aux déterminants génétiques qui sous-tendent la capacité des orthologues de l’ACE2 à permettre l’entrée du SARS-CoV-2 dans les cellules, en comparant les séquences de l’ACE2 du koala et de la souris à celles de l’Homme et en identifiant les résidus clés chez ces animaux qui empêchent le virus de s’attacher.
 
     Auteur : Liu R. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 23 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Essai chez la souche de souris hACE d’un vaccin recombinant préparé à l’aide du virus de la vaccine exprimant la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et administré en deux injections.
 
     Auteurs : Klasse P. J. et al.
     Source : Science Advances

     Date de publication : 19 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

Revue des données actuellement disponibles sur le pouvoir immunogène (anticorps, cellules T) conféré chez les primates non humains par les vaccins COVID-19 actuellement soumis à essais cliniques de phase 1, 2 ou 3 ainsi que sur les résultats obtenus après épreuve virale chez des macaques immunisés.
 
     Auteurs : van der Lubbe J. E. M. et al.
     Source : npj Vaccines

     Date de publication : 19 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Les auteurs confirment que le candidat vaccin Ad26.COV2.S est efficace pour protéger le hamster d’une infection intranasale par le mutant G614 du SARS-CoV-2 et confirment l’absence d’effet de facilitation de l’infection respiratoire.  
 
     Auteurs : Montagutelli X. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 18 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

Si les souris de laboratoire classiques sont résistantes aux lignées du SARS-CoV-2 qui prévalent actuellement (celles classées B1 qui portent la mutation D614G ou la B.1.1.7), elles s'avèrent sensibles aux lignées dites préoccupantes (variants of concern (VOC) : B.1.351 et P.1) lorsqu'elles sont soumises à épreuve virulente par voie intranasale, conduisant à retrouver des titres viraux élevés dans leurs poumons. L'explication de cette situation se trouverait au moins en partie dans des modifications intervenant au sein du domaine d'attachement au récepteur cellulaire de la protéine de spicule du virus.
 
     Auteurs : Hassan A. O. et al.
     Source : Cell Reports Medicine

     Date de publication : 17 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Après avoir démontré son efficacité chez la souris (voir Hassan A. O. et al., Cell, 19 août 2020), les auteurs montrent l’efficacité chez le macaque rhésus du vaccin dirigé contre le SARS-CoV-2 utilisant comme vecteur un adénovirus du chimpanzé qu’ils ont conçu.
 
     Auteurs : Bashor L. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 9 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)

L'étude s'intéresse aux variants d'une souche humaine d'origine américaine du SARS-CoV-2 qui apparaissent après trois passages en culture cellulaire, ainsi qu'aux modifications génétiques intervenant dans ces variants après infection expérimentale de chiens, chats, hamsters et furets.
 
     Auteurs : Kim Y-I. et al.
     Source : mBio

     Date de publication : 2 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)

Mise au point d’un candidat vaccin à nanoparticules de ferritines liées au domaine de liaison de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et résultats obtenus par épreuve chez le furet. Ces ferritines, obtenues par ingénierie, consistent dans le cas présent en l’auto-assemblage d’une sous-unité de ferritine de la grenouille taureau (Rana Catesbeiana) avec le noyau de la ferritine de Helicobacter pilori.
 
     Auteurs : Sahakijpijarn S. et al.
     Source : International Journal of Pharmaceutics: X

     Date de publication : 27 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Meilleure efficacité, par comparaison à une administration intraveineuse, du remdesivir pour traiter l’atteinte pulmonaire due à l’infection par le SARS-CoV-2 chez le hamster lorsque le produit se présente sous forme de poudre à inhaler préparée en utilisant un système de congélation en couche mince.
 
     Auteurs : de Vries R. D. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 17 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Les chercheurs ont conçu un inhibiteur (dimère lipopeptidique) qui bloque la fusion entre la membrane des cellules de l’hôte et l’enveloppe du SARS-CoV-2. Ils montrent que cet inhibiteur empêche totalement la transmission directe du virus entre furets sains traités et furets infectés mis en présence les uns des autres durant 24h.
 
     Auteurs : Cohen A. A. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 12 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)

Les auteurs ont mis au point deux types de vaccins à base de nanoparticules exprimant, pour l’un, le domaine de liaison au récepteur cellulaire du SARS-CoV-2 et, pour l’autre, ce domaine, ainsi que celui d’autres béta-coronavirus animaux potentiellement zoonotiques ; puis ils ont examiné le résultat obtenu par vaccination de souris transgéniques.
 
     Auteurs : Wang W. et al.
     Source : Cellular & Molecular Immunology

     Date de publication : 12 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Les auteurs rapportent avoir mis au point un vaccin contre le SARS-CoV-2, ayant pour support des nanoparticules de ferritine, qui induit une immunité de longue durée chez la souris.
 
     Auteurs : Wahl A. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 9 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

En utilisant des souris immunodéficientes chez lesquelles du tissu pulmonaire humain a été greffé, les auteurs montrent notamment que le SARS-CoV-2 ainsi que deux coronavirus de chauves-souris qui en sont proches peuvent se répliquer dans ledit tissu sans nécessiter aucune adaptation, ce qui indique selon eux que les chauves-souris hébergent des coronavirus directement transmissibles à l’Homme.
 
     Auteurs : Biswas R. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 8 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)

Evaluation de l’efficacité thérapeutique chez la souris hACE2 infectée par le SARS-CoV-2 d’un dérivé d’une protéine jouant un rôle dans la régulation de la croissance et la différentiation cellulaire (NELL1). Ce traitement améliore significativement l’état de santé ainsi que le taux de survie des souris soumises à épreuve virale.
 
     Auteurs : Liu X. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 7 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Bons résultats obtenus chez la souris avec des vaccins à nanoparticules de ferritine codant pour différentes portions de la protéine de spicule du SARS-CoV-2. La possibilité de leur administration par voie non seulement sous-cutanée mais aussi orale ouvre, selon les auteurs, des perspectives en matière de vaccination des animaux domestiques ou sauvages.
 
     Auteurs : Yan V. C. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 5 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Bien que la FDA ait autorisé le remdesivir pour le traitement de la COVID-19, les auteurs montrent par des études de biodisponibilité et de concentration plasmatique conduites chez des chiens beagle que l’administration de son nucléoside parent (appelé GS-441524) permettrait d’obtenir une meilleure efficacité.
 
     Auteurs : Ye Z-W. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 4 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Chez le hamster doré infecté par le SARS-CoV-2, l’administration combinée de méthylprednisolone et de remdesivir prévient la perte de poids ainsi que la charge virale, la seconde molécule atténuant l’effet immunodépresseur de la première.
 
     Auteurs : Yadav P. D. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 3 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Efficacité chez le macaque rhésus d’un vaccin à ADN plasmidique codant pour la composante antigénique immunogène du SARS-CoV-2. Les résultats de la vaccination s’avèrent meilleurs avec un système d’administration sans aiguille par comparaison à une injection à l’aide d’une seringue à aiguille.
 
     Auteurs : Johnston S. C. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 2 février 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)

Évaluation comparée de la transmission par voie aérienne de la COVID-19 chez le singe vert, le macaque rhésus et le macaque crabier, afin de déterminer les paramètres critiques associés à sa pathogénie et d’établir le modèle primate le plus proche de la maladie chez l’Homme.
 
     Auteurs : Vogel A. B. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 1er février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Les auteurs décrivent les résultats favorables obtenus chez la souris et le macaque rhésus en utilisant deux candidats vaccins contenant des antigènes dérivés de l’ARN messager codant la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et présentés sous forme de nanoparticules lipidiques.
 
     Auteurs : Speranza E. et al.
     Source : Science Translational Medicine

     Date de publication : 27 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 février 2021)

Par des techniques biomoléculaires (séquençage unicellulaire de l’ARN) et l’immunohistopathologie, les auteurs montrent notamment que dans les poumons des singes verts le SARS-CoV-2 se multiplie principalement dans les pneumocytes et que ce sont des macrophages dérivés de monocytes interstitiels plutôt que des macrophages alvéolaires qui pilotent la réponse inflammatoire dans les poumons. Ceci ouvre des perspectives pour déterminer des cibles thérapeutiques
 
     Auteurs : Dey A. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 février 2021)

Mise au point d’un candidat vaccin à ADN plasmidique codant pour la protéine de spicule du SARS-CoV-2. Administré par voie intradermique. Son pouvoir immunogène a été évalué chez la souris, le cobaye et le lapin et des études toxicologiques ont été conduites chez le rat et le lapin.
 
     Auteurs : Brocato R. L. et al.  
     Source : npj Vaccines

     Date de publication : 25 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Mesure de l’efficacité d’un vaccin à ADN fondé sur la protéine de spicule du SARS-CoV-2 testé sur des hamsters dorés de type sauvage et d’autres ayant reçu transitoirement un traitement immunosuppresseur.
 
     Auteurs : Brouwer P. J. M. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 25 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Essai d’un vaccin à nanoparticules exprimant de multiples copies de la protéine de spicule du SARS-CoV-2. Les études d’immunité montrent qu’il induit la production d’anticorps neutralisants efficaces chez la souris, le lapin et le macaque crabier.
 
     Auteurs : De Gasparo R. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 22 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)

Mise au point par simulations informatiques d’une molécule bispécifique de type IgG1 fabriquée à partir de deux anticorps obtenus à partir de personnes atteintes par la COVID-19 en convalescence, qui s’avère protectrice dans un nouveau modèle de souris humanisée et prévient tout processus d’échappement viral.
 
     Auteurs : Kumari P. et al.  
     Source : Viruses

     Date de publication : 19 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Description de la pathogénicité du SARS-CoV-2 dans le système nerveux central de la souris transgénique K18-hACE2, avec description des voies plausibles de migration du virus après infection intranasale.
 
     Auteurs : Yinda C. K. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 19 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Les auteurs montrent que chez la souris de souche hACE2, l’expression de l’infection par le SARS-CoV-2 est dose-dépendante et cliniquement très proche de celle de la COVID-19 chez l’Homme. Ce modèle peut donc aider à mieux connaître la pathogénie de la COVID-19 ainsi qu’à tester de nouveaux traitements.
 
     Auteurs : Jan J-T. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 15 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Après avoir identifié par différentes techniques 15 petites molécules à activité anti-infectieuse vis-à-vis du SARS-CoV-2 parmi près de 3 000 agents utilisés en médecine humaine ou animale (dont 190 herbes de la médecine traditionnelle chinoise), les auteurs montrent, par épreuve chez le hamster doré, que la méfloquine, le nelfinavir, et des extraits du ganoderme luisant (Ganoderma lucidum), de la pérille (Perilla frutescens) et de la menthe chinoise (Mentha haplocalyx) sont efficaces contre l’infection.

     Auteurs : Nishikawa T. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 14 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)

Essai chez le rat et la souris d’un vaccin à ADN plasmidique exprimant la protéine de spicule du SARS-CoV-2, administré par voie intradermique.
 
     Auteurs : García-Arriaza J. et al.
     Source : Journal of Virology

     Date de publication : 7 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Développement d’un vaccin contre la COVID-19 fondé sur le virus de la vaccine exprimant la protéine de spicule entière du SARS-CoV-2 et immunité obtenue chez des souris de souche K18-hACE2.
 
     Auteurs : Marsh G. A. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 5 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Cet article australien comprend une partie relative aux effets de l’infection expérimentale de deux furets par une souche de SARS-CoV-2 obtenue après un passage en culture cellulaire d’un isolat provenant d’un citoyen chinois venu de Wuhan (Rép. pop. de Chine) au tout début de l’épidémie. Les résultats obtenus avec ces furets sont semblables à ceux d’autres expérimentations de même nature (absence de symptômes, multiplication du virus dans les voies nasales, etc.).
 
     Auteurs : Xue X. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 25 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

Une perte d’audition importante ayant été constatée chez certaines personnes atteintes par la COVID-19, les auteurs se sont intéressés aux dommages causés par le SARS-CoV-2 sur le système auditif en utilisant comme modèles la souris et le hamster.
 
     Auteurs : Rauch S. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 23 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

Conception d’un vaccin à ARN messager dont les nucléotides n’ont pas été modifiés chimiquement (avantage : permettre une administration à faible dose), qui induit une solide réponse immunitaire et cellulaire chez des primates non-humains.
 
     Auteur : U.S. Department of Health & Human Services - NIH Accelerating COVID-19 Therapeutic Interventions and Vaccines (ACTIV) Preclinical Working Group
     Source : U.S. Department of Health & Human Services - National Institutes of Health

     Date de publication : 23 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Il s’agit d’un portail donnant accès à des lignes directrices et des vidéos sur les meilleures pratiques à utiliser en matière de modèles animaux pour la recherche sur la COVID-19.
 
     Auteurs : Baisa G. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 21 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

Conception de vaccins préparés à partir d’antigènes issus de deux régions distinctes de la sous-unité S1 du spicule du SARS-CoV-2 fusionnés au domaine Fc d’IgG1 d’origine humaine. Celui des vaccins contenant le domaine de liaison viral au récepteur cellulaire ACE2 génère une activité de neutralisation du virus chez le macaque crabier qui s’avère efficace, durable et bien plus élevée que chez l’individu convalescent.

     Auteurs : Hou Y. J. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 18 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)

La comparaison du nouveau variant du SARS-CoV-2 (contenant la mutation D614G) à sa forme ancestrale apparue à Wuhan (R. P. de Chine) dans les cellules humaines et dans deux modèles animaux (souris de souche hACE2, hamster doré) montre une très faible modification de virulence du virus chez ces animaux, et une plus grande transmissibilité entre personnes plutôt qu’une plus grande pathogénicité du virus.
 
     Auteurs : Singh D. K. et al.
     Source : Nature Microbiology

     Date de publication : 18 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

La détresse respiratoire aiguë provoquée par le SARS-CoV-2 chez les macaques et les babouins est en correspondance avec la progression de la COVID-19 chez l’être humain, ce qui fait de ces animaux des modèles intéressants pour tester des vaccins et des médicaments.
 
     Auteurs : Xiang Y. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 18 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)

Production de nano-anticorps qui bloquent avec une remarquable efficacité la protéine S du SARS-CoV-2 dans une conformation inactive. Ces nano-anticorps présentent l’avantage de pouvoir être produits à faible coût et administrables par inhalation, ce qui en fait des agents thérapeutiques potentiels intéressants pour traiter les maladies virales à tropisme respiratoire.
 
     Auteurs : Soni D. K. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 17 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)

Les auteurs ont analysé le rôle d’un micro-ARN (miR-155) dans les réponses immunitaire et inflammatoire chez l’hôte infecté par le SARS-CoV-2, puis ont étudié l’effet potentiel d’une thérapie anti-miR-155 chez la souris transgénique hACE2. Les résultats obtenus permettent d’envisager la mise au point d’un traitement visant à atténuer la tempête inflammatoire se produisant dans les poumons de sujets infectés.
 
     Auteurs : Hassert M. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 16 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 janvier 2021)

Utilisation d’une nouvelle méthode pour faire exprimer le récepteur ACE2 humain chez la souris, qui a permis de caractériser la réponse immunitaire au SARS-CoV-2 chez la souris, en particulier en ce qui concerne les épitopes fonctionnels des cellules T. Les auteurs considèrent cette information comme essentielle, notamment pour l’évaluation de vaccins.
 
     Auteurs : Ku M-W. et al.
     Source : Cell Host & Microbe

     Date de publication : 14 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)

Résultats d’essais menés dans deux modèles pré-cliniques (souris, hamster) d’un candidat vaccin contre la COVID-19, utilisant un vecteur lentiviral, administrable par voie nasale. L’étude montre que ce candidat vaccin induit de fortes réponses de type anticorps, neutralisant très efficacement le SARS-CoV-2, ainsi qu’une réponse cellulaire abondante.
 
     Auteurs : Counoupas C. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 10 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Résultats sérologiques intéressants en matière de COVID-19 obtenus chez la souris avec un vaccin combinant BCG et protéine de spicule du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Norheim G. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 9 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Essai chez la souris d’un vaccin à ADN plasmidique codant pour trois unités : une unité se liant aux récepteurs des chimiokines dans les cellules présentatrices d’antigène, une unité de dimérisation dérivée d’un IgG3 humain et une autre à visée antigénique fondée sur la protéine de spicule du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Zhang H. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 9 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Efficacité d’un anticorps d’origine humaine dirigé contre la protéine de spicule du SARS-CoV-2 administré par voie nasale à des souris, en vue de préparer un spray à usage humain.
 
     Auteurs : Shuai L. et al.
     Source : National Science Review

     Date de publication : 8 décembre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Cette publication explore le potentiel du vison comme modèle animal dans le développement des mesures de contrôle de la Covid19, en particulier pour évaluer l’efficacité des vaccins (essai d’immunisation avec un vaccin sous-unité utilisant la protéine de spicule du SARS CoV-2).
 
     Auteurs : Linsky T. W. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 4 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)

Mise au point de protéines leurres qui se lient à la protéine de spicule du SARS-CoV-2 comme cela se produit avec le récepteur cellulaire (interface ACE2). L’une de ces protéines non seulement se montre efficace in vitro mais protège le hamster doré soumis à une épreuve virale. 
 
     Auteurs : McMahan K. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 4 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Les auteurs montrent par leurs expériences sur le transfert d’IgG purifiées provenant de macaques rhésus convalescents à des macaques sains soumis à une épreuve avec le SARS-CoV-2 le rôle que doit jouer l’immunité cellulaire dans un contexte où les titres en anticorps sont en décroissance ou à peine suffisants pour conférer une protection.
 
     Auteurs : Cox R. M. et al.
     Source : Nature Microbiology

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 3 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

En utilisant le furet comme modèle, essai d’un médicament antiviral administrable par voie orale (déjà efficace contre les virus influenza) pour traiter l’infection par le SARS-CoV-2, en vue de démontrer son efficacité thérapeutique ainsi que le blocage de la transmission virale.
 
     Auteurs : Sanchez-Felipe L. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 1er décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)

Description d’un candidat vaccin contre le SARS-CoV-2 utilisant comme vecteur le virus atténué de la fièvre jaune qui exprime la forme pré-fusionnelle non clivable de la protéine de spicule du virus. La sécurité, le pouvoir immunogène et l’efficacité de ce vaccin ont été testés chez le hamster, la souris et le macaque crabier.
 
     Auteurs : Weissman D. et al.
     Source : Cell Host & Microbe

     Date de publication : 1er décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)

Par diverses méthodes dont des recherches chez la souris et le macaque rhésus, les auteurs montrent que les vaccins actuellement en phase d’essai, dérivés de la souche D614 du SARS-CoV-2 ou dont la protéine de spicule contient la variante D614G sont aussi efficaces contre le mutant G614 qui a remplacé la souche originelle dans la plus grande partie du monde.

     Auteurs : Hörner C. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 30 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

Développement d’un candidat vaccin de la rougeole exprimant la glycoprotéine de spicule du SARS-CoV-2, qui induit une réponse immunitaire élevée chez la souris après deux injections et une protection chez le hamster doré après épreuve avec un isolat viral d’origine humaine ayant subi très peu de passages
 
     Auteurs : Rosenke K. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 29 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Selon les auteurs, le hamster doré apparaît comme hautement sensible au SARS-CoV-2, ce qui en fait un modèle idéal pour la mise au point de traitements préventifs ou curatifs contre la COVID-19.
 
     Auteurs : Baum A. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 27 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les auteurs ont évalué l’efficacité d’un cocktail d’anticorps neutralisants ayant pour cible la protéine S du SARS-CoV-2 chez le macaque rhésus et le hamster doré, retenus tous deux comme modèles de l’infection humaine. Ce cocktail, utilisé à titre préventif ou thérapeutique, a conduit à des résultats favorables dans les essais cliniques conduits avec ces deux modèles.
 
     Auteurs : Wang Z-J. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 26 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Candidat vaccin contre le SARS-CoV-2 mis au point par l’Institut des produits biologiques et l’Institut de virologie de Wuhan (R.P. de Chine), dont la faible toxicité, le caractère immunogène conduisant à une persistance des anticorps, ainsi que la bonne tolérance ont été étudiés dans plusieurs espèces animales.
 
     Auteurs : Haute Autorité de Santé
     Source : Haute Autorité de Santé

     Date de publication : 25 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Document pédagogique comportant une partie 2 intitulée « Modèles animaux en vaccinologie et dans le contexte de l’infection par le SARS-Cov-2 », qui s’intéresse en particulier aux limitations et problématiques des modèles animaux en matière de COVID-19.
 
     Auteurs : Li W. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 24 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Efficacité des points de vue prophylactique et thérapeutique d’un anticorps monoclonal humain inhibant le SARS-CoV-2 dans deux modèles souris et un modèle hamster.
 
     Auteurs : Zheng H. et al.  
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 12 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Les auteurs montrent que le macaque rhésus s’avère un modèle très intéressant de l’atteinte humaine par la COVID-19, et ce par plusieurs aspects : excrétion virale, lésions de pneumonie interstitielle ainsi que réponses immunitaire et inflammatoire dans le tractus respiratoire.
 
     Auteurs : Zheng J. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 9 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 février 2021)

En s’intéressant en particulier à l’anosmie, les auteurs montrent que les souris de souche K18-hACE2 fournissent un modèle utile pour étudier la COVID-19, aussi bien sous sa forme bénigne que létale et pour évaluer l’efficacité des interventions thérapeutiques.
 
     Auteurs : Pandey K. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 31 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

A partir des connaissances déjà disponibles pour le SARS-CoV et le MERS, les auteurs discutent des modèles animaux qui reproduisent les caractéristiques de la COVID-19 humaine de la façon la plus proche, ainsi que des avantages et des inconvénients des différentes méthodes disponibles pour utiliser ces modèles.
 
     Auteurs : Plante J. A. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 26 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 janvier 2021)

Les auteurs étudient en particulier l’effet de l’infection du hamster par la souche du SARS-CoV-2 devenue dominante dans le cours de l’épidémie de COVID-19 (mutation D614G de la protéine de spicule). Chez cet animal, cette souche est mieux adaptée à l’appareil respiratoire supérieur sans que la charge virale dans les poumons soit modifiée. Les résultats d’une infection compétitive entre souche originelle et souche devenue dominante sont aussi donnés.
 
     Auteurs : Rathnasinghe R. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 17 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Résultats comparés obtenus après infection par le SARS-CoV-2 de deux lignées de souris transgéniques, et avantages de ces modèles souris par rapport au modèle hamster doré.
 
     Auteurs : Corbett K. S. et al.
     Source : New England Journal of Medicine

     Date de publication : 15 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Résultats positifs obtenus après administration d’un candidat vaccin à ARN messager du SARS-CoV-2 chez des macaques rhésus.
 
     Auteurs : Kaptein S. J. F. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 9 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

En utilisant le hamster comme modèle, les auteurs démontrent que l’efficacité antivirale du favipiravir ne peut être obtenue qu’avec administration d’une dose élevée de ce médicament. L’hydroxychloroquine quant à elle ne montre aucune activité antivirale.
 
     Auteurs : Bertzbach L. D. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 18 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Les auteurs considèrent que le hamster de Chine est un meilleur modèle que le hamster doré pour étudier la COVID-19 : signes cliniques et lésions plus marqués, connaissance de son génome et outils moléculaires disponibles.
 
     Auteurs : Hartman A. L. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 18 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

L’étude fournit des informations sur la pathogénicité d’un isolat du SARS-CoV-2 inoculé au vervet. Les résultats obtenus conduisent les auteurs à considérer que cet animal constitue un modèle intéressant pour évaluer des vaccins ou des médicaments.
 
     Auteurs : Hassan A. O. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 19 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 février 2021)

Evaluation chez la souris de souche hACE2 de l’efficacité protectrice d’un vaccin dirigé contre le SARS-CoV-2 ayant pour vecteur un adénovirus du chimpanzé.
 
     Auteurs : Cross R. W. et al.
     Source : Virology Journal

     Date de publication : 18 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Utilisation du singe grivet comme modèle de la COVID-19, infecté par voies intranasale et intratrachéale avec du SARS-CoV-2 et résultats obtenus.
 
     Auteurs : Chandrashekar A. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 14 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Article démontrant expérimentalement que des macaques rhésus guéris de la COVID-19 et soumis à une nouvelle épreuve virulente disposent d’une immunité protectrice contre le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Yu J. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 14 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Résultats positifs obtenus après administration d’un candidat vaccin à ADN exprimant différents variants de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 chez des macaques rhésus.
 
     Auteurs : Mercado N. B. et al.  
     Source : Nature

     Date de publication : 30 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Protection conférée chez des macaques rhésus par l’administration d’une seule dose d’un candidat vaccin recombinant à adénovirus exprimant la protéine de spicule du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : van Doremalen N. et al.  
     Source : Nature

     Date de publication : 30 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Essai d’un vaccin à adénovirus codant pour la protéine de spicule du SARS-CoV-2 chez des macaques rhésus, conduisant à une charge virale moindre dans les fluides de lavage bronchoalvéolaire et dans le tissu du tractus respiratoire des animaux vaccinés par rapport aux contrôles, avec absence de pneumonie chez les premiers.
 
     Auteurs : Shan C. et al.
     Source : Cell Research

     Date de publication : 7 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Démonstration de la sensibilité du macaque rhésus au SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Deng W. et al.  
     Source : Science

     Date de publication : 2 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Des anticorps neutralisants dirigés contre le SARS-CoV-2 protégeraient des macaques rhésus une première fois infectés, d’une réinfection durant les premiers jours suivant leur guérison.
 
     Auteurs : Williamson B. N. et al.  
     Source : Nature

     Date de publication : 9 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Effets du remdesivir administré à des macaques rhésus infectés par le SARS-CoV-2, du point de vue des signes cliniques, de l’excrétion du virus et des lésions anatomopathologiques.
 
     Auteurs : Bao L. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 7 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Résultats obtenus par injection intranasale du SARS-CoV-2 à une lignée de souris transgéniques exprimant le récepteur cellulaire ACE2 humain.
 
     Auteurs : Bondad-Reantaso M. G. et al.
     Source : Asian Fisheries Science

     Date de publication : 20 avril 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 octobre 2020)

L’article développe les arguments disponibles pour affirmer que la probabilité de contamination des animaux aquatiques et de leurs produits par le SARS-CoV-2 est négligeable.
 
     Auteurs : Chan J. F-W. et al.
     Source : Clinical Infectious Diseases

     Date de publication : 26 mars 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Arguments scientifiques en faveur de l’utilisation du hamster doré comme modèle pour étudier différents aspects de l’infection par le SARS-CoV-2.
 
 
 

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     Auteurs : Gaudreault N. N. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 24 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

Les auteurs montrent que le SARS-CoV-2 peut se multiplier dans des cellules de moutons mais que des animaux de cette espèce, soumis à une épreuve virulente par voie intranasale, ne manifestent qu’une infection limitée. Aucune séroconversion n’est trouvée chez des moutons sentinelles mis à leur contact, ce qui conduit à penser que la transmission du virus au sein de cette espèce est peu efficace. 
 
     Auteurs : Wernike K. et al.
     Source : bioRxiv

    Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 20 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Enquête sérologique sur le SARS-CoV-2 conduite sur 1 000 bovins ayant subi des prélèvements fin 2021 en Allemagne. Onze d’entre eux, détenus dans neuf fermes différentes, ont présenté des résultats positifs en ELISA, ce qui conduit à penser qu’ils ont été infectés par des détenteurs eux-mêmes infectés, sans qu’il y ait eu le moindre signe de propagation ultérieure du virus à partir de ces animaux.
 
     Auteurs : Lu L. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 23 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont réalisé une étude épidémiologique approfondie à l’échelon moléculaire sur les foyers de SARS-CoV-2 apparus dans 68 élevages de visons des Pays-Bas ainsi que sur les personnes vivant ou travaillant dans ces élevages. Ils ont aussi examiné la dynamique des infections au sein des clusters formés par différents élevages et essayé de déterminer les facteurs pouvant favoriser la transmission du virus de l’un à l’autre.
 
     Auteur : Ministère de l'agriculture et de la forêt de Finlande
     Source : Ministère de l'agriculture et de la forêt de Finlande

    Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Présentation par le Ministère de l’agriculture et de la forêt de Finlande au Comité permanent des végétaux, des animaux, des denrées alimentaires et de l’alimentation animale (ScoPAFF) de la Commission européenne de l’autorisation qu’il a accordée en vue d’un usage conditionnel d’un vaccin dirigé contre le SARS-CoV-2 chez des visons d’élevage.
 
     Auteurs : Rasmussen T. B. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 15 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Suivi d’un élevage de visons au Danemark qui, après un premier épisode d’infection par le SARS-CoV-2, en a connu un second, avec entre les deux une période au cours de laquelle le virus avait complètement disparu. Bien que différents, les virus responsables de chacun des épisodes étaient plus proches l’un de l’autre que de souches de SARS-CoV-2 identifiées dans d’autres élevages de visons danois. 
 
     Auteurs : Eckstrand C.D. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 12 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Informations portant sur l’épidémiologie, l’anatomo-pathologie, l’analyse génomique et la distribution du virus chez les visons d’élevage pendant l’épizootie due au SARS-CoV-2 qui a sévi parmi ceux-ci en Utah (États-Unis d’Amérique) en août 2020. 
 
     Auteurs : Bosco-Lauth A. M et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 9 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Lettre dans laquelle les auteurs font état des résultats de leurs études sur la sensibilité des animaux de production habituels (bovins, ovins, caprins, lapins, alpagas et chevaux) vis-à-vis du SARS-CoV-2 lorsqu’ils sont soumis à une épreuve virulente par voie intranasale. Les résultats de la recherche d’anticorps spécifiques sont aussi donnés. 
 
     Auteurs : Díaz A. V. et al.
     Source : Evolutionary Applications

     Date de publication : 24 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Revue de différents épisodes d’infection par le SARS-CoV-2 qui ont été signalés dans des élevages de visons de par le monde (jusqu’en juillet 2021). Les auteurs décrivent les conditions sanitaires d’élevage qui ont favorisé ces épisodes. Ils insistent sur les mesures de prévention, de surveillance et de lutte qui devraient être mises en place dans ce type d’élevages. 
 
     Auteur : FIFUR
     Source : FIFUR ePressi

     Date de publication : 30 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

L’Autorité alimentaire de Finlande, placée sous l’autorité du ministère de l’agriculture et des forêts de ce pays, autorise l’utilisation d’un vaccin expérimental pour protéger les élevages de visons du SARS-CoV-2. Il s’agit d’un projet conduit à l’initiative de l’association des éleveurs de visons et de chercheurs de l’université d’Helsinki. 
 
     Auteurs : Li Y. et al.
     Source : Virus Research

     Date de publication : 25 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Plus de 3 000 prélèvements collectés chez des volailles dans 14 provinces de la République populaire de Chine de septembre à décembre 2019 ont été analysés pour la recherche de coronavirus. Si la présence de plusieurs de ces virus a été mise en évidence chez des gallinacés, des canards et des pigeons, aucun ne s’est révélé être le SARS-CoV-2, ce qui de prime abord élimine l’hypothèse de son origine parmi les volailles. 
 
     Auteurs : Tai J-H. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

Pour élucider la façon dont le SARS-CoV-2 a évolué depuis le début de la pandémie, les auteurs se sont penchés sur les mutations adaptatives intervenues, particulièrement au sein de la protéine de spicule, lors de la transmission du virus de l’Homme au vison puis de sa propagation au sein des populations de visons.
 
     Auteur : Huaxia  
     Source : XINHUANET

     Date de publication : 15 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

L’agence chinoise rapporte que les Services vétérinaire de la Mongolie ont signalé des cas de mortalité parmi des castors détenus dans un centre d’élevage à Oulan-Bator.
 
     Auteurs : Chaintoutis S. C. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 7 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

Suivi de deux élevages de visons en Grèce infectés par le SARS-CoV-2, dont l’atteinte de l’un est clairement liée à des prises de sang effectuées par les exploitants. La mortalité dans les deux fermes a été élevée pendant un peu plus de trois semaines et, au final, le taux d’immunité chez les animaux restants s’est révélé très élevé.
 
     Auteurs : Rabalski L. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 9 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Surveillance exercée à l’égard d’un élevage de visons situé au nord de la Pologne, par collecte de prélèvements sur des animaux sacrifiés dans un établissement de pelleterie, qui a conduit à la confirmation de son infection par le SARS-CoV-2 en utilisant différentes méthodes de laboratoire.
 
     Auteurs : Buckley A. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 30 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Les expérimentations conduites sur des porcs (épreuves virales par voies intraveineuse, intratrachéale et intranasale à l’aide d’une souche provenant d’un tigre du zoo de New York) renforcent l’idée que cette espèce n’est pas susceptible de jouer un rôle dans l’épidémiologie et la propagation du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Lu L. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 14 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Les auteurs décrivent, en utilisant des méthodes statistiques, la façon dont s’est propagé aux Pays-Bas le SARS-CoV-2 entre élevages de visons et êtres humains à leur contact. Statistiquement, les paramètres les plus significatifs pour cette propagation sont les mouvements de personnes et la distance entre élevages.
 
     Auteurs : Deng J. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 8 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Lettre aux éditeurs de la revue intéressante en ce qu’elle fournit quelques résultats sur des enquêtes sérologiques menées en République populaire de Chine pour la recherche du SARS-CoV-2 de juin 2018 à janvier 2021 dans des élevages d’animaux à fourrure (visons, renards et chiens viverrins).
 
     Auteurs : Lassaunière R. et al.
     Source : Frontiers in Microbiology

     Date de publication : 25 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Les auteurs décrivent les caractéristiques de la souche variante du SARS-CoV-2 qui a été responsable d’un cluster particulier, dit cluster 5, qui a sévi parmi les élevages de visons au Danemark
 
     Auteurs : Cai H. Y. et Cai A.
     Source : Journal of Veterinary Diagnostic Investigation

     Date de publication : 10 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

A partir des séquences du SARS-CoV-2 déposées dans la banque de données GISAID entre décembre 2019 et mars 2021, les auteurs déterminent quels variants viraux ont circulé de manière prédominante chez les visons des USA et montrent que ces variants ont d’abord infecté la population humaine de ce pays.

     Auteurs : Cerino P. et al.
     Source : Future Science

     Date de publication : 20 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

L’Institut zooprophylactique d’Italie méridionale a soumis à l’épreuve RT-PCR pour la recherche du SARS-CoV-2 des dizaines d’animaux d’élevage de toutes sortes qui ont été en contact journellement au moins durant deux semaines avec un détenteur ayant présenté lui-même un résultat positif à cette même épreuve. Aucun de ces animaux n’a présenté un résultat positif. Les auteurs font toutefois état des limites de leur étude.
 
     Auteur : ProMED, d’après WBUR News (média propriété de l’université de Boston, USA)
     Source : ProMED

     Date de publication : 16 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

ProMED reproduit les propos d’un des membres de la mission de l’OMS qui s’est rendue en Rép. pop. de Chine selon lesquels le SARS-CoV-2 trouverait sa source parmi les élevages d’animaux sauvages dont le développement a été soutenu depuis 20 ans dans ce pays, en particulier dans le Yunnan. ProMED rappelle a cette occasion le revirement opéré par les autorités chinoises qui ont interdit ce type d’élevages dès le début de l’épidémie.
 
     Auteurs : Domańska-Blicharz K. et al.
     Source : Journal of Veterinary Research

     Date de publication : 9 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Les auteurs signalent un foyer d’infection par le SARS-CoV-2 découvert entre novembre 2020 et janvier 2021 dans un élevage de visons de Pologne. Ils fournissent les résultats des analyses de laboratoire (sérologie, virologie) obtenus à partir des prélèvements collectés chez les animaux sacrifiés. 
 
     Auteurs : Xia W. et al.
     Source : Preprints.org

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 25 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

Les auteurs émettent l’hypothèse selon laquelle l’épizootie de peste porcine africaine sévissant en Rép. pop. de Chine depuis 2018 a provoqué une grande pénurie de viande de porc, ce qui a conduit les consommateurs à se tourner vers d’autres sources de viandes, en particulier celles provenant des élevages d’animaux sauvages du sud du pays. 
 
     Auteur : ANSES
     Source : ANSES

     Date de publication : 18 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)

Préconisations de l’ANSES sur la surveillance à exercer dans les trois élevages de visons existant en France vis-à-vis du SARS-CoV-2, y compris sur le personnel soignant, définition des conditions d’introduction de nouveaux animaux dans ces élevages et mesures à prendre au cas où l’un de ces élevages viendrait à être infecté.
 
     Auteurs : EFSA (European Food Safety Authority) et ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control)
     Source : EFSA  & ECDC

     Date de publication : 29 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Considérant que tous les élevages de visons peuvent être atteints par le SARS-CoV-2, les deux organisations formulent des recommandations sur les différents moyens de surveillance active et passive qui doivent être mis en œuvre tant sur les animaux que le personnel qui en prend soin pour repérer précocement toute infection.
 
     Auteurs : Boklund A. et al.
     Source : Animals

     Date de publication : 12 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Description de l’épizootie due au SARS-CoV-2 apparue à partir de juin 2020 dans les élevages de visons du Danemark et résultats des investigations conduites au cours de cet épisode.
 
     Auteurs : Welkers M. R. A. et al.
     Source : Virus Evolution

     Date de publication : 4 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Les auteurs signalent que de multiples substitutions de résidus sont retrouvées au niveau du domaine de liaison au récepteur de la protéine S des souches de SARS-CoV-2 isolées chez les visons au Danemark et aux Pays-Bas, conduisant à penser que le virus est en voie d’adaptation à l’espèce. Ces substitutions pourraient avoir des conséquences sur la réponse immunitaire générée par une infection chez l’Homme.
 
     Auteurs : Mykytin A. Z. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 23 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)

Les auteurs néerlandais démontrent expérimentalement la sensibilité du lapin (qui fait l’objet d’un élevage intensif dans plusieurs pays) au SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Pickering B. S. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 18 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

L’expérimentation conduite au Canada sur un petit groupe de porcs montre une faible sensibilité de cette espèce au SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Khamisse E. et al.
     Source : Animal

     Date de publication : 10 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)

Exposé des conclusions tirées par le Groupe d’expertise collective d’urgence (GECU « COVID-19 ») réuni à l’initiative de l’ANSES en mars et avril 2020 pour évaluer le rôle potentiel des animaux d’élevage dans la pandémie de COVID-19.
 
     Auteur : ProMED, d’après des informations nationales
     Source : ProMED

     Date de publication : 27 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Premiers foyers de COVID-19 dans des élevages de visons en France, Lituanie et Pologne, et décision du gouvernement de la République d’Irlande d’éliminer les élevages de visons de son territoire.
 
     Auteurs : Freuling C. M. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 18 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

L’infection expérimentale de chiens viverrins (élevés de manière intensive en République populaire de Chine) démontre leur sensibilité au SARS-CoV-2 et leur capacité à transmettre le virus à des congénères.
 
     Auteur : OIE
     Source : OIE

     Date de publication : 16 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA : 22 novembre 2020)

Lignes directrices de l’OIE destinées à aider les Services vétérinaires, les services de santé et les autres parties intéressées à limiter le risque d’introduction du SARS-CoV-2 dans des populations d’animaux de production sensibles de façon modérée ou élevée à l’infection.
 
     Auteurs : Suarez D. L. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 16 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Epreuve virale avec le SARS-CoV-2 et le MERS-CoV chez différentes espèces de volailles : ni maladie, ni réplication virale, ni apparition d’anticorps dans ces espèces.
 
     Auteur : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service

     Date de publication : 9 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Le document, destiné aux responsables de la santé humaine et de la santé animale aux Etats-Unis, décrit les mesures à prendre en cas de suspicion ou de confirmation d’un foyer de COVID-19 dans une ferme élevant des visons ou d’autres mustélidés.
 
     Auteur : ProMED
     Source : ProMED, d’après Branswell H. (statnews.com) et le Stetens Serum Institut (Danemark)

     Date de publication : 6 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA : 15 novembre 2020)

Discussion sur le risque de transmission aux êtres humains d’un virus SARS-CoV-2 mutant circulant chez les visons au Danemark.
 
     Auteur : ProMED
     Source : ProMED, d'après Information.dk (Danemark)

     Date de publication : 1er novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Le Statens Serum Institut et l’université de Copenhague ont signalé au Ministère de l’alimentation, de l’agriculture et de la pêche du Danemark l’émergence de deux variants du SARS-CoV-2 circulant tant chez les animaux que des personnes dans les fermes élevant des visons. A ce jour, ProMED n’a pas eu accès aux rapports de ces deux institutions.
 
     Auteur : ProMED
     Source : ProMED, d'après Aftonbladet.se (Suède)

     Date de publication : 30 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Premier foyer de SARS-CoV-2 signalé en Suède dans un élevage de visons. Ont été trouvés infectés aussi bien des animaux que des personnes au sein de l’élevage.
 
     Auteurs : Ulrich L. et al.
     Source : Emerg Infect Dis.

     Date de publication : 21 octobre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 octobre 2020)

Les auteurs ont inoculé du SARS-CoV-2 à six bovins ; deux d'entre eux ont permis la réplication du virus et se sont séroconvertis malgré la présence de titres élevés d'anticorps contre un betacoronavirus bovin ; trois bovins mis en contact ne se sont pas infectés.
 
     Auteurs : Meekins D. A. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 20 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les auteurs montrent que la réplication du SARS-CoV-2 est possible sur certaines lignées cellulaires de porc, mais que des porcs recevant une injection de virus par différentes voies ne manifestent aucun signe d’infection ni ne contaminent des congénères sains mis à leur contact.
 
     Auteur : de Graaf P., d'après un article en néerlandais du journal Volkskrant (Pays-Bas)
     Source : ProMED

     Date de publication : 19 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 octobre 2020)

L’article décrit toutes les recherches, malheureusement infructueuses à ce jour, conduites aux Pays-Bas pour essayer de comprendre pourquoi le SARS-CoV-2 continue à se répandre parmi les élevages de visons malgré toutes les précautions sanitaires prises.
 
     Auteur : Department of Agriculture, Trade and Consumer Protection, State of Wisconsin (USA)
     Source : Department of Agriculture, Trade and Consumer Protection, State of Wisconsin (USA)

     Date de publication : 8 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)

Premier signalement de cas de COVID-19 dans un élevage de visons situé dans l’État nord-américain du Wisconsin.
 
     Auteurs : Vergara-Alert J. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 2 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Les auteurs mettent en évidence chez des porcs recevant une injection de SARS-CoV-2, une séroconversion dirigée contre la protéine de spicule du virus et la présence d’anticorps neutralisants.
 
     Auteurs : Khbou M. K. et al.
     Source : Veterinary Medicine and Science
     Date de publication : 25 septembre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 septembre 2020)

     Auteur : Cahan E.
     Source : Science Magazine

     Date de publication : 18 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 août 2020)

Pour la première fois, est signalée l’atteinte de visons d’élevage par le SARS-CoV-2 aux Etats-Unis (État de l’Utah).
 
     Auteurs : Berhane Y. et al.
     Source : Authorea

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 31 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 octobre 2020)

 Inoculation expérimentale à des dindes et des poulets (y compris d’embryons) du SARS-CoV-2. Les résultats obtenus conduisent à conclure que le virus n’affecte pas ces deux espèces.
 
     Auteurs : Molenaar R. J. et al.
     Source : Veterinary Pathology

     Date de publication : 14 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 octobre 2020)

Les auteurs décrivent les lésions anatomopathologiques et les découvertes histologiques faites sur des visons morts dans quatre foyers de COVID-19 apparus aux Pays-Bas. Ils ont aussi assuré un suivi virologique (PCR) chez les visons guéris.
 
     Auteurs : Schlottau K. et al.
     Source : The Lancet

     Date de publication : 7 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 octobre 2020)

Etude de la sensibilité d’animaux hôtes potentiels du SARS-CoV-2 et du risque zoonotique associé.
 
     Auteur : Ministry of Agriculture, Nature and Food Quality, The Netherlands
     Source : SCOPAFF meeting
     Date de publication : 18 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 juillet 2020)
 
     Auteur : FAO  
     Source : FAO

     Date de publication : 1er mai 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 septembre 2020)

L’ouvrage fournit des recommandations pratiques pour tous les acteurs de la production animale en vue de réduire l’impact du SARS-CoV-2 et assurer la continuité de la chaîne alimentaire.
 
 

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     Auteurs : Bienzle D. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 2 mai 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 mai 2022)

Enquête virologique et sérologique réalisée en Ontario (Canada) entre avril 2020 et août 2021 chez des chiens et des chats dont le propriétaire avait été récemment atteint par la COVID-19 ainsi que dans des refuges ou cliniques de castration pour animaux de compagnie, et tentative de détermination de facteurs de risque d’infection par le SARS-CoV-2 chez ceux des animaux vivant dans des familles.
 
     Auteurs : Ga E. et al.
     Source : Vaccines

     Date de publication : 24 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Mise au point d’un vaccin dirigé contre le SARS-CoV-2 destiné au chien. Il a été conçu à partir de la protéine S1 et du domaine d’attachement au récepteur de la protéine de spicule du virus, c’est à dire la région virale qui active la réponse immunitaire chez l’hôte. Le vaccin a été administré à des beagles en deux doses à trois semaines d’intervalle par voie sous-cutanée, et le taux d’anticorps sériques obtenu était équivalent à celui considéré comme suffisant pour protéger les personnes de la COVID-19.
 
     Auteurs : Wendling N. M. et al.
     Source : Zoonoses and Public Health

     Date de publication : 14 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)

Cet article décrit les manifestations cliniques et la réponse immunitaire différentes observées chez deux chiens atteints par le variant Delta du SARS-CoV-2 après avoir été en contact de façon similaire avec une personne complètement vaccinée mais néanmoins infectée par ce variant. Il souligne l’intérêt d’assurer une surveillance active des infections par différents variants du SARS-CoV-2 chez les animaux de compagnie et les autres types d’animaux.

     Auteurs : Sánchez-Morales L. et al.
     Source : bioRxiv

    Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 13 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)

Recherche en Espagne du variant Omicron du SARS-CoV-2 chez des chiens et des chats dont les propriétaires étaient atteints par la COVID-19. Aucun des animaux infectés n’a présenté des symptômes de maladie et les charges virales détectées sont restées très faibles. En outre, chez ces animaux, l’excrétion d’ARN viral n’a duré que peu de temps. Ces résultats conduisent les auteurs à penser que la virulence de ce variant reste faible chez ces animaux de compagnie.

     Auteurs : Oliveira-Filho E. F. (de) et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 5 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Les auteurs ont étudié la propagation du SARS-CoV-2 chez le chat domestique en testant 547 d’entre eux entre juillet et novembre 2020 dans sept États du Sud, du Sud-Est et du Nord-Est du Brésil. Ils ont observé que la réponse immunitaire due au coronavirus félin (FcoV), qui est enzootique dans le pays, n’influe pas sur l’infection des chats par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Zambrano-Mila M. S. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 5 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)

Mise en évidence de l’infection par le SARS-CoV-2 de trois chiens errants vivant au sein d’une communauté indigène de l’Amazonie équatorienne, elle-même sévèrement atteinte par la COVID-19. Ces chiens ont vraisemblablement été contaminés par des membres de cette communauté. Les auteurs craignent que cette situation ne facilite la transmission du virus à des mammifères sauvages vivant dans la forêt amazonienne.

     Auteurs : Barroso-Arévalo S. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication :1er avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Signalement, pour la première fois en Espagne chez un chat, d’un cas d’infection par le variant Delta (B.1.165.2) du SARS-CoV-2. Son propriétaire était infecté par ce virus alors qu’il avait suivi un schéma vaccinal complet contre la COVID-19. Chez ce chat, les symptômes sont restés peu marqués (éternuements), mais une charge virale élevée a été retrouvée dans un prélèvement oro-pharyngé.
 
     Auteurs : Chaber A-L. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 22 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Essai d’utilisation en Australie de 15 chiens renifleurs pour différencier des personnes infectées par le SARS-CoV-2 de personnes non infectées en utilisant des prélèvements de sueur d’aisselle collectés dans des centres de soins dans trois pays (Australie, Émirats arabes unis et France). Les résultats de sensibilité et de spécificité de cette méthode de diagnostic sont voisins de ceux obtenus lors des essais de même nature conduits précédemment dans d’autres pays.
 
     Auteurs : Colitti B. et al.
     Source : BMC Veterinary Research

     Date de publication : 22 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Description d’un cas de détresse pulmonaire présenté par une chienne de race bull terrier de trois ans, dont des épreuves de laboratoire ont montré l’infection par le SARS-CoV-2. Les lésions observées chez cette chienne ressemblaient fortement aux séquelles signalées chez des personnes atteintes de COVID-19 après la phase aiguë de la maladie. L’article signale par ailleurs que cette race est prédisposée à faire une fibrose pulmonaire idiopathique, que l’atteinte par le SARS-CoV-2 pourrait avoir favorisée.
 
DIAGNOSTIC ACCURACY OF NON-INVASIVE DETECTION OF SARS-COV-2 INFECTION BY CANINE OLFACTION
     Auteurs : Grandjean D. et al.
     Source : medRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 8 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)

Comparaison, dans deux centres de dépistage de l’infection humaine par le SARS-CoV-2 situés à Paris (France), des performances de détection de l’infection par utilisation de chiens renifleurs à partir de prélèvements de sueur d’une part, et par examen de prélèvements nasopharyngés ou salivaires (RT-PCR, test antigénique) d’autre part. Les auteurs pensent que l’utilisation de ces chiens pourrait être une alternative aux tests antigéniques lorsqu’il est nécessaire d’obtenir des résultats rapides en cas de dépistage de masse. 
 
     Auteurs : Grandjean D. et al.
     Source : Médecine de catastrophe – Urgences collectives

     Date de publication : 4 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Cet article fait le point sur les recherches conduites par une équipe de l’École nationale vétérinaire d’Alfort (France) pour mettre au point une méthode utilisant des chiens renifleurs permettant de détecter les personnes infectées par le SARS-CoV-2 ainsi que sur les collaborations que cette équipe a établies à l’échelle internationale sur cette thématique.
 
     Auteurs : Adler J. M. et al.
     Source : Zoonoses and Public Health

     Date de publication : 2 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)

Les auteurs ont examiné des sérums collectés de janvier à juin 2020 sur des chats en Allemagne et dans plusieurs autres pays européens à l’aide d’épreuves de diagnostic du SARS-CoV-2. Les résultats montrent un pourcentage de résultats positifs tournant autour de 2 %, ce qui est assez bien corrélé aux observations faites dans la population humaine. Les auteurs en concluent que les chats ne jouent au mieux qu’un rôle négligeable dans la transmission du virus.
 
     Auteurs : Mendez A. et al.
     Source : International Journal of Infectious Diseases

     Date de publication : 1er mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Résultats d’une enquête sur le SARS-CoV-2 réalisée dans les familles d’agents de santé ou de personnes atteintes par la COVID-19 possédant des animaux de compagnie. Sur les 38 chiens et 17 chats inclus dans l’enquête, seuls trois chats ont présenté des anticorps dirigés contre le virus.
 
     Auteurs : Neves S. et al.
     Source : International Journal of Infectious Diseases

     Date de publication : 1er mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Résultats d’une enquête sérologique relative au SARS-CoV-2 conduite au Portugal sur 107 chiens et chats présentés dans des centres médicaux vétérinaires entre octobre 2020 et mars 2021. Le pourcentage estimé de chiens exposés au virus s’élevait d’après cette enquête à 5 % et le pourcentage de chats à un peu plus de 2 %.
 
     Auteurs : Pecora A. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 1er mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Infection naturelle par le SARS-CoV-2 (variant Alpha) de deux chats en Argentine, dont le propriétaire avait précédemment été infecté par ce virus. Du génome viral a été détecté dans des prélèvements oropharyngés et rectaux et son séquençage a révélé que les souches virales ayant infecté le propriétaire et l’un des chats étaient génétiquement très proches. Comparée à la souche humaine, la souche féline ne comportait qu’une mutation supplémentaire, ce qui suggère fortement que le chat a été contaminé par son maître.
 
     Auteurs : Lenz O. C. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 17 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

Détection et séquençage d’une souche du variant Delta du SARS-CoV-2 (souche AY.3) dans des prélèvements fécaux provenant d’un chat dont le propriétaire avait été infecté par le virus. La charge en ARN dans ces prélèvements fécaux s’est révélée relativement élevée. Le séquençage a montré que le virus félin différait de la souche humaine circulant dans le secteur par quelques nucléotides, alors que l’analyse phylogénique a révélé plusieurs mutations propres au chat par comparaison à cette souche humaine.
 
     Auteurs : Grandjean D. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 14 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)

Résultats d’une étude visant à déterminer les valeurs de sensibilité et de spécificité obtenues en utilisant des chiens renifleurs pour détecter des personnes infectées par le SARS-CoV-2 à partir d’échantillons de sueur axillaire.
 
     Auteurs : Michael H. T. et al.
     Source : Journal of Small Animal Practice

     Date de publication : 31 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Des prélèvements provenant de chiens et de chats présentant une pathologie respiratoire, qui ont été envoyés de février à avril 2019 et 2020 à des laboratoires de référence situés en Amérique du Nord, Asie et Europe, ont été soumis à des épreuves de recherche du SARS-CoV-2 (RT-PCR). Aucune infection par le SARS-CoV-2 des animaux testés n’a été mise en évidence. Les auteurs en concluent qu’au moment de l’émergence de la COVID-19, les cas d’infection des chiens et des chats sont restés rares.
  
     Auteurs : Fritz M. et al.
     Source : Veterinary sciences

     Date de publication : 27 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 février 2022)

Une recherche d’anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 effectuée en France chez 144 lapins de compagnie soumis à prélèvement sanguin dans des établissements vétérinaires entre novembre 2020 et juin 2021 a révélé que 0,7 à 1,4 % d’entre eux avaient été infectés par ce virus.
 
     Auteurs : Cardillo L. et al.
     Source : Microorganisms

     Date de publication : 24 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)

Enquête sur la prévalence du SARS-CoV-2 réalisée à l’aide de prélèvements collectés d’avril 2020 à octobre 2021 chez 182 chiens et 313 chats avec propriétaire ou bien errants dans la région de Campanie (Italie). Aucun résultat positif n’a été obtenu avec l’épreuve RT-PCR, et un résultat positif en sérologie n’a été obtenu qu’avec un chien et cinq chats. Parmi ces derniers, il s’agissait principalement de chats dont le propriétaire avait été atteint par la COVID-19.
 
     Auteurs : Grandjean D. et al.
     Source : MedRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 12 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)

Mise au point d’un protocole utilisant des chiens renifleurs pour détecter des personnes à COVID long chez qui de l’ARN et/ou des protéines du SARS-CoV-2 persistent, sans qu’elles aient à quitter leur domicile. Les auteurs discutent des avantages et inconvénients de cette méthode de détection par rapport à l’épreuve RT-PCR. 
 
     Auteurs : Jairak W. et al.
     Source : Zoonoses and Public Health

     Date de publication : 4 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 16 janvier 2022)

Résultats d’une enquête réalisée par RT-PCR et sérologie chez des chiens et des chats domestiques vivant dans les zones à haut risque de COVID-19 pendant la seconde vague de la maladie (février 2021) en Thaïlande. 
 
     Auteurs : Imanishi I. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 3 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 16 janvier 2022)

Résultats d’une enquête conduite au Japon pour rechercher la présence d’anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 chez près de 2 000 chats soumis à prélèvements en juin et juillet 2020 dans une centaine de cliniques vétérinaires. Le pourcentage de chats positifs correspondait à celui existant dans la population humaine générale. 
 
     Auteurs : Cano-Gómez C. et al.
     Source : International Journal of Infectious Diseases

     Date de publication : 1er janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Description des investigations entreprises (sur l’excrétion virale, l’apparition d’anticorps spécifiques, etc.) sur deux chats infectés par le SARS-CoV-2 par leur maître en Espagne.
 
     Auteurs : Kang K. et al.
     Source : Veterinary Medicine and Science

     Date de publication : 27 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)

Signalement de l’infection de trois chats par le variant Delta du SARS-CoV-2 en septembre 2021 dans la province du Heilongjiang (Rép. pop. de Chine). Ces trois chats appartenaient à une personne atteinte par la COVID-19. Considérant que ces animaux étaient susceptibles de propager le virus à des êtres humains, ils ont été euthanasiés conformément à la réglementation en vigueur dans le pays.
 
     Auteurs : Fernández-Bastit L. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 16 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Description, en Espagne, du premier cas d’infection d’un chien par le variant Delta du SARS-CoV-2. Cet animal vivait dans une famille dont plusieurs membres ont été atteints par la COVID-19. Il n’a présenté que des signes cliniques légers et, à ce moment-là, une faible charge virale dans son système respiratoire supérieur. Les prélèvements collectés une semaine après ont fourni des résultats négatifs.
 
     Auteurs : Gonzales J. L. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 10 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Essai de quantification du risque de transmission du SARS-CoV-2 de chat à chat en examinant la littérature disponible décrivant les cas de transmission expérimentale et les cas de transmission naturelle à l’intérieur de familles infectées, dans le but d’en déduire un taux de reproduction (R0) dans cette espèce. 

     Auteurs : Chan T. et al.
     Source : Schweizer Archiv für Tierheilkunde

     Date de publication : 1er décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Étude suisse de prévalence sur les infections par le SARS-CoV-2 chez les chiens et les chats réalisée en collaboration avec des cliniques d’Allemagne et d’Italie pendant la première vague de la pandémie (mars-juillet 2020), et poursuite de cette étude chez des chiens et des chats vivant dans des familles où des cas de COVID-19 se sont produits.
 
     Auteurs : Carneiro R. L. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 22 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Cas d’un chat mort d’une infection par le variant préoccupant gamma du SARS-CoV-2 après avoir présenté des symptômes respiratoires aigus sévères. Le virus a été retrouvé dans nombre d’organes autres que l’appareil respiratoire (rate, foie, cœur, reins et intestins). Le fait que ce chat ait aussi été infecté par le virus de la leucose féline peut avoir accentué les effets de la maladie
 
     Auteurs : ten Hagen N. A. et al.
     Source : Frontiers in Medicine

     Date de publication : 18 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Essais portant sur des chiens renifleurs pour étudier dans quelle mesure ils sont capables de différencier chez l’Homme une infection par le SARS-CoV-2 d’atteintes respiratoires dues à d’autres virus. Si cette méthode diagnostique s’est avérée avoir une spécificité élevée, en revanche sa sensibilité s’est révélée plus faible que dans des essais comparables conduits par d’autres chercheurs.
 
     Auteurs : Miró G. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 10 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Description de la dynamique d’infection par le SARS-CoV-2 chez trois chiens (dont deux présentant des signes respiratoires frustes) et un chat (atteint de pneumonie sévère) appartenant à des familles où des cas de COVID-19 se sont produits au moment de la diffusion du variant alpha du virus (lignée B.1.1.7) dans la région de Madrid (Espagne).
 
First cases of SARS-CoV-2 infection in dogs and cats in Thailand 
     Auteurs : Jairak W. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 5 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Suivi de chiens et des chats dont les propriétaires ont été infectés par le SARS-CoV-2 et qui ont été mis en quarantaine dans des hôpitaux vétérinaires privés pendant la troisième vague de COVID-19 en Thaïlande (mars - mai 2021). Peu d’animaux se sont révélés infectés et un seul a manifesté des signes respiratoires légers.
 
     Auteurs : Ferasin L. et al.
     Source : VetRecord

     Date de publication : 4 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Description au Royaume-Uni d’une série de cas d’infection de chiens et de chats par le variant préoccupant B.1.1.7 du SARS-CoV-2 qui présentaient des signes de myocardite sans atteinte préalable de l’appareil respiratoire. La plupart de leurs maîtres avaient été atteints par la COVID-19 trois à six semaines auparavant.
    Auteurs : Barroso-Arévalo S. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 1er novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Résultats d’une enquête sur le SARS-CoV-2 conduite à grande échelle en Espagne chez des chiens et des chats en contact avec des personnes atteintes par la COVID-19 ou présentant des symptômes évoquant cette maladie, et d’autres pris au hasard. Très peu d’animaux ont présenté un résultat positif aux épreuves de laboratoire réalisées
 
     Auteurs : Medkour H. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 27 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Première description en France d’un cas d’infection d’un chien par le variant préoccupant B.1.160 (variant Marseille-4) du SARS-CoV-2, dans un foyer où un homme et une femme ont été atteints par la COVID-19.
 
     Auteurs : Fritz M. et al.
     Source : Veterinary Medicine and Science

    Date de publication : 26 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Étude apportant des informations complémentaires sur les volets clinique, moléculaire et sérologique de l’infection des chats par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Schulz C. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

    Date de publication : 25 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Résultats d’une enquête sérologique pour la recherche du SARS-CoV-2 en utilisant des prélèvements effectués sur plus de 2 000 chats dans quatre pays (Allemagne, Espagne, Italie et Royaume-Uni) pendant la première vague de COVID-19 en Europe (avril – juin 2020). 
 
     Auteurs : Lee D-H. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 23 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Description d'un cas sévère d'infection par le SARS-CoV-2 chez un chien du Connecticut (États-Unis d’Amérique) et résultats des investigations conduites pour déterminer le variant du virus en cause.
 
     Auteurs : Chetboul V. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 21 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Première description complète en France d’un cas de myocardite associée à une infection par le SARS-CoV-2 chez un chat médicalement suivi pendant six mois, dont le maître est soupçonné d’avoir été préalablement infecté sans pour autant avoir présenté de symptômes.
 
     Auteurs : Maia R. C. C. et al.
     Source : Frontiers in Public Health

     Date de publication : 21 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Étude brésilienne sur la performance de deux chiens renifleurs pour détecter l’atteinte de personnes par la COVID-19 à partir d’échantillons de sueur axillaire, par comparaison à l’épreuve RT-PCR appliquée à des prélèvements naso- et oropharyngés effectués sur ces mêmes personnes. 
 
Near-Complete Genome of SARS-CoV-2 Delta (AY.3) Variant Identified in a Dog in Kansas, USA 
     Auteurs : Doerksen T. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 19 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs signalent le premier cas d’un chien infecté par le variant delta du SARS-CoV-2 et discutent de l’importance de diverses mutations constatées, dont la mutation M1227L du gène de spicule qui pourrait revêtir une particulière importance pour l’adaptation rapide de ce variant au chien. 
 
     Auteurs : Kontos E. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 18 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont entraîné avec succès des abeilles (Apis mellifera) à identifier des visons (Neovison vison) infectés par le SARS-CoV-2 sur la base d’un protocole de conditionnement pavlovien (réflexe d’extension du proboscis, couramment appelé la trompe) vis-à-vis de la modification du profil en composés organiques volatiles émis par ceux-ci.
 
Determining the role of natural SARS-CoV-2 infection in the death of domestic pets: 10 cases (2020–2021)
     Auteurs : Carpenter A. et al.
     Source : JAVMA

     Date de publication : 15 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Mise au point aux États-Unis d’Amérique d’une méthodologie pour déterminer le rôle de l’infection par le SARS-CoV-2 chez les animaux de compagnie à partir des 10 premiers chiens et chats présentés en consultation dans un cabinet vétérinaire qui ont présenté un résultat positif à la recherche de cette infection et qui sont morts ou bien ont dû être euthanasiés (mars 2020 – janvier 2021). 
 
     Auteurs : Yilmaz A. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 12 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Résultats d’une enquête sérologique pour la recherche du SARS-CoV-2 réalisée chez des chats de la ville d’Istanbul (Turquie) présentés en consultation à la faculté vétérinaire avant et pendant la pandémie de COVID-19.
 
     Auteurs : Pomorska-Mól M. et al.
     Source : BMC Veterinary Research

     Date de publication : 7 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 février 2022)

Étude rétrospective sur la présence d’anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 chez 343 chiens, 279 chats et 29 lapins domestiques pendant les vagues pandémiques de COVID-19 survenues en Pologne. Entre 1 et 2 % des chiens et des chats étaient séropositifs ; en revanche tous les lapins se sont révélés négatifs.
   
     Auteurs : Vesga O. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 29 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs montrent que l’utilisation en Colombie de chiens renifleurs dans des conditions maîtrisées permet de discriminer très efficacement et rapidement les personnes infectées par le SARS-CoV-2 de celles qui sont saines, mais constatent aussi que dans « la vraie vie » le nombre de faux positifs peut s’avérer très élevé (faible valeur prédictive d’un résultat positif).
 
     Auteurs : Yaglom H. D. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 29 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Dans le cadre d’un programme conduit en Arizona (États-Unis d’Amérique) visant à mesurer l’impact du SARS-CoV-2 sur les animaux de compagnie dans des foyers où des cas de COVID-19 chez des personnes ont été confirmés, l’infection d’un chien et d’un chat par le SARS-CoV-2 (lignage B.1.575) a été mise en évidence sans que ceux-ci présentent le moindre symptôme.
     Auteurs : Ito G. et al.
     Source : Journal of Veterinary Medical Science

     Date de publication : 24 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

Enquête sérologique pour la recherche de l’infection par le SARS-CoV-2 réalisée au Japon dans la région de Tokyo à partir d’échantillons sanguins prélevés sur des chiens entre juillet 2020 et janvier 2021. Seuls trois chiens ont présenté un résultat positif à l’épreuve ELISA et un seul à l’épreuve de neutralisation virale.
 
     Auteurs : Han T. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 17 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

Un foyer de COVID-19 étant apparu dans un établissement religieux de la Corée du Sud en janvier-février 2021, le suivi de trois chats y a été assuré. Si l’un d’entre eux a été infecté par le SARS-CoV-2, aucune transmission de ce virus de chat à chat où du chat à une personne n’a été mise en évidence.
 
     Auteurs : Schiaffino F. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 17 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Pour la première fois au Pérou (Lima), il a été confirmé grâce à des prélèvements pharyngés que des chats présentés dans une clinique vétérinaire avec des symptômes respiratoires et gastro-intestinaux étaient infectés par le variant Lambda du SARS-CoV-2. Ces chats vivaient dans des familles où des cas de COVID-19 avaient été signalés.
 
     Auteurs : Goryoka G. W. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 12 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Résultats d'une enquête réalisée en avril et mai 2020 chez les chiens et chats de 34 familles de l'Utah et du Wisconsin (USA) où des cas humains de COVID-19 ont été confirmés. A partir de ces animaux ont ainsi été pratiqués des examens par RT-PCR et épreuve de neutralisation virale sur des prélèvements sanguins, nasaux, oropharyngés, fécaux et de fourrure. 
 
     Auteurs : Cossaboom C. M. et al.
     Source : Biology

     Date de publication : 11 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

Résultats d’une enquête sérologique réalisée chez des chiens et des chats maintenus dans quatre refuges des États-Unis d’Amérique qui ont été en contact au sein de ces structures avec des soigneurs dont l’infection par le SARS-CoV-2 a été confirmée. Seul un chien s’est révélé posséder des anticorps neutralisants dirigés contre le virus.
 
     Auteurs : Keller M. et al.
     Source : Research in Veterinary Science

     Date de publication : 9 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

Premier cas complètement documenté de SARS-CoV-2 dû au variant B.1.1.7 signalé en Allemagne chez un chat malade dont le propriétaire présentait lui-même des symptômes de COVID-19.
 
     Auteurs : Rivero R. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 7 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

L’article signale la première transmission du variant iota du SARS-CoV-2 d’un être humain à des chiens (avec apparition de symptômes chez ces derniers) en Amérique latine. Les auteurs recommandent que tout contact rapproché entre personnes infectées par le virus et animaux de compagnie soit évité afin de prévenir l’apparition de nouvelles mutations significatives en matière de santé publique.
 
     Auteurs : Decaro N. et al.
     Source: Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 1er septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Suivi sur plusieurs mois de la persistance des anticorps spécifiques au SARS-CoV-2 chez un petit nombre de chiens et de chats infectés.
 
     Auteurs : Jara L. M. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 26 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Recherche d’anticorps neutralisants dirigés contre le SARS-CoV-2 chez des chats vivant dans des communautés humaines fortement infectées à Lima (Pérou).
 
     Auteurs : van der Leij W. J. R. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 18 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Résultats d’une enquête sérologique et virologique réalisée pendant la deuxième vague de COVID-19 aux Pays-Bas sur des échantillons prélevés chez des chats détenus dans des refuges répartis en différents endroits du territoire. Très peu de chats ont présenté des anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Račnik J. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 10 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Cas de transmission du SARS-CoV-2 d’un propriétaire à son furet détenu comme animal de compagnie au sein d’une famille de Slovénie.
 
     Auteurs : Barua S. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 10 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Résultats d’une enquête sérologique relative au SARS-CoV-2 utilisant des sérums de chiens et de chats prélevés en 2020 dans 48 États des États-Unis d’Amérique pour le titrage des anticorps rabiques.
 
     Auteurs : Smith S. L. et al.
     Source : Current Research in Virological Science

     Date de publication : 5 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Résultats de la première étude sérologique sur le SARS-CoV-2 conduite à grande échelle au Royaume-Uni chez les chiens et les chats à partir de sérums collectés pour des examens hématologiques de routine à trois périodes : avant l’émergence de la COVID-19 (janvier 2020), pendant la première vague de la maladie dans la population humaine (avril-mai 2020) et pendant la deuxième vague (septembre 2020 – février 2021).
 
     Auteurs : Curukoglu A. et al.
     Source : Australian Veterinary Journal

     Date de publication : 29 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Etude rapportant pour la première fois une transmission directe d’un homme à un chat vivant sous le même toit, du variant B.1.1.7 du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Jendrny P. et al.
     Source : BMC Infectious Diseases

     Date de publication : 27 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Entraînement de dix chiens à détecter l'infection par le SARS-CoV-2 à l'aide d'échantillons de salive ayant subi une inactivation par la bêta-propiolactone, puis mesure, par épreuve en double aveugle, de la capacité de ces chiens à reconnaître la présence du virus dans des prélèvements non inactivés de salive, d'urine et de sueur humaines.
 
     Auteurs : Klaus J. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 26 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)

Résultats d’une enquête par RT-PCR menée chez 877 chiens et 260 chats pour la recherche d’une infection par le SARS-CoV-2 dans sept cliniques vétérinaires du sud de l’Allemagne et du nord de l’Italie pendant la première vague de la pandémie de COVID-19 (de mars à mai 2020). Très peu d’animaux se sont révélés positifs, montrant que le risque zoonotique encouru par le personnel vétérinaire est resté faible pendant cette première vague.
 
     Auteurs : Stevanovic V. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 22 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Résultat des investigations menées en Croatie sur deux populations de chiens au regard du SARS-CoV-2 : des chiens présentés à l’école vétérinaire pour une quelconque raison et d’autres hébergés dans des familles où des cas humains de COVID-19 ont été confirmés.

     Auteurs : Laidoudi Y. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 18 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Résultats d’une enquête sérologique relative au SARS-CoV-2 (ELISA, Western blot automatisé) conduite dans différents départements français chez des chiens à partir de prélèvements collectés avant et pendant la pandémie de COVID-19 dans la population humaine.
 
     Auteurs : Vlachová L. et al.
     Source : medRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Entraînement en République tchèque de chiens à la détection de cas humains de COVID-19 à partir des odeurs corporelles ou respiratoires recueillies sur des personnes hospitalisées.
 
     Auteurs : Lauzi S. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 13 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Cette étude visait à vérifier si les chiens et les chats pouvaient jouer le rôle de vecteurs passifs du SARS-CoV-2 lorsqu’ils vivent en contact étroit avec des personnes atteintes de la COVID-19. A cette fin, des prélèvements cutanés et interdigités ont été collectés chez 48 chiens et 15 chats et soumis à une épreuve de RT-PCR. Tous les résultats obtenus ont été négatifs.
 
     Auteurs : Zhang Z. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 7 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Étude fine de l’interface entre le domaine d’attachement au récepteur de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et le récepteur ACE2 du chien. Les auteurs montrent aussi le rôle pivot joué par certaines mutations dans la force de cette liaison. 
 
     Auteurs : Udom K. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 28 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Résultats d'une enquête sérologique relative au SARS-CoV-2 conduite chez des chiens et des chats en Thaïlande d'avril à décembre 2020, période de la première et la deuxième vague de COVID-19 dans le pays.
 
     Auteurs : Stranieri A. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 25 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Résultats d'une enquête relative au SARS-CoV-2 (recherche d'ARN et d'anticorps dirigés contre le virus) conduite sur des chats libres appartenant à des colonies vivant dans un district de la province de Lodi (Italie), là où l'épidémie de COVID-19 est apparue dans la population humaine et y a sévi avec une forte incidence.
 
     Auteurs : Angeletti S. et al.
     Source : Journal of Medical Virology

     Date de publication : 21 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Description du protocole d’entraînement de chiens renifleurs mis en œuvre au centre hospitalier universitaire de Rome (Italie) pour détecter les personnes infectées par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : D’Aniello B. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 21 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs passent en revue les difficultés pratiques et les problèmes éthiques qui existent dans l’utilisation de chiens renifleurs pour repérer les personnes infectées par la COVID-19.
 
     Auteurs : Dileepan M. et al.
     Source : Virulence

     Date de publication : 14 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)

Résultats d'une enquête sérologique relative au SARS-CoV-2 ayant porté sur 239 chats et 510 chiens de compagnie dans l'État du Minnesota (États-Unis d'Amérique) de mi-avril à début juin 2020, alors que la pandémie de COVID-19 dans la population humaine y était à son début.

     Auteurs : Gortázar C. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 12 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Étude sur le SARS-CoV-2 conduite chez 71 furets utilisés pour la chasse dans la province de Ciudad Real (Espagne centrale), qui amène à conclure que l’infection de ces animaux peut intervenir lorsque la circulation virale est élevée dans la population humaine, mais que de telles populations réduites de furets sont incapables de maintenir par elles-mêmes une circulation virale prolongée.
 
     Auteurs : Hag-Ali M. et al.
     Source : Communications Biology

     Date de publication : 3 juin 2021 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Sur la base des résultats obtenus en utilisant des chiens renifleurs aux Émirats arabes unis, les auteurs considèrent que ces animaux permettent de mieux détecter les personnes asymptomatiques infectées par le SARS-CoV-2 que l’utilisation de la RT-PCR.
 
     Auteurs : van Aart A. E. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 3 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

L’étude fournit des informations sur le statut sanitaire de chats (domestiques ou libres) et de chiens présents dans 10 élevages de visons infectés par le SARS-CoV-2. Elle montre qu’une transmission directe du virus a pu se produire entre visons et chats sans passer par l’intermédiaire d’une personne.
 
     Auteurs : Michelitsch A. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 27 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)

Résultats d'une enquête sérologique relative au SARS-CoV-2 ayant porté sur plus de 1 100 chats en Allemagne de septembre 2020 à février 2021, qui montre un doublement des chats positifs par rapport à une enquête antérieure, à un moment où était notée une augmentation des cas d'infection dans la population humaine.
 
     Auteurs : Schulz C. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 26 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Suivi sanitaire de trois chats vivant dans une maison de retraite située en Allemagne où plusieurs épisodes de COVID-19 se sont produits parmi les résidents. Seul l’un de ces chats a été infecté par le SARS-CoV-2 sans que celui-ci manifeste le moindre symptôme et ne joue le moindre rôle dans la propagation du virus aux résidents.
 
     Auteurs : Guest C. et al.
     Source : LSHTM

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 24 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Après étude du profil organique des composés organiques volatiles (COV) contenus dans l’air expiré par des personnes saines et d’autres atteintes par la COVID-19, des chiens renifleurs ont été soumis à un essai en double aveugle pour déterminer leur capacité à détecter des différences entre les COV de ces deux groupes de personnes, afin de calculer la sensibilité et la spécificité de ce système de diagnostic canin et, par modélisation mathématique, d’estimer l’apport qui pourrait en être tiré pour le dépistage.
 
     Auteurs : Hamer S. A. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 19 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)

Etude longitudinale conduite au Texas, par RT-PCR, séquençage du génome et sérologie, sur des chiens et des chats vivant dans des familles où au moins une personne a été infectée par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Sánchez-Montes S. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 16 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)

L’objectif de cette recherche était de détecter la présence du SARS-CoV-2 chez des chiens et des chats dans l’État de Veracruz au Mexique, où la transmission du virus dans la population humaine est importante. Tous les résultats des épreuves réalisées sur 130 prélèvements d’animaux ayant été en contact avec des cas humains avérés de COVID-19 se sont révélés négatifs.
 
     Auteurs : Decaro N. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 12 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 mai 2021)

Suivi de l’infection d’un chien par le SARS-CoV-2 dans une famille italienne dont plusieurs membres ont été atteints par la COVID-19.
 
     Auteurs : Colitti B. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 11 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 mai 2021)

Résultats d’une enquête sérologique conduite en Italie avec l’aide de vétérinaires praticiens chez des chiens et des chats dont les détenteurs ont été infectés par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Hamer S. A. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 6 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 16 mai 2021)

Une étude longitudinale de suivi conduite au Texas (Etats-Unis) sur des animaux de compagnie vivant dans des familles où des cas de COVID-19 se sont produits a révélé l’infection d’un chien et un chat par le variant B.1.1.7 du SARS-CoV-2. C’est la première fois que ce variant a été mis en évidence chez un animal.
 
     Auteurs : Grandjean D. et al.
     Source : Open Access Journal of Veterinary Science & Research

     Date de publication : 4 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Résultats obtenus en évaluant le flair de 21 chiens appartenant aux ministères de l’intérieur des différents émirats des Emirats arabes unis pour la détection de la COVID-19 à partir de sueur humaine.
 
     Auteurs : Calvet G. A. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 28 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Étude de l’exposition au SARS-CoV-2, de l’état infectieux et de la persistance du virus chez des chiens et des chats vivant à Rio de Janeiro (Brésil) dans des familles où des personnes ont été infectées par le virus, et suivi des modifications cliniques et biologiques associées à l’infection animale.
 
     Auteurs : Chaintoutis S. C. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 28 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Suivi par différentes méthodes de laboratoire de deux chats infectés par le SARS-CoV-2 alors que leur propriétaire présentait des signes cliniques de COVID-19.
 
     Auteurs : Meisner J. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 mai 2021)

Suivi sanitaire de chiens (signes cliniques, PCR sur prélèvements nasopharyngés, sérologie) entretenus dans des foyers de deux États américains où au moins un cas humain de COVID-19 a été détecté, et mise en évidence de deux facteurs susceptibles de favoriser la transmission du virus responsable des détenteurs à leurs animaux : nombre de cas de COVID-19 dans la maisonnée et accueil du chien dans le lit.
 
     Auteur : Hosie M. J. et al.
     Source : VetRecord

     Date de publication : 22 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Suivi de deux chats appartenant à des familles du Royaume-Uni où la COVID-19 s’est manifestée, qui se sont révélés infectés par le SARS-CoV-2 d’origine humaine.
 
     Auteurs : Sawatzki K. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 15 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Les auteurs montrent qu’il existe chez les furets une barrière d’espèce qui limite l’infection et la transmission naturelles du SARS-CoV-2, en en donnant pour preuve l’absence de contamination de 29 furets par deux adultes à leur contact dont l’un présentait des symptômes de COVID-19 et l’autre était suspect, et en démontrant l’existence de facteurs génétiques chez ces animaux qui leur confèrent une résistance naturelle au virus.
 
     Auteurs : Essler J. L. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 14 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 avril 2021)

Cette étude a visé à déterminer si des chiens entraînés étaient à même de discriminer des patients infectés par le SARS-CoV-2 de patients qui ne l’étaient pas, à partir de prélèvements de leurs urines ayant subi un traitement d’inactivation, et aussi de voir si ces mêmes chiens pouvaient détecter la présence du virus dans des prélèvements salivaires traités par la chaleur provenant de patients hospitalisés du fait de la COVID-19.
 
     Auteurs : Gaudreault N. N. et al.  
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 2 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Par différentes méthodes de suivi, les auteurs examinent si des chats déjà exposés une première fois au SARS-CoV-2 peuvent être infectés une seconde fois et transmettre dans ce cas-ci le virus à leurs congénères.
 
     Auteurs : Dias H. G. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 25 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)

Résultat des analyses de laboratoire (RT-PCR et PRNT) conduites de juin à août 2020 à Rio de Janeiro (Brésil) sur des chiens et des chats avec propriétaires ainsi que des chiens et des chats errants.
 
     Auteurs : Zhao S. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 24 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)

Résultats d’une enquête sérologique relative au SARS-CoV-2 conduite aux Pays-Bas sur 500 chiens et chats en avril et mai 2020.
 
     Auteurs : Zaeck L. M. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 23 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Description des zones d’infection par le SARS-CoV-2 dans le tractus respiratoire du furet par une technique déclarée comme nouvelle par les auteurs : l’imagerie tridimensionnelle par immunofluorescence (volumetric three-dimensional immunofluorescence imaging).
 
     Auteurs : Ferasin L. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 18 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

Première description de chiens et de chats infectés par le variant britannique du SARS-CoV-2 à partir de leurs maîtres. Ces animaux de compagnie, des environs de Londres (Royaume-Uni), ont manifesté des symptômes de cardiopathie atypiques mais sans signe respiratoire préalable.
 
     Auteurs : Klaus J. et al.
     Source : Viruses

    Date de publication : 17 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Description des recherches conduites sur deux chats vivant avec des personnes atteintes par la COVID-19 en Suisse. L’un de ces chats a manifesté des signes respiratoires dus à son infection par le SARS-CoV-2 et, fait intéressant, de l’ARN viral a été retrouvé non seulement sur les prélèvements buccaux, nasaux et fécaux effectués sur lui mais aussi sur sa fourrure ainsi que sur son matériel de couchage.
 
     Auteurs : Kutter J. S. et al.  
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 12 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Grâce à un nouveau dispositif expérimental, les auteurs ont démontré que tant le SARS-CoV que le SARS-CoV-2 peuvent être transmis entre furets à plus d’un mètre de distance par voie aérienne.
 
     Auteurs : Villanueva-Saz S. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 9 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

En vue de révéler la possible circulation du SARS-CoV-2 et d'autres agents pathogènes parmi les chats libres de la ville de Saragosse (Espagne), des prélèvements sanguins ont été collectés sur 114 de ces animaux entre janvier et octobre 2020. Quatre chats ont fourni un résultat positif à la recherche du SARS-CoV-2 par la technique ELISA.
 
     Auteurs : Eskandari E. et al.
     Source : BMC Infectious Diseases

     Date de publication : 5 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

Etude destinée à examiner la possibilité d’utiliser le flair de chiens pour détecter les personnes atteintes de COVID-19 ou porteuses du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Neira V. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 5 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)

Description de l’infection par le SARS-CoV-2 chez deux personnes adultes et trois chats vivant sous le même toit, par RT-PCR, ELISA, séquençage viral et isolement viral.
 
     Auteurs : Braun K. M. et al.  
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 26 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)

En prenant le chat pour modèle, les auteurs s’intéressent aux mécanismes d’évolution par lesquels le SARS-CoV-2 s’adapte aux mammifères hôtes, et considèrent les goulots d’étranglement (réduction significative de la population virale durant la transmission) qui influent sur la vitesse d’adaptation du virus à ses hôtes.
 
     Auteurs : Pagani G. et al.
     Source : Pathogens

     Date de publication : 23 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Description d'un cas de transmission du SARS-CoV-2 entre un soignant et son chat, et analyse du génome viral complet à partir de prélèvements nasopharyngés collectés sur les deux sujets.
 
     Auteurs : Monchatre-Leroy E. et al.
     Source : Journal of General Virology

     Date de publication : 19 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Cette étude décrit les observations faites après infection intranasale de furets et de hamsters avec de faibles doses de l’isolat français UCN19 du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Perisé-Barrios A. J. et al.  
     Source : Veterinary Research

     Date de publication : 15 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)

Suivi de 40 chiens à maladie respiratoire, dans le contexte de l’épidémie de COVID-19 en Espagne. Si des anticorps (IgG) ont été mis en évidence chez certains chiens, aucune RT-PCR positive n’a été obtenue par les auteurs, même chez les chiens les plus sévèrement atteints.
 
     Auteurs : Decaro N. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 10 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)

En passant en revue les connaissances acquises à fin 2020, les auteurs constatent que les chiens et les chats ne jouent pas de rôle actif dans la transmission du SARS-CoV-2 à l’Homme, mais qu’ils peuvent être infectés par ce virus à la suite de contacts rapprochés avec des personnes atteintes.
 
     Auteurs : Zhao Y. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 7 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Enquête sérologique réalisée de janvier à septembre 2020 sur 910 chiens de différentes catégories (abandonnés, animaux de compagnie dans des hôpitaux, appartenant à des familles où des cas de COVID-19 sont apparus, ou utilisés par la police) à Wuhan (République populaire de Chine) au cours de la pandémie survenue dans cette municipalité.
 
     Auteurs : Chiba S. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 7 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Les auteurs montrent que les chats peuvent guérir d’une infection par le SARS-CoV-2, mais que subsistent chez eux une inflammation et des lésions pulmonaires sans qu’ils manifestent des signes cliniques.
 
     Auteurs : Kim Y-I. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 7 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Les auteurs ont examiné chez le furet le lien pouvant exister entre titres en anticorps sériques et réinfection par le SARS-CoV-2. Chez les animaux ayant un titre élevé, ils ont constaté une faible réplication virale, une élimination rapide du virus et des processus inflammatoires limités. La transmission virale directe à des congénères ne se produit qu’avec les animaux à titre faible.
 
     Auteurs : Michelitsch A. et al.
     Source : Vaccines

     Date de publication : 17 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)

Résultats d’une grande enquête conduite en Allemagne entre avril et septembre 2020 sur la présence d’anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 dans la population de chats domestiques, en vue d’évaluer la fréquence de transmission du virus de l’Homme au chat.
 
     Auteurs : Grandjean D. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 10 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Cette étude limitée montre que des chiens entraînés ont la capacité de différencier des prélèvements de sueur provenant d’individus présentant des symptômes de COVID-19 ainsi qu’une épreuve PCR positive, de ceux collectés sur des individus asymptomatiques et à PCR négative.
 
     Auteurs : Patterson E. I. et al.  
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 4 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Étude à grande échelle portant sur le statut virologique et sérologique vis-à-vis du SARS-CoV-2 de chiens et chats détenus dans des familles vivant en Italie du Nord.

     Auteur : Else H.
     Source : Nature

     Date de publication : 23 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Revue des connaissances sur la capacité des chiens à reconnaître par leur flair la COVID-19 chez des personnes malades.
 
     Auteurs : Stevanovic V. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 15 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Résultats d’une enquête sérologique conduite en Croatie sur des chiens et des chats dans un établissement d’enseignement vétérinaire de Zagreb et deux cabinets vétérinaires et d’une autre intéressant le personnel de la faculté de médecine vétérinaire de Zagreb.
 
     Auteurs : Fritz M. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 4 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les auteurs présentent les résultats d’une enquête sérologique sur le SARS-CoV-2 conduite chez des chiens et des chats en mai et juin 2020 en Franche-Comté et en Rhône-Alpes. Ils montrent également l’absence de réaction croisée avec la péritonite infectieuse féline.
 
       Auteurs : Gaudreault N. N. et al.
       Source : Emerging Microbes & Infections

       Date de publication : 25 octobre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)

Les auteurs ont infecté expérimentalement par voie orale et nasale des chats âgés de 4-5 mois, puis mis d'autres jeunes chats à leur contact. Ils ont assuré pendant 21 jours post-infection divers suivis (signes cliniques, recherche du virus dans divers prélèvements, anatomo-pathologie, examens sérologiques). Tous les chats possédaient des anticorps neutralisants aux jours 7 et 10 post-infection, mais ils n'ont manifesté à aucun moment des signes cliniques dans le cours de l'expérimentation.
 
 
 
     Auteurs : Barrs V. R. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 30 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Recherche de l’ARN du SARS-CoV-2 dans des échantillons respiratoires et fécaux de 50 chats en contact étroit avec des familles infectées habitant à Hong Kong.
 
     Auteurs : Bosco-Lauth A. M. et al.
     Source : PNAS
     Date de publication : 29 septembre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 octobre 2020)
L’article décrit une étude pilote visant à tester la sensibilité de chats et chiens domestiques vis-à-vis du SARS-CoV-2. Seuls les chats ont excrété le virus et l’ont transmis à des congénères. Les chats réinfectés expérimentalement ont montré une immunité solide.
 
     Auteurs : Perisé-Barrios A. J. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de publication : 22 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 octobre 2020)

Suivi de 40 chiens à maladie respiratoire, dans le contexte de l’épidémie de COVID-19 en Espagne. Si des anticorps (IgG) ont été mis en évidence chez certains chiens, aucune RT-PCR positive n’a été obtenue par les auteurs, même chez les chiens les plus sévèrement atteints.
 
     Auteurs : Zhang Q. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 17 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Suivi sérologique par ELISA de chats entretenus dans la ville de Wuhan (République populaire de Chine), montrant que certains de ces animaux ont été infectés par le SARS-CoV-2 durant la pandémie de COVID-19.
 
     Auteurs : Temmam S. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 29 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

L’article rapporte l’absence d’anticorps chez les chiens et les chats détenus par un groupe d’étudiants vétérinaires atteints par la COVID-19.
     Auteurs : Ruiz-Arrondo I. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 18 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Parmi 23 animaux de compagnie appartenant à des propriétaires atteints par la COVID-19 en Espagne, des résultats positifs à la RT‐qPCR ont été obtenus à partir d’échantillons oropharyngés prélevés sur un chat ne présentant pas de symptômes, ce qui amène à considérer que des chats en contact avec une personne atteinte peuvent être infectés par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Garigliany M. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 15 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Investigations menées sur un chat ayant manifesté une maladie respiratoire sévère, alors que des examens de laboratoire avaient montré une semaine auparavant que son maître était atteint par la COVID-19.
 
     Auteur : Grimm D.
     Source : ScienceMag.org

     Date de publication : 14 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)

L’article fait le point sur ce qu’on peut dire à ce jour de l’infection des chiens et des chats par le SARS-CoV-2 et met l’accent sur les questions qui restent encore sans réponse.
 
     Auteurs : Jendrny P. et al.
     Source : BioMed Central Infectious Diseases

     Date de publication : 23 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Résultats préliminaires indiquant que des chiens renifleurs peuvent repérer les individus malades de la COVID-19 en utilisant pour échantillons à tester des sécrétions respiratoires.
 
     Auteurs : Richard M. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 8 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Il est ici démontré expérimentalement que le SARS-CoV-2 est efficacement transmis entre des furets par contact direct et par voie aérienne (gouttelettes respiratoires et/ou aérosols) respectivement un à trois jours et trois à sept jours après exposition au virus.
 
     Auteurs : Saegerman C. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases - 2020 Jul 11.
     Date de publication : 6 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 août 2020)
 
     Auteurs : Stout A. E. et al.    
     Source : Veterinary Microbiology

     Date de publication : le 23 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)

Les auteurs passent en revue les cas d’infection par le SARS-CoV-2 du chat, du furet et du chien. Ils décrivent les relations entre ce virus et les coronavirus « naturels » connus pour infecter ces espèces, et discutent de leur sensibilité relative sur la base du récepteur ACE-2.
 
     Auteur : Escalon S.
     Source : CNRS Le Journal
     Date de publication : 19 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteur : Scanelis
     Source : La Dépêche vétérinaire
     Date de publication : 11 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteurs : Sailleau C. et al.
     Source : Transbound Emerg Dis. 2020 Jun 5;10.1111/tbed.13659.
     Date de publication : 5 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteur : ProMED
     Source : ProMED
     Date de publication : 2 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
    Auteurs : Bosco-Lauth A.M. et al.
    Source : bioRxiv preprint
    Date de publication : 28 mai 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
   Auteurs : Shi J. et al.
   Source : Science. 2020 May 29;368(6494):1016-1020.
   Date de publication : 28 mai 2020 (preprint bioRxiv : 30 mars 2020) - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
    Auteurs : Sit T.H.C. et al.
    Source : Nature
    Date de publication : 14 mai 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
    Auteurs : Halfmann P.J. et al.
    Source : The New England Journal of Medicine
    Date de publication : 13 mai 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteur : Risk Assessment Group-COVID-19 Animals (Belgique)  
     Source : RAGCA

     Date de publication : 11 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Le groupe d’évaluation belge passe en revue les connaissances sur la capacité que pourraient présenter des « chiens renifleurs » à détecter des personnes infectées par le SARS-CoV-2. Il constate l’absence de résultats probants sur ce point (au moment de l’établissement du rapport).
 
     Auteur : Parry N.M.A.
     Source : Forensic Science International: Reports

     Date de publication : 11 avril 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Bien que rien ne démontre que les animaux de compagnie puissent transmettre le SARS-CoV-2 à l’être humain, nombre de personnes ont craint qu’ils jouent un rôle dans la propagation de la COVID-19, ce qui a conduit à des cas d’abandon ou même de sacrifice de ces animaux. L’article souligne combien la pandémie a eu un impact négatif sur leur bien-être.
 
     Auteurs : Kim Young-Il et al.
     Source : Cell Host & Microbe

     Date de publication : 6 avril 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Les auteurs apportent la preuve expérimentale que les furets sont sensibles au SARS-CoV-2, et donnent les résultats de leurs investigations cliniques, anatomo-pathologiques, etc. Ils démontrent aussi que les furets infectés peuvent transmettre le virus à leurs congénères.

     Auteurs : Luan et al.
     Source : Biochemical and Biophysical Research Communications 526 (2020) 165-169
     Date de publication : 9 mars 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 août 2020) 
 
 

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Thème 1 : Le SARS-CoV-2 au sein des Coronavirus

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     Auteur : Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de publication : 26 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)

Synthèse sur les connaissances et les interrogations actuelles relatives à l’infection des cerfs de Virginie par le SARS-CoV-2 en Amérique du Nord, avec mention dans les références de l’ensemble des articles parus sur ce sujet à la date de rédaction de cette synthèse.
 
     Auteurs : Pereira A. HB. et al.
     Source : Journal of Comparative Pathology

     Date de publication : 26 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 mai 2022)

Description d’un cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez un ouistiti à queue noire sauvage (Mico melanurus) mort à la suite d’une collision avec un véhicule dans la ville de Cuiabá au Mato Grosso (Brésil). Il s’agit de la première description d’un cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez un singe du Nouveau Monde.
 
     Auteurs : Chidoti V. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 9 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)

Résultats d’une enquête effectuée entre août 2020 et juillet 2021 pour identifier les coronavirus circulant dans les colonies de chauves-souris insectivores sur deux sites d’un district du Zimbabwe où les contacts entre ces animaux et la population humaine sont fréquents. Différents bêtacoronavirus (dont des sarbecovirus autres que le SARS-CoV-2) ont été identifiés à partir de prélèvements fécaux de diverses espèces de chauves-souris.
 
     Auteurs : Moreira-Soto A. et al.
     Source : Microorganisms

     Date de publication : 30 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)

Aucun des prélèvements provenant de cervidés européens (67 cerfs élaphes, 94 chevreuils, 68 daims) d’Allemagne et d’Autriche collectés en période de pandémie n’a fourni un résultat positif à la recherche d’anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2. Les auteurs avancent quelques hypothèses pour expliquer ce contraste avec la situation prévalant chez les cerfs de Virginie en Amérique du Nord.
 
     Auteur : ProMED
     Source : ProMED

     Date de publication : 29 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Confirmation d’un premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 d’un cerf mulet (Odocoileus hemionus) dans l’État de l’Utah aux États-Unis d’Amérique.
 
     Auteurs : Holding M. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 25 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Au Royaume-Uni, des sérums ont été collectés en 2020 et 2021 chez six espèces de cervidés et un hybride. Aucune des épreuves pour la recherche du SARS-CoV-2 effectuées sur ces sérums n’a fourni un résultat positif. Les auteurs en concluent que, sur la période de l’étude, la population humaine n’a pas transmis le SARS-CoV-2 à la population de cervidés et que ce virus n’a pas circulé à l’intérieur de celle-ci.
     Auteurs : AboElkhair M. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 23 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Résultats des examens effectués par RT-PCR pour la recherche de l’infection par le SARS-CoV-2 chez des chauves-souris (Rousettus aegyptiacus), des oiseaux sauvages et des chiens entre novembre 2020 et juin 2021 en Égypte. Tous les résultats se sont révélés négatifs.
 
     Auteurs : Chidoti V. et al.
     Source : Preprints

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 23 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Résultats d’une enquête effectuée entre août 2020 et juillet 2021 pour identifier les coronavirus circulant dans les colonies de chauves-souris insectivores sur deux sites d’un district du Zimbabwe où les contacts entre ces animaux et la population humaine sont fréquents. Différents bêtacoronavirus (dont des sarbecovirus autres que le SARS-CoV-2) ont été identifiés à partir de prélèvements fécaux de diverses espèces de chauves-souris.
 
     Auteurs : Roundy C. M. et al.
     Source : Microbiology Spectrum

     Date de publication : 23 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)

Une enquête a été conduite dans trois établissements du Texas (États-Unis d’Amérique) entretenant des cerfs pour rechercher leur éventuelle infection par le SARS-CoV-2. Dans l’un d’entre eux, 94,4 % des cerfs de Virginie étaient sérologiquement positifs (soit le double de ce qui a été généralement constaté chez les cerfs vivant en complète liberté). Selon les auteurs, la contamination de la plupart de ces cerfs de Virginie ne peut s’expliquer par un contact avec des personnes mais par la transmission du virus entre animaux. De plus, cette transmission est très vraisemblablement favorisée par le maintien en enclos.
 
     Auteurs : Grome H. N. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 9 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)

Investigations approfondies sur l’atteinte de trois tigres de Malaisie par le SARS-CoV-2 dans un zoo du Tennessee (États-Unis d’Amérique). Les auteurs se sont notamment intéressés aux distances entre le public et les animaux et entre les animaux eux-mêmes ainsi qu’aux précautions prises à l’intérieur de l’établissement et aux pratiques des soigneurs. Ils ont aussi comparé les caractéristiques génétiques des souches virales obtenues à partir des animaux et des soigneurs. Ils considèrent comme possible la contamination d’un soigneur par l’un de ces tigres.
 
     Auteurs : Nga N. T. T. et al.
     Source : Frontiers in Public Health

     Date de publication : 9 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)

Les chercheurs se sont intéressés aux sources possibles de sarbecovirus proches du SARS-CoV-2 au Viêt Nam en utilisant des prélèvements provenant de pangolins javanais (Manis javanica) et de pangolins de Chine (Manis pentadactyla) confisqués pour cause de trafic illégal entre 2016 et 2018, et de civettes palmistes communes (Paradoxurus hermaphroditus) élevées dans des fermes du pays. Les arbres phylogéniques construits ont révélé que les sarbecovirus identifiés chez sept pangolins javanais étaient très proches de ceux détectés chez les pangolins confisqués pour cause de commerce illégal au Yunnan et au Guangxi en République populaire de Chine. Des informations sont aussi fournies sur le commerce des animaux précités et de leurs produits au Viêt Nam.
 
     Auteurs : Arteaga F. L. et al.
     Source : International Journal of Infectious Diseases

     Date de publication : 1er mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Des prélèvements pharyngés et rectaux ont été collectés sur des chauves-souris insectivores ou hématophages dans deux États d’Argentine. Les résultats préliminaires obtenus par cette enquête ont montré que seuls des alphacoronavirus circulent dans ces populations.
 
     Auteurs : Kotwa J. et al.
     Source : International Journal of Infectious Diseases

     Date de publication : 1er mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Des prélèvements oraux et rectaux ont été collectés de septembre 2020 à janvier 2021 sur 207 ratons-laveurs et 57 mouffettes rayées dans le sud de l’Ontario (Canada), zone où l’incidence du SARS-CoV-2 était élevée dans la population humaine, offrant la possibilité d’une contamination de ces espèces sauvages. La présence d’ARN viral n’a été retrouvée dans aucun des prélèvements.
 
     Auteurs : Wernike K. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 23 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

Sur des prélèvements collectés pendant la saison de chasse 2021-2022 en Allemagne, les auteurs ont recherché la présence d’anticorps dirigés contre plusieurs virus, dont le SARS-CoV-2, chez 493 ruminants sauvages (chevreuils, cerfs élaphes, daims, mouflons et un bison d’Europe). En matière de SARS-CoV-2, des résultats positifs avec l’épreuve ELISA ont été obtenu avec un peu plus de 5 % des prélèvements, mais aucun d’entre eux n’a été confirmé par épreuve de neutralisation virale.
 
     Auteurs : Marques A. D. et al.
     Source : medRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 19 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)

Dans l’État de Pennsylvanie (États-Unis d’Amérique), 93 cerfs de Virginie ont été soumis à prélèvements nasaux pendant l’automne et l’hiver 2021. Près de 20 % de ceux-ci ont fourni un résultat positif à la recherche du SARS-CoV-2 par RT-qPCR. Les variants Alpha et Delta étaient en cause concomitamment, alors que le second avait remplacé le premier dans la population humaine. Il a été aussi observé que les variants Alpha chez ces cerfs avaient divergé significativement de ceux d’origine humaine.
 
     Auteurs : Moreira-Soto A. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 18 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)

Aucun des prélèvements provenant de cervidés européens (67 cerfs élaphes, 94 chevreuils, 68 daims) d’Allemagne et d’Autriche collectés en période de pandémie n’a fourni un résultat sérologique positif à la recherche d’anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2. Les auteurs avancent quelques hypothèses pour expliquer ce contraste avec la situation prévalant chez les cerfs de Virginie en Amérique du Nord.
 
     Auteurs : He W-T. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 16 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)

Recherche de virus chez plus de 1 700 animaux (classés comme gibier) appartenant à 16 espèces de mammifères et répartis dans 19 provinces de la République populaire de Chine. La plupart des prélèvements ont été collectés sur ces animaux après février 2020, majoritairement en élevage ou dans des zoos, mais aussi parfois dans leur habitat naturel. Aucun virus proche du SARS-CoV ou du SARS-CoV-2 n’a été détecté.
  
     Auteurs : Temmam S. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 16 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)

Les auteurs montrent que des rhinolophes vivant dans des grottes situées au nord du Laos hébergent des coronavirus qui diffèrent très peu du SARS-CoV-2 et sont potentiellement infectieux pour l’Homme, notamment du fait que leur spicule possède un domaine d’attachement capable de se lier au récepteur cellulaire humain (hACE2).
 
 
     Auteurs : Padilla-Blanco M. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 14 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)

Dans ce court rapport, les auteurs signalent un cas d’infection par le SARS-CoV-2 d’une loutre d’Europe vivant à proximité d’un réservoir d’eau situé dans la communauté de Valence (Espagne). Les prélèvements effectués sur deux autres loutres vivant dans des sites éloignés de ce point d’eau ont fourni des résultats négatifs à la recherche de ce virus. Les recherches effectuées laissent penser que ce cas d’infection aurait une origine humaine.
 
     Auteurs : Kapczynski D. R. et al.
     Source : Virology

     Date de publication : 12 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)

En vue d’établir un modèle prédictif sur la sensibilité de diverses espèces animales au SARS-CoV-2 à partir de cultures cellulaires, les auteurs ont exprimé les gènes de l’ACE2 et de la protéase TMPRSS2 de ces espèces dans des lignées de fibroblastes aviaires. Ils montrent que les résultats auxquels ils aboutissent sont en accord avec ceux obtenus par épreuves virales réalisées à ce jour chez le chat, le cheval, le porc, la chèvre et le hamster doré. Cela ouvre la voie à l’étude facilitée de la sensibilité au virus d’autres espèces.
 
     Auteurs : Vandegrift K. J. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 7 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)

Parmi 131 cerfs de Virginie soumis à prélèvements à Staten Island (un arrondissement de la ville de New York, États-Unis d’Amérique) en décembre 2021 et janvier 2022, 19 présentaient des anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2, et de l’ARN viral a été détecté sur 7 des 68 cerfs soumis à des prélèvements nasaux. Par séquençage génomique, il a été montré que cette population de cerfs est actuellement infectée par le variant Omicron, qui circule parmi les citoyens de New York.
 
     Auteurs : Porter S. M. et al. 
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 31 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 février 2022)

Les auteurs démontrent par inoculation expérimentale que le renard roux (Vulpes vulpes) peut être infecté par le SARS-CoV-2 et qu’on retrouve le virus dans ses secrétions orales et respiratoires. En revanche, le coyote (Canis latrans) soumis à épreuve virulente n’est pas infecté et n’excrète pas le virus.
 
     Auteurs : Kuchipudi S. et al. 
     Source : PNAS

     Date de publication : 25 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Mise en évidence de l’ARN du SARS-CoV-2 par RT-PCR chez des cerfs de Virginie (Odocoileus virginianus) captifs ou vivant en semi-liberté dans l’Iowa (États-Unis d’Amérique) à partir de prélèvements collectés entre avril et décembre 2020. L’étude des lignées virales présentes et leur distribution géographique suggère la survenue de multiples passages du virus de l’Homme aux cerfs et entre cerfs.
 
     Auteurs : Kotwa J. D. et al. 
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 21 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Résultats d’une enquête sur le SARS-CoV-2 conduite au Québec (Canada) en novembre 2021 chez 258 cerfs de Virginie sauvages. De l’ARN a été détecté dans trois prélèvements nasaux pratiqués dans la région de l’Estrie et le virus a été isolé dans deux prélèvements. Son analyse phylogénique a révélé une proche parenté avec des isolats d’origine humaine obtenus un mois auparavant dans le Vermont (États-Unis d’Amérique).
 
     Auteurs : Davoust B. et al. 
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 20 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)

Des résultats sérologiques positifs pour la recherche du SARS-CoV-2 ont été obtenus chez 5 mustélidés sauvages (3 martres et 2 blaireaux) sur les 33 qui avaient fait l’objet de prélèvements en Bretagne (dans les Côtes-d’Armor et le Morbihan) au cours du premier semestre 2021. Toutefois toutes les épreuves PCR pratiquées à partir des prélèvements nasaux, rectaux, cutanés et sanguins provenant de ces 33 animaux ont fourni des résultats négatifs.
 
     Auteurs : Francisco R. et al. 
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 12 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Démonstration de la sensibilité au SARS-CoV-2 du raton laveur et de la mouffette rayée. Cependant, la faible quantité de virus excrétée par ces animaux, et l'absence de transmission horizontale de l'infection à des congénères, conduit à conclure que ces espèces ne peuvent vraisemblablement pas jouer le rôle de réservoirs du virus.
 
     Auteurs : : Koeppel K. N. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 11 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)

Signalement de cas d’infection par le SARS-CoV-2 en juillet 2020 d’un puma (animal exotique pour le pays) et en juillet 2021 de trois lions africains dans un zoo de Johannesbourg (Afrique du Sud). Les lions ont été infectés par un soigneur. Le variant Delta, circulant dans la population humaine du pays, était en cause.
 
     Auteurs : Alkhovsky S. V. et al. 
     Source : Viruses

     Date de publication : 9 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)

Découverte et étude des caractéristiques génétiques de coronavirus proches du SARS-CoV-2 hébergés par des grands rhinolophes (Rhinolophus ferrumequinum) et des petits rhinolophes (Rhinolophus hipposideros) capturés dans le parc national de Sotchi (sud de la Russie).
 
     Auteurs : Miot E. F. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 13 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)

Il s’agit d’une enquête réalisée entre février et mai 2021 à Hong Kong (Rép. pop. de Chine) sur 217 rongeurs (189 Rattus norvegicus - le rat surmulot, et 28 R. tanezumi – appelé rat d’Asie) dans des zones où le SARS-CoV-2 avait été détecté dans les eaux usées. Aucun ARN du virus n’a été mis en évidence chez ces animaux et un seul d’entre eux a présenté un résultat positif en sérologie. 
 
     Auteurs : Mahajan S. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 12 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)

Les auteurs signalent la confirmation d’un cas d’infection par le variant Delta du SARS-CoV-2 d’un léopard indien (Panthera pardus fusca) sauvage dont le cadavre a été découvert dans un village forestier de l’Uttar Pradesh (Inde). 
 
     Auteurs : Nagy A. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 10 janvier 2022– (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)

Les auteurs décrivent la propagation du variant Alpha du SARS-CoV-2 parmi des gorilles et des félins du zoo de Prague (République tchèque). Ils évoquent les voies par lesquelles ces animaux ont pu être contaminés. 
 
     Auteurs : Melo F. L. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 7 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 16 janvier 2022)

Démonstration de la contamination par le SARS-CoV-2 de lamantins des Antilles (Trichechus manatus manatus) détenus dans un centre brésilien de recherche et de conservation d’animaux aquatiques (techniques employées : RT-PCR et RT-LAMP-PCR (amplification isotherme médiée par les boucles) sur des prélèvements nasaux).
 
     Auteurs : Hale V. L. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 23 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Confirmation, à partir de prélèvements pratiqués entre janvier et mars 2021, de l’infection par le SARS-CoV-2 de cerfs de Virginie (Odocoileus virginianus) vivant en liberté dans neuf sites du Nord-Est de l’État de l’Ohio (États-Unis d’Amérique). Trois lignées du virus ont été détectées. La transmission du virus de l’Homme aux animaux s’est produite plusieurs fois, et la transmission de cerf à cerf a pu aussi intervenir.

     Auteur : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. Department of Agriculture – APHIS

     Date de publication : 21 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Confirmation d’un premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez un lynx du Canada (Lynx canadensis) ayant présenté une toux et de l’abattement dans un zoo de Pennsylvanie (États-Unis d’Amérique). 
 
     Auteurs : Cappelle J. et al. 
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 17 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Pour étudier la diversité et les caractéristiques de circulation des coronavirus chez plusieurs espèces de chauves-souris d’Asie du Sud-Est, il a été procédé à des sessions de capture de ces animaux et à la prise de prélèvements pendant tout leur cycle de reproduction. Les résultats obtenus suggèrent une association entre coronavirus et jeunes chauves-souris, ce qui conduit les auteurs à délimiter la période de surveillance virale la plus propice au cours de l’année.
 
      Auteurs : Palermo P. M et al.
     Source : Vector-borne and Zoonotic Diseases

     Date de publication : 10 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont procédé à la recherche d’anticorps neutralisants dirigés contre le SARS-CoV-2 sur des sérums de cerfs de Virginie archivés en 2018 et d’autres collectés début 2021 dans le comté de Travis au Texas (États-Unis d’Amérique). Si les premiers n’en contenaient pas, les seconds se sont révélés positifs pour plus d’un tiers d’entre eux.
 
     Auteurs : USGS National Wildlife Health Center
     Source : Wildlife Health Bulletin 2021-02

     Date de publication : 7 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

Description du programme mis en place aux États-Unis d’Amérique pour assurer la surveillance du SARS-CoV-2 et des autres coronavirus dans la faune sauvage. Ce programme associe le Centre national sur la santé de la faune sauvage (National Wildlife Health Center) et les CDC ainsi que d’autres agences et laboratoires capables de collecter les échantillons appropriés.
 
      Auteur : ProMED
     Source : ProMED

     Date de publication : 6 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Deux hippopotames du zoo d’Anvers (Belgique) ont présenté pour seuls symptômes des écoulements nasaux anormaux. Les épreuves diagnostiques réalisées à la demande du vétérinaire du zoo ont montré que ces animaux étaient infectés par le SARS-CoV-2. 
 
      Auteurs : Greenhorn J. E. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 3 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Mise en œuvre d’un programme de surveillance du SARS-CoV-2 dans la faune sauvage des provinces de l’Ontario et du Québec (Canada). Les prélèvements ont été effectués entre juin 2020 et mai 2021 sur 776 animaux appartenant à 17 espèces, avec une attention particulière portée au raton-laveur, à la moufette rayée et au vison. Chez aucun des animaux il n’y a eu détection de l’ARN viral ou d’anticorps neutralisant le virus.
 
     Auteur : Environnement et Changement climatique Canada
     Source : Environnement et Changement climatique Canada

     Date de publication : 1er décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Première détection de l’infection par le SARS-CoV-2 de cerfs de Virginie au Canada (dans la province de Québec), à partir de prélèvements collectés début novembre 2021. Comme aux États-Unis d’Amérique, les cerfs prélevés ne présentaient aucun signe de maladie.
 
     Auteurs : de Abreu F. V. S. et al.
     Source : EcoHealth

     Date de publication : 29 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Résultats d’une étude sérologique et virologique conduite sur des prélèvements collectés en novembre 2019 puis de juillet 2020 à février 2021 pour rechercher l’éventuelle infection par le SARS-CoV-2 de quatre espèces de primates néotropicaux vivant en zone urbaine, forestière ou rurale dans les États de Minas Gerais et Rio Grande do Sul au Brésil. Tous les résultats se sont révélés négatifs.
 
     Auteurs : Cool K. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 29 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Recherches sur la sensibilité et la capacité de transmission du SARS-CoV-2 chez le cerf de Virginie (Odocoileus virginianus) adulte (y compris de la mère au fœtus), et résultats obtenus par mise en compétition d’isolats de la lignée américaine originelle du virus (lignée A) avec le variant préoccupant B.1.1.7 (variant alpha) chez des individus coinfectés de cette espèce, et capacité de ces derniers à transmettre l’une ou l’autre lignée à des congénères sentinelles.
      Auteurs : Sherman J. et al.
     Source : Frontiers in Veterinary Science

     Date de publication : 12 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont collecté toutes les données disponibles sur les mesures sanitaires appliquées à l’occasion des transferts d’orangs-outangs en Indonésie pendant les deux premières vagues de COVID-19 (mars 2020 – mars 2021) et ont mis au point, avec des experts et en prenant en compte les lignes directrices internationales disponibles, une grille d’évaluation qualitative des risques sanitaires encourus à l’occasion de telles opérations.
 
      Auteur : Zoo de Denver (USA)
     Source : Zoo de Denver (USA)

     Date de publication : 11 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Première confirmation de cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez deux hyènes tachetées (Crocuta crocuta) détenues par le zoo de Denver (États-Unis d’Amérique). Cette infection, qui survient après celle de lions et de tigres, ne s’est traduite que par de légers symptômes chez ces hyènes. 
 
The high diversity of SARS-CoV-2-related coronaviruses in pangolins alters potential ecological risks  
     Auteurs : Peng M-S. et al.
     Source : Zoological Research

     Date de publication : 10 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 décembre 2021)

Les auteurs ont étudié le génome des coronavirus proches du SARS-CoV-2 isolés chez 163 pangolins saisis dans la province du Yunnan (Rép. pop. de Chine) pour importation illégale et fait l’analyse génomique d’un coronavirus isolé chez un pangolin à queue courte (Manis pendactyla). Leurs résultats, ajoutés à ceux d’autres auteurs, conduisent à penser qu’il existe une grande diversité génétique parmi les coronavirus de pangolins et que ces animaux seraient des hôtes naturels et non pas accidentels de ces virus. 
 
     Auteurs : Delaune D. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 9 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

L’article décrit l’identification d’un virus en relation avec le SARS-CoV-2 chez deux chauves-souris Rhinolophus shameli échantillonnées au Cambodge en 2010.
 
     Auteurs : Chandler J. C. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 3 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Résultats d’une enquête sérologique portant sur le SARS-CoV-2 réalisée chez des cerfs de Virginie vivant en liberté dans quatre États des États-Unis d’Amérique, qui indiquent que des groupes de ces animaux ont été exposés au virus 
 
     Auteurs : Roundy C. M. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 1er novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Recherche conduite dans trois comtés du Texas (États-Unis d’Amérique) en vue de mettre en évidence l’éventuel rôle de transport mécanique du SARS-CoV-2 par des insectes (diptères et blattes) dans une quarantaine de foyers (dont certains possédant des chiens ou des chats) où au moins un cas humain de COVID-19 a été diagnostiqué.
 
     Auteurs : Saeed O. S. et al.
     Source : International Journal of Veterinary Science and Medicine

     Date de publication : 28 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

La recherche de l’ARN du SARS-CoV-2 entreprise sur 800 prélèvements d’organes provenant de 200 roussettes d’Égypte n’a abouti à aucun résultat positif, conduisant les auteurs à penser que cette espèce ne joue pas de rôle dans la circulation actuelle du virus en Égypte.
 
     Auteurs : Platto S. et al.
     Source : Biochemical and Biophysical Research Communications

     Date de publication : 16 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

L’article fournit des informations sur les relations entre chauves-souris et coronavirus, les caractéristiques de ces derniers qui favorisent leur transmission à d’autres espèces, et les régions où cette transmission a une plus forte probabilité de se produire du fait des pratiques humaines (Asie Sud et du Sud-Est). 
 
     Auteurs : Mitchell P. K. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 14 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Atteinte sévère de trois tigres de Malaisie (Panthera tigris jacksoni) à la suite de leur infection par le variant B.1.1.7 (alpha) du SARS-CoV-2 dans un zoo de Virginie (États-Unis d’Amérique). La source de contamination reste inconnue, le public étant maintenu très éloigné des animaux et aucun des soigneurs n’ayant présenté un résultat positif à la recherche du virus.
 
     Auteur : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. D.A. – A.P.H.I.S

    Date de publication : 14 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Signalement d’une nouvelle espèce pouvant être infectée par le SARS-CoV-2 : un coati roux (Nasua nasua – appelé aussi coati brun ou coachi) entretenu dans un zoo de l’Illinois (États-Unis d’Amérique).
 
     Auteur : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. D.A. – A.P.H.I.S

     Date de publication : 6 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Signalement de deux nouvelles espèces pouvant être infectées par le SARS-CoV-2 : un binturong (Arctictis binturong – viverridé asiatique arboricole aussi appelé chat-ours) et un chat viverrin (Prionailurus viverrinus – félin appelé aussi chat pêcheur) hébergés dans un zoo de l’Illinois (États-Unis d’Amérique) ont présenté un résultat positif à des épreuves de recherche du virus.

     Auteurs : Zhao Y et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 29 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

L’article montre que les toupayes de Belanger (Tupaia belangeri), musaraignes arboricoles réparties dans tout le Sud-Est asiatique, sont peu sensibles au SARS-CoV-2. Après infection expérimentale, ils excrètent le virus en faible quantité, et les lésions constatées dans leurs poumons sont peu marquées.
 
     Auteurs : Wickenhagen A. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 28 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont mis en évidence chez l’Homme un gène qui lorsqu’il est absent contribue à des formes plus graves de COVID-19. Ce gène code pour une enzyme « détectrice » de l’ARN double brin, dont la forme prénylée est très active contre le SARS-CoV-2. Cette enzyme prénylée est absente chez les rhinolophidés, ce qui en ferait de très bons réservoirs à virus, sans qu’on puisse expliquer pourquoi cette absence favoriserait la tolérance virale chez ces chauves-souris et un pouvoir pathogène accru chez l’Homme.
 
     Auteurs : Sacchetto L. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 25 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les prélèvements effectués sur 60 singes néotropicaux vivant à proximité des villes de Manaus (État d’Amazonas) et São José do Rio Preto (État de São Paulo), deux lieux de fort impact de l’épidémie de COVID-19 au Brésil, n’ont pas mis en évidence l’infection de ces singes par le SARS-CoV-2 
 
     Auteurs : Wu Z. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 20 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

Résultats d’une enquête sur les coronavirus réalisée à partir de prélèvements pharyngés et rectaux de chauves-souris collectés entre 2016 et 2021 en plus de 700 endroits de République populaire de Chine. Des coronavirus proches du SARS-CoV ont été trouvés mais aucun proche du SARS-CoV-2. Est aussi évoquée la distribution dans le pays des sarbecovirus selon leur diversité génétique et leur homologie avec les deux virus précités.
 
     Auteurs : Mishra A. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 31 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Atteinte par le variant delta du SARS-CoV-2 de lions d’Asie (Panthera leo persica) vivant dans un parc zoologique de Chennai (Tamil Nadu, Inde).
 
     Auteurs : Böszörményi K. P. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 23 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Comparaison de l’évolution de l’infection par le SARS-CoV-2 chez deux espèces de macaques génétiquement proches : le macaque rhésus (Macaca mulatta) et le macaque crabier (Macaca fascicularis). Sont présentés les résultats du suivi clinique, virologique et immunologique après inoculation d’épreuve.
 
     Auteurs : Gomes Von Borowski R. et Trentin D. S.  
     Source : Applied and Environmental Microbiology

     Date de publication : 26 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)

Cette revue s’intéresse à la question de l’infection persistante de chauves-souris par des coronavirus, dont le SARS-CoV-2, de par leur inclusion dans des biofilms. Ces structures leur offrent un environnement permettant leur interaction avec l’hôte et des recombinaisons génomiques. Ce phénomène peut expliquer la persistance et la transmissibilité de coronavirus émergents hautement pathogènes.
 
     Auteurs : Fernández-Bellon H. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 25 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Au cours de la deuxième vague de COVID-19 apparue à Barcelone (Espagne) après l’été 2020, quatre lions ont présenté des signes cliniques d’infection par le SARS-CoV-2 en même temps que trois soigneurs. Ces lions ont été suivis durant plusieurs semaines pour réaliser des examens de laboratoire à partir de différents types de prélèvements. Ils possédaient tous des anticorps neutralisants quatre mois après le diagnostic initial. Le séquençage partiel du génome viral chez l’un des soigneurs a donné un résultat identique aux séquences trouvées chez les lions.
 
     Auteurs : Karikalan M. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 17 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)

Des lions d’Asie (Panthera leo persica) appartenant à des parcs zoologiques ont été atteints par le variant Delta du SARS-CoV-2 dans deux États différents de l’Inde.
 
     Auteurs : Cool K. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Recherches sur la sensibilité et la capacité de transmission du SARS-CoV-2 chez le cerf de Virginie (Odocoileus virginianus) adulte (y compris de la mère au fœtus), et résultats obtenus par mise en compétition d’isolats de la lignée américaine originelle du virus (lignée A) avec le variant préoccupant B.1.1.7 (variant alpha) chez des individus de cette espèce co-infectés, et capacité de ces derniers à transmettre l’une ou l’autre lignée à des congénères sentinelles.
 
     Auteurs : Li L-l. et al.  
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 4 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Découverte d'un nouveau coronavirus apparenté au SARS-CoV-2 chez des chauves-souris dans la province du Yunnan (Rép. pop. de Chine).
 
     Auteur : U.S. Department of Agriculture - Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. Department of Agriculture - Animal and Plant Health Inspection Service

     Date de publication : 28 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Commentaires des autorités officielles sur l’enquête sérologique réalisée par Chandler et al. chez des cerfs de Virginie vivant en liberté dans quatre États des États-Unis d’Amérique. Cette page donne accès à un jeu de questions - réponses sur le sujet.
 
     Auteurs : Crook J. M. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 19 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Découverte chez une chauve-souris britannique (le petit rhinolophe fer à cheval : Rhinolophus hipposideros) d’un sarbecovirus proche du SARS-CoV et du SARS-CoV-2, mais ne présentant pas le site d’attachement au récepteur humain (hACE2), donc sans caractère potentiellement zoonotique. Toutefois les auteurs s’inquiètent des recombinaisons de génomes viraux qui pourraient se produire chez un hôte intermédiaire.
 
     Auteurs : Guo H. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 15 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Mise en évidence par caractérisation génomique et analyse du récepteur viral d’une nouvelle lignée de coronavirus proches du SARS-CoV-2 à partir de prélèvements fécaux collectés sur des chauves-souris capturées dans la localité de Tongguan (province du Yunnan, Rép. pop. de Chine), là où la souche de coronavirus RaTG13 avait été trouvée en 2013.
 
     Auteurs : Hassanin A. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 12 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Les résultats de cette étude montrent que plusieurs régions du Sud-Est du continent asiatique constituent la niche écologique des virus de chauves-souris proches du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Soltani A. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 6 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Première mise en évidence du SARS-CoV-2 par RT-PCR chez des mouches domestiques (Musca domestica) capturées en 2020 dans les environs immédiats de deux hôpitaux situés dans la ville de Shiraz (Iran) et traitant des malades atteints de la COVID-19.
 
     Auteurs : Colombo V. C. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 5 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Collecte de prélèvements sur des rats surmulots capturés dans le réseau d’égouts d’Anvers (Belgique) pour la recherche d’une infection par le SARS-CoV-2 : aucun résultat ne s’est révélé positif. L’article montre aussi que des épreuves sérologiques réalisées sur des prélèvements ne provenant pas de l’Homme peuvent aboutir à des résultats trompeurs.
 
     Auteur : Zoo d’Oakland (USA)
     Source : Zoo d’Oakland (USA)

     Date de publication : 2 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)

Grâce à un don de doses effectué par une entreprise pharmaceutique vétérinaire et l’autorisation à titre expérimental accordée par le Ministère fédéral de l’agriculture, le zoo d’Oakland (États-Unis d’Amérique) a commencé à vacciner contre le SARS-CoV-2 les animaux qu’il possède, en commençant par les tigres, les ours, les pumas et les furets.
 
     Auteurs : Bosco-Lauth A. M. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 29 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Les auteurs ont testé la sensibilité à l’infection par le SARS-CoV-2 de mammifères sauvages capturés dans le Colorado (États-Unis d’Amérique) qui vivent communément aux alentours des habitats humains. Parmi tous les animaux étudiés, se sont révélés sensibles la souris du soir ou souris sylvestre (Peromyscus maniculatus), le rat à queue touffue (Neotoma cinerea) et la moufette rayée (Mephitis mephitis). L’article mentionne aussi les espèces qui se sont révélées non sensibles.
 
     Auteurs : Charlie-Silva I. et al.  
     Source : Journal of Hazardous Materials

     Date de publication : 25 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

L’objectif de ce travail était d’évaluer si des peptides issus de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 pouvaient avoir un impact défavorable sur les animaux aquatiques. En utilisant des têtards de l’amphibien Physalaemus cuvieri, les auteurs répondent par l’affirmative en montrant les modifications intervenant dans l’activité de certaines enzymes chez ces animaux et le stress oxydatif qu’ils subissent.
 
Espèces sauvages et SRAS-CoV-2 : Lignes directrices sur la manipulation
     Auteur : Environnement et Changement climatique Canada
     Source : Environnement et Changement climatique Canada

     Date de publication : 15 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

L’objectif de ce document canadien est de fournir des recommandations générales aux autorités fédérales, provinciales et locales ainsi qu’aux agences et organisations s’occupant d’animaux sauvages afin de minimiser le risque de transmettre le SARS-CoV-2 à ceux-ci. Le document comprend aussi deux annexes, l’une pour les chercheurs et l’autre pour les établissements de soins animaliers ainsi que pour les agents chargés de la lutte contre les nuisibles.
 
     Auteurs : Griffin B. D. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 14 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)

Les auteurs de l'article ont démontré que la souris sylvestre ou souris du soir (Peromyscus maniculatus) [qui est répandue dans toute l'Amérique du Nord] est susceptible d'être infectée par le virus de la COVID-19. Ils s'inquiètent du rôle zoonotique que cette souris pourrait jouer, compte tenu du fait qu'elle est déjà le réservoir d'autres maladies transmissibles à l'Homme (maladie de Lyme, etc.).
 
     Auteurs : Gilardi K. et al.
     Source : American Journal of Primatology

     Date de publication : 10 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)

Description des mesures de prévention mises en place pour protéger d’une infection par le SARS-CoV-2 les gorilles des montagnes (Gorilla beringei beringei) qui vivent aux frontières de la République démocratique du Congo, du Rwanda et de l’Ouganda.
 
     Auteurs : Kumakamba C. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 9 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 juin 2021)

Recherche de l’ARN de coronavirus chez diverses espèces d’animaux sauvages (chauves-souris, rongeurs, primates) les plus susceptibles d’entrer en contact avec la population humaine dans le bassin du Congo. L’essentiel des alpha- et béta-coronavirus identifiés provenaient de prélèvements faits chez des chauves-souris.
 
     Auteurs : Zhou H. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 9 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)

Recherche de séquences de génomes de coronavirus dans plus de 400 prélèvements (fèces, urine et salive) collectés en 2020 chez 23 espèces de chauves-souris vivant dans la province du Yunnan en République populaire de Chine, en vue de mettre en évidence la circulation de tels virus dans ces populations, et comparaison de ces séquences avec leur équivalent dans le génome du SARS-CoV-2. 

     Auteurs : Xiao X. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 7 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 juin 2021)

Les auteurs ont listé 38 espèces (dont 31 espèces protégées) d’animaux sauvages (capturés dans la nature ou venant de fermes d’élevage) vendus sur les marchés de Wuhan (Rép. pop. de Chine) pour l’alimentation ou comme animaux de compagnie de mai 2017 à novembre 2019. On n’y retrouve pas de pangolin (non plus que de chauves-souris), ce qui renforce l’idée que cet animal ne serait pas l’hôte intermédiaire à l’origine du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Audino T. et al.
     Source : Animals

     Date de publication : 3 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Prise en compte de différents types de données pour tenter d'évaluer le risque pour les mammifères marins fréquentant les côtes italiennes d'être infectés par le SARS-CoV-2 en raison de la présence du virus dans les eaux usées.
 
     Auteurs : Cook J. D. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 28 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Mise à jour de la première évaluation du risque d’infection des chauves-souris nord-américaines, et en particulier de la sérotine brune (Myotis lucifugus), par le SARS-CoV-2 à partir de la population humaine, en prenant en compte une nouvelle estimation de la réceptivité de cette sérotine ainsi qu’en proposant de nouvelles méthodes de gestion de ce risque sur la base de l’analyse décisionnelle et du recueil des avis d’experts.
 
     Auteurs : Jemeršić L. et al. 
     Source : Pathogens

     Date de publication : 21 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)

Les auteurs ont recherché des anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 et de l’ARN viral, de juin 2020 à février 2021, sur des prélèvements collectés sur des animaux appartenant aux espèces sauvages dominantes en Croatie (sanglier (Sus scrofa), renard roux (Vulpes vulpes), chacal doré (Canis aureus), goéland leucophée (Larus michahellis)) ainsi que sur des animaux de zoo. Si quelques résultats positifs en ELISA ont été obtenus, ils n’ont pas été confirmés par les épreuves de neutralisation virale. Les auteurs en concluent que le SARS-CoV-2 n’a pas été transmis à ces animaux sauvages pendant la période d’enquête considérée.
  
     Auteur : Fagre A. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 19 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Démonstration de la possibilité d’infecter en laboratoire par voie intranasale la souris sylvestre (Peromyscus maniculatus, souris commune en Amérique du Nord) avec le SARS-CoV-2. Ces souris n’expriment pas de signes cliniques mais peuvent se transmettre le virus entre elles.
 
     Auteurs : Geldenhuys M. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 18 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Article faisant la synthèse des études sur la surveillance des coronavirus réalisées en Afrique, en détaillant les dispositifs de collecte des prélèvements, les méthodes génomiques ou sérologiques employées, le nombre d’animaux par espèce testés et les résultats obtenus. Ce sont les chauves-souris qui ont été le plus soumises à prélèvement. Des coronavirus ont été identifiés chez 7 % d’entre elles, alors que cela n’a été le cas que chez 1 % des autres animaux sauvages ou domestiques pris en compte.
 
     Auteurs : Aguiló-Gisbert J. et al.
     Source : Animals

     Date de publication : 16 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Détection de l'ARN du SARS-CoV-2 par RT-PCR chez deux visons américains (Neovison vison) sauvages capturés pendant des opérations de piégeage d'espèces invasives dans l'Est de l'Espagne.
 
     Auteurs : Alves R. S. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 12 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 mai 2021)

Recherche de coronavirus chez des chauves-souris vampires (Desmodus rotundus) capturées entre 2017 et 2019 dans le sud du Brésil.
 
     Auteurs : Cox-Witton K. et al.
     Source : One Health

     Date de publication : 3 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)

Évaluation qualitative du risque de transmission du SARS-CoV-2 de l’Homme aux chauves-souris dans le contexte de l’Australie, en vue de formuler des stratégies de gestion de ce risque pour les activités humaines qui conduisent à entrer en contact avec des chauves-souris.
 
     Auteurs : Logeot M. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 28 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Après avoir passé en revue les espèces d’animaux sauvages rencontrées dans la nature en Belgique, les auteurs s’attachent à évaluer de manière qualitative le risque que ces espèces soient infectées par le SARS-CoV-2 par l’Homme ou d’autres animaux.
 
     Auteurs : Brierley L. et Fowler A.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 20 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 mai 2021)

Par utilisation de techniques algorithmiques dites des forêts d’arbres décisionnels (un volet de l’apprentissage automatique), les auteurs ont étudié les séquences du génome entier ou de la protéine de spicule d’environ 200 coronavirus. L’application au SARS-CoV-2 de ces techniques vient confirmer l’hypothèse selon laquelle ce virus trouve son origine chez les chauves-souris.
 
     Auteur : Aquarium de Géorgie (USA)  
     Source : Aquarium de Géorgie (USA)

     Date de publication : 18 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 mai 2021)

Cas de maladie due au SARS-CoV-2 chez des loutres cendrées (Aonyx cinereus) tenues en captivité à l’aquarium de Géorgie (USA). La maladie s’est traduite par des symptômes respiratoires légers. Il est suspecté que des soigneurs asymptomatiques leur ont transmis le virus.  
 
     Auteurs : Mou H. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 9 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 avril 2021)

Ce travail porte sur l’affinité entre le domaine de liaison de différents coronavirus, dont le SARS-CoV-2, et les orthologues de l’ACE2 (récepteur cellulaire) de différentes espèces. Il conforte, pour le SARS-CoV-2, l’hypothèse du pangolin comme hôte intermédiaire entre des chauves-souris du genre Rhinolophus et l’Homme. Par ailleurs, il montre la grande variabilité qui existe dans la capacité du domaine de liaison du SARS-CoV-2 à se lier aux orthologues ACE2 d’espèces de chauves-souris incluses dans ce genre.
 
     Auteurs : Delahay R. J. et al.
     Source : One Health Outlook

     Date de publication : 7 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)

Les auteurs examinent le risque de transmission et de persistance du SARS-CoV-2 dans les populations de différents mammifères (chauves-souris, canidés, félidés, mustélidés, grands singes, rongeurs et cervidés) et formulent des propositions sur les éléments à prendre en compte pour exercer une surveillance épidémiologique effective de ce virus dans la faune sauvage.
 
     Auteurs : Melin A. D. et al.
     Source : American Journal of Primatology

     Date de publication : 1er avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

 Par analyse des séquences de gènes codant pour l’enzyme de conversion de l’angiotensine (ACE2), les auteurs évaluent la sensibilité des espèces appartenant au sous-ordre des strepsirrhiniens (lémuriens, loris, etc.) vis-à-vis du SARS-CoV-2. Ils déterminent ainsi les espèces qui leur paraissent le plus menacées par l’infection virale.
 
     Auteurs : Cook J. D. et al.
     Source : Conservation Science and Practice

     Date de publication : 30 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Cette enquête s’intéresse au risque de transmission du SARS-CoV-2 aux chauves-souris d’Amérique du Nord pendant les travaux d’hiver, notamment au cours des enquêtes conduites pour la recherche du syndrome du museau blanc. Elle s’appuie sur un modèle de transmission du virus par aérosol à trois espèces de chauves-souris en prenant en compte les données de la littérature et l’avis d’experts.
 
     Auteurs : Tassin J. et Roda J-M.  
     Source : The Conversation

     Date de publication : 19 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Ces chercheurs du CIRAD remettent en cause l’hypothèse trop souvent avancée d’un lien entre déforestation et émergence du SARS-CoV-2 ou d’autres zoonoses, qui n’est pas étayée par des preuves scientifiques solides. Ils rappellent que l’implication du couple chauves-souris / pangolin dans cette émergence reste toujours à démontrer.
 
     Auteurs : MacLean O. A. et al.
     Source : PLOS BIOLOGY

     Date de publication : 12 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)

Les résultats présentés conduisent les auteurs à conclure que le SARS-CoV-2 originel qui a été capable de se transmettre entre humains est le résultat d’une longue évolution adaptative chez les chauves-souris qui a conduit à la constitution d’un virus relativement généraliste.
 
     Auteurs : Ulrich L. et al.
     Source : Emerging Infections Diseases
     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 12 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)
Inoculation expérimentale du SARS-CoV-2 au campagnol roussâtre (Myodes glareolus) : son infection est prouvée mais il n’y a pas de transmission du virus par contact à des congénères. Il est donc improbable que le virus se propage chez ces animaux dans la nature.
 
     Auteurs : Palmer M. V. et al.
     Source : Journal of Virology

     Date de publication : 10 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)

Les auteurs montrent que le cerf de Virginie (Odocoileus virginianus), espèce chez laquelle le récepteur cellulaire ACE2 est très proche de celui de l’Homme, est très sensible à l’infection par le SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Yan H. et al.
     Source : Nature Ecology & Evolution

     Date de publication : 1er mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)

L'étude montre que de nombreuses espèces de chauves-souris s'avèrent ne pas être des hôtes potentiels du SARS-CoV ou du SARS-CoV-2 et qu'il n'existe pas de corrélation entre la proximité de ces espèces avec l'Homme et leur probabilité d'être des hôtes naturels de ces virus.
 
     Auteurs : Shriner S. A. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 15 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)

A des fins de surveillance, des mammifères ont été capturés autour des fermes de visons atteintes par le SARS-CoV-2 dans l’Utah. Des visons, probablement échappés de ces fermes, possédaient des titres élevés en anticorps, faisant craindre une possible transmission du virus à la faune sauvage.
 
     Auteurs : Common S. M. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 11 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Dans cette étude portant sur l’Angleterre, les auteurs évaluent à l’aide d’une méthode qualitative les risques que des chauves-souris vivant en liberté soient contaminées par le SARS-CoV-2 par l’intermédiaire des personnes intervenant sur le terrain pour des activités de conservation ou d’enquête. Ils proposent aussi des mesures de gestion de ce risque.
 
     Auteurs : Wacharapluesadee S. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 9 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)

Par des méthodes moléculaires et sérologiques, les auteurs montrent que des coronavirus proches du SARS-CoV-2 circulent chez les chauves-souris d’Asie du Sud-Est. Ils ont étudié les génomes viraux trouvés chez cinq espèces de chauves-souris vivant dans une grotte de Thaïlande et ont mis en évidence la présence d’un même virus très proche d’un autre isolat obtenu au Yunnan (Rép. pop. de Chine).
 
     Auteurs : Centers for Disease Control and Prevention (CDC, États-Unis)
     Source : CDC, États-Unis

     Date de publication : 8 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)

Recommandations visant à éviter la transmission du SARS-CoV-2 entre la population humaine et la faune sauvage afin de minimiser les effets néfastes qu’une telle transmission pourrait avoir sur la santé publique et la conservation des espèces.
 
     Auteurs : Wrobel A. G. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 5 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)

Les auteurs montrent que les coronavirus des pangolins du Guandong, proches du SARS-CoV-2, s’attachent fortement aux récepteurs ACE2 du pangolin et de l’Homme. Ils montrent aussi que la protéine de spicule du coronavirus du pangolin, hors son domaine d’attachement, se rapproche plus de la protéine de spicule du coronavirus RaTG13 de chauve-souris que de celle du SARS-CoV-2.
 
     Auteur : Hassanin A.
     Source : THE CONVERSATION

     Date de publication : 1er février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Les données obtenues après l’identification d’un virus en relation avec le SARS-CoV-2 chez deux chauves-souris Rhinolophus shameli échantillonnées au Cambodge en 2010 valident l’hypothèse de la présence de divers virus proches du SARS-CoV-2 en Asie du Sud-Est. Dans cet article sont aussi développées des considérations sur les conditions de contamination des pangolins par des chauves-souris.
 
     Auteurs : Platto S. et al.
     Source : Biochem Biophys Res Commun

     Date de publication : 29 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Les auteurs discutent de la façon dont les modifications environnementales résultant de l’activité humaine modifient les niches occupées par les agents pathogènes. Ces modifications ont en particulier conduit, dans le contexte de l’Asie du Sud-Est où les chauves-souris hébergent des coronavirus, à l’émergence de la pandémie de COVID-19.
 
     Auteurs : Beyer R. M. et al.
     Source : Science of the Total Environment

     Date de publication : 26 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

La province du Yunnan (sud de la République populaire de Chine) et les régions voisines au Myanmar et au Laos constituent une zone où l’abondance des chauves-souris s’accroît du fait du changement climatique. Cette zone coïncide avec l’espace où les ancêtres du SARS-CoV-1 et du SARS-CoV-2 chez les chauves-souris trouveraient leur origine.
 
     Auteurs : Makarenkov V. et al.  
     Source : BMC Ecology and Evolution

     Date de publication : 21 janvier 2021 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Etude approfondie des transferts et recombinaisons de gènes qui ont pu se produire à partir de coronavirus de chauves-souris et de pangolins de la région de Canton (Rép. pop. de Chine) pour générer le SARS-CoV-2
 
     Auteurs : Irving A. T. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 20 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)

Les chauves-souris possèdent des caractéristiques uniques parmi les mammifères, en particulier celle d’héberger des virus sans manifester la moindre maladie (l’ancêtre du SARS-CoV-2 trouverait son origine chez elles). Dans l’article sont évoqués les mécanismes qui sous-tendent leur système de défense et leur tolérance immunitaires.
 
       Auteurs : Bartlett S. L. et al.
       Source : Journal of Zoo and Wildlife Medicine

       Date de publication : 12 janvier 2021 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 février 2021)

Les auteurs décrivent les résultats des investigations cliniques, radiologiques, virologiques, etc. qu'ils ont faites à partir de fin mars 2020 chez de grands félidés sauvages (tigres de Malaisie et de Sibérie, lions) tenus en captivité au zoo du Bronx (New York), à la suite de la contamination de l'un au moins d'entre eux par le SARS-CoV-2 par l'intermédiaire de soigneurs excréteurs.
 
     Auteur : San Diego Zoo Global
     Source : San Diego Zoo Global

     Date de publication : 11 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)

Confirmation par des examens de laboratoire de la présence du SARS-CoV-2 chez certains des gorilles du parc animalier de San Diego (États-Unis d’Amérique), vraisemblablement contaminés par un membre de l’équipe soignante n’ayant pas manifesté de symptômes.
 
     Auteurs : Dimonaco N. J. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 30 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Comparaison, par des méthodes récentes, des génomes de coronavirus isolés chez l’Homme (SARS-CoV-2), chez les chauves-souris (bat-CoV) et chez les pangolins (pangolin-CoV), qui sont disponibles dans des répertoires publics, dans l’objectif de repérer les mutations adaptatives qui pourraient avoir facilité l’apparition du SARS-CoV-2 dans la population humaine.
 
     Auteur : Aleccia J.
     Source : KHN

     Date de publication : 23 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)

Vaccination expérimentale contre la COVID-19 de putois américains ou putois à pieds noirs (Mustela nigripes – espèce en danger d’extinction) tenus en captivité dans un centre de conservation situé près de Fort Collins (Colorado, États-Unis).
 
     Auteurs : Liu K. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 17 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Les auteurs s’intéressent à la sensibilité des chauves-souris au SARS-CoV-2, en étudiant en particulier la capacité du domaine de liaison de la protéine de spicule du virus isolé chez l’Homme à se lier au récepteur ACE2 de ces animaux.
 
     Auteur : U.S. Department of Agriculture, Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. Department of Agriculture, Animal and Plant Health Inspection Service

     Date de publication : 11 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Signes respiratoires chez trois léopards des neiges entretenus dans le zoo de Louisville (Kentucky, Etats-Unis) et confirmation de l’atteinte par le SARS-CoV-2 de l’un d’entre eux ; ces félins ont vraisemblablement été contaminés par un soigneur asymptomatique, malgré les précautions sanitaires prises localement.
 
     Auteur : U.S. Department of Agriculture, Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. Department of Agriculture, Animal and Plant Health Inspection Service

     Date de publication : 11 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Premier cas de SARS-CoV-2 confirmé chez un vison sauvage aux USA, dans l’État de l’Utah.
 
     Auteurs : Hall J. S. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 9 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Inoculation expérimentale de la sérotine brune (Eptesicus fuscus) avec le SARS-CoV-2 par voie nasale et oro-pharyngée. Aucune des recherches entreprises sur les animaux inoculés n’a mis en évidence un quelconque signe d’infection.
 
     Auteurs : Boardman W. S. J. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 3 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Des prélèvements collectés entre 2015 et 2018 à Adélaïde (Australie) sur 301 renards volants (ou roussettes) à tête grise (Pteropus poliocephalus) ont montré chez un certain nombre de ces chauves-souris l’existence d’anticorps dirigés contre un virus ayant des affinités avec le SARS-CoV-1.
 
     Auteurs : Murakami S. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 2 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les chercheurs ont détecté au Japon un sarbecovirus phylogénétiquement lié au SARS-CoV-2 chez une chauve-souris commune dans ce pays (Rhinolophus cornutus). Bien que la protéine de spicule de ce virus ne reconnaisse pas le site d’attachement des cellules humaines, les chercheurs considèrent qu’il pourrait être à l’origine d’une zoonose par l’intermédiaire d’un autre animal.
 
     Auteurs : Murakami S. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 2 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les chercheurs ont détecté au Japon un sarbecovirus phylogénétiquement lié au SARS-CoV-2 chez une chauve-souris commune dans ce pays (Rhinolophus cornutus). Bien que la protéine de spicule de ce virus ne reconnaisse pas le site d’attachement des cellules humaines, les chercheurs considèrent qu’il pourrait être à l’origine d’une zoonose par l’intermédiaire d’un autre animal.
 
     Auteurs : Barbosa A. et al.
     Source : Science of the Total Environment

     Date de publication : 29 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Les auteurs évaluent le risque de transmission du SARS-CoV-2 de l’Homme à la population des animaux sauvages de l’Antarctique en prenant en considération les informations disponibles sur la sensibilité des espèces animales présentes, la dynamique de l’infection dans la population humaine et les interactions existant entre les deux populations.
 
     Auteurs : Mathavarajah S. et al.
     Source : Science of the Total Environment

     Date de publication : 29 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les auteurs s'inquiètent de la présence du SARS-CoV-2 dans les eaux usées (non ou insuffisamment traitées) qui atteignent la mer en Alaska et du risque de contamination des mammifères marins (baleines, dauphins, phoques et otaries) qui en résulte. Par la voie de la modélisation (comparaison de l'affinité du récepteur ACE2 avec le virus dans différentes espèces), ils ont évalué la sensibilité de ces espèces au virus. Ils alertent sur les effets dévastateurs que pourrait avoir celui-ci sur ces populations déjà en déclin.
 
     Auteurs : Melin A. D. et al.
     Source : Communications Biology

     Date de publication : 27 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)

Cette étude montre que les singes d’Afrique et d’Asie ainsi que certains lémuriens sont, selon toute vraisemblance, très sensibles au SARS-CoV-2, ce qui menace gravement leur survie. Chez les singes des Amériques, certains tarsiers, lémurs et lorisidés, l’affinité de l’ACE2 au virus est moindre, ce qui atténue leur sensibilité à l’infection.
 
     Auteurs : McAloose D. et al.
     Source : mBio

     Date de publication : 13 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Première description de l’infection par le SARS-CoV-2 de tigres et de lions au zoo du Bronx (New York, USA).
 
     Auteurs : Aid M. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 9 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)

Dans cette étude sont comparés les prélèvements d’autopsie opérés sur des poumons d’êtres humains et de macaques rhésus infectés par le SARS-CoV-2. Sont ensuite évalués les processus en jeu conduisant aux lésions observées en utilisant diverses techniques d’investigation.
 
     Auteurs : Gryseels S. et al.
     Source : Mammal Review

     Date de publication : 6 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)

L’examen de différentes publications récentes amène à conclure qu’un large éventail de mammifères sont sensibles au SARS-CoV-2, et que cette sensibilité n’est pas, ou modérément, prévisible. En conséquence, les précautions sanitaires les plus grandes doivent être prises par les personnes qui interagissent avec les animaux sauvages dans la nature.
 
     Auteurs : Martínez-Hernández F. et al.
     Source : Perspectives in Ecology and Conservation

     Date de publication : 5 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Il s’agit d’une évaluation de la sensibilité des espèces de la faune sauvage à l’infection par le SARS-CoV-2 en analysant leur ACE2 et leur TMPRSS2 (récepteurs cellulaires permettant l’attachement de la protéine de spicule du virus) ainsi que l’éventuel effet de la variabilité génétique de cette protéine de spicule sur la reconnaissance du site d’attachement.
 
     Auteurs : Olival K. J. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 3 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Les auteurs examinent le risque que des personnes transmettent par inadvertance le SARS-CoV-2 à des chauves-souris sauvages. Considérant la distribution des lignées de β-coronavirus et l’éventail de leurs hôtes, ils considèrent que plus de 40 espèces de chauves-souris des zones tempérées en Amérique du Nord pourraient être infectées.
 
     Auteurs : Peel A. J. et al.
     Source : Australian Journal of Zoology

     Date de publication : 2 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Les auteurs font la synthèse des études réalisées en matière de détection de coronavirus chez les chauves-souris australiennes. Ils soulignent leur caractère partiel et s’inquiètent de la possible transmission par des personnes du SARS-CoV-2 à ces animaux, et des conséquences qui pourraient en résulter tant en ce qui concerne leur protection qu’en matière de santé publique.
  
     Auteurs : Latinne A. et al.  
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 25 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Par des méthodes statistiques et l’accès à une base de données étendue sur le génome de coronavirus isolés de chauves-souris en République populaire de Chine, les auteurs étudient l’évolution de ces virus, leur transmission entre espèces et leur dispersion.
 
     Auteurs : Frutos R. et al.
     Source : Infection, Genetics and Evolution

     Date de publication : 5 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)

Les auteurs développent plusieurs arguments visant à démontrer que le pangolin ne peut pas être l’hôte intermédiaire à l’origine de la pandémie actuelle de COVID-19.

     Auteurs : Boni M. F. et al.
     Source : Nature Microbiology

     Date de publication : 28 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)

Les auteurs tendent à démontrer par des études phylogénétiques en utilisant trois méthodes bio-informatiques que c’est chez les chauves-souris que le SARS-CoV-2 a évolué jusqu’à pouvoir se répliquer dans le tractus respiratoire supérieur du Pangolin et de l’Homme.
 
     Auteurs : Colunga-Salas P. et Hernández-Canchola G.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 28 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)

Cet article décrit les relations phylogéniques entre le SARS-CoV-2 et les coronavirus présents chez les chauves-souris du Mexique.
 
     Auteur : Shabir O.
     Source : News Medical

     Date de publication : 27 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2020)

 L’auteur passe en revue les similitudes et différences entre le RaTG13 (coronavirus en relation avec le SARS) trouvé chez les chauves-souris et le SARS-CoV-2 responsable de la pandémie actuelle.
 
     Auteurs : Schlottau K. et al.
     Source : The Lancet

     Date de publication : 7 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 octobre 2020)

 Etude de la sensibilité d’animaux hôtes potentiels du SARS-CoV-2 et du risque zoonotique associé.
 

     Date de publication : 23 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 octobre 2020)

Au vu du risque potentiellement élevé de transmission du SARS-CoV-2 entre singes du genre Chlorocebus (vervets) et êtres humains, les auteurs ont examiné les données disponibles sur le génome de vervets et de singes verts pour mettre en évidence les variations rencontrées au niveau des régions codant pour la protéine ACE2 et la protéase TMPRSS2 et essayer d’en tirer des conclusions sur leur sensibilité à l’infection.
 
     Auteurs : Lau S. K. P. et al.
     Source : Emerging Infectious Diseases

     Date de publication : 21 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)

Les auteurs montrent que le SARS-CoV-2 est très proche de certains coronavirus des chauves-souris rhinolophes fer à cheval, et que c’est de celui du pangolin que son domaine de liaison au récepteur cellulaire est le plus proche.
 
     Auteurs : Santini J.M. et al.
     Source : The Lancet Microbe
     Date de publication : 18 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
     Annexes de l'article : cliquez ici
 
     Auteurs : Runge M.C. et al.
     Source : U.S. Geological Survey

     Date de publication : 2 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)

Ce rapport évalue le risque que des personnes transmettent le SARS-CoV-2 aux chauves-souris d’Amérique du Nord, en ciblant la saison d’activité de ces animaux dans la zone tempérée de la région (15 avril au 15 novembre) et en prenant pour modèle la petite chauve-souris brune (Myotis lucifugus).
 
     Auteur : Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de publication : 18 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)

L’auteur discute les différentes approches qui ont été empruntées pour essayer de mettre en évidence l’origine zoonotique de l’épidémie de COVID-19 dans la population humaine, sans qu’aucune n’ait été considérée comme parfaitement probante à ce jour.
 
     Auteurs : Liu P. et al.
     Source : PLOS PATHOGENS

     Date de publication : 14 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Etude du génome d’un coronavirus trouvé dans deux groupes de pangolins malais malades, probablement importés illégalement en République populaire de Chine. Ce coronavirus du pangolin était génétiquement associé au SARS-CoV-2 sans pour autant en être le précurseur. 
 
     Auteurs : Franklin A. B. et al.
     Source : Science of the Total Environment

     Date de publication : 12 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Les auteurs imaginent un mécanisme hypothétique par lequel les êtres humains pourraient transmettre le SARS-CoV-2 à la faune sauvage d’Amérique du Nord par l’intermédiaire des installations de traitement des eaux usées.
 
     Auteur : ANSES
     Source : ANSES

     Date de publication : 11 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

L’Anses dresse l’état des connaissances scientifiques sur la présence, l’infectiosité et la persistance du virus SARS-CoV-2 dans le milieu aquatique (eaux usées, eaux de surface, eaux souterraines, eaux saumâtres, eaux de mer), en lien avec l’excrétion humaine.
 
Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins
     Auteurs : Xiao K. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 7 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)

Les auteurs ont mis en évidence la présence chez un spécimen de pangolin javanais (Manis javanica) d’un coronavirus très proche du SARS-CoV-2. L’ARN de ce coronavirus a été détecté chez d’autres pangolins de la même espèce. Les auteurs discutent le rôle de réservoir ou d’hôte intermédiaire qu’a pu jouer le pangolin dans l’émergence de la COVID-19 dans la population humaine.
 
      Auteur : Moutou F.     
      Source: L'Ecologiste, N° 56, mars-mai 2020
      Date de publication: mai 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteurs : Lécu A. et al.
     Source : European Association of Zoo and Wildlife Veterinarians
     Date de publication : 1 mai 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteurs : Wong G. et al.
     Source : Zoological Research
     Date de publication : 21 avril 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteur : Hassanin A.
     Source : The Conversation, France
     Date de publication : 15 avril 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 juillet 2020)
 
     Auteurs : Lam T. T. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 26 mars 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)

Dans cet article, est rapportée la présence d’un coronavirus très proche du SARS-CoV-2 chez des pangolins javanais (Manis javanica) saisis dans le sud de la République populaire de Chine pour importation illégale.

     Auteur : Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de publication : 21 février 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

L’article s’intéresse aux décisions que les plus hautes autorités de la République populaire de Chine s’apprêtaient à prendre en février 2020 au sujet du commerce des produits issus de la faune sauvage, considérant que celle-ci était vraisemblablement à l’origine de l’épidémie de COVID-19 à Wuhan.
 
 

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     Auteurs : Rajendran M. et Babbitt G. A.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 19 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Cet article s’appuie sur des analyses statistiques appliquées à un large éventail de simulations comparatives de dynamique moléculaire pour évaluer le risque de transmission des variants préoccupants du SARS-CoV-2 de l’être humain à la chauve-souris (Rhinolophus macrotis). Si la souche originelle et les premiers variants préoccupants de ce virus avaient montré une nette capacité à s’attacher tant à l’ACE2 humaine (hACE2) qu’à celle de chauve-souris, les variants Delta et Omicron marquent une évolution adaptative à l’hACE2. Les auteurs considèrent néanmoins qu’il existe toujours un risque significatif d’infection par des variants préoccupants entre espèces de mammifères avec la survenue de nouvelles vagues de COVID-19.

     Auteur : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service.
     Source : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service

     Date de publication : 4 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Cette page Internet fournit des informations sur les espèces animales chez lesquelles l'infection par le SARS-CoV-2 a été identifiée aux États-Unis d’Amérique. Le tableau qu’elle contient est régulièrement actualisé.

     Auteurs : Kawashima I. Y. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 17 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 mars 2022)

En utilisant un outil informatique mis au point précédemment, les auteurs ont développé une méthode fondée sur de nouvelles variables tirées de la fréquence des codons liés au spicule des coronavirus (RSCU - Relative Synonymous Codon Usage, ou biais d’usage du code) pour expliquer la spécificité d’hôte du SARS-CoV-2. En utilisant cette méthode de modélisation, ils arrivent comme d’autres chercheurs à la conclusion que les chauves-souris sont très vraisemblablement les hôtes naturels à l’origine de ce virus.

     Auteurs : Praharaj M. R. et al
     Source : Frontiers in Medicine

     Date de publication :11 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)

Constatant que la phylogénie et les constituants de l’ACE2 ne permettaient pas de conclure quant à la capacité d’entrée du SARS-CoV-2 dans les cellules de différents hôtes, les auteurs ont examiné six paramètres susceptibles d’intervenir dans l’attachement de la spicule virale à l’ACE2. Ils ont constaté que ces six paramètres ne conduisaient pas à discriminer des ordres de mammifères sensibles et d’autres qui ne le sont pas, et ont alors eu recours à un modèle de régression logistique faisant appel à ces six paramètres pour évaluer la sensibilité potentielle de différentes espèces d’animaux.

     Auteurs : Sun H. et al.
     Source : Frontiers in Microbiology

     Date de publication : 4 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 mars 2022)

Nouvelle méthode de bio-informatique pour déterminer quels sont les animaux potentiellement sensibles au SARS-CoV-2 en se fondant sur l’intensité de l’arrimage entre la protéine de spicule du virus et la protéine ACE2 plutôt que sur le séquençage et la structure de cette dernière. Est aussi simulée pour différentes espèces l’influence de certaines mutations sur l’affinité de liaison entre ACE2 et site d’attachement du SARS-CoV-2.

     Auteurs : Pekar J. E. et al
     Source : Zenodo

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

Par analyse spatiale, les auteurs montrent que les premiers cas humains de COVID-19 apparus en décembre 2019 étaient distribués près et aux alentours du marché de Huanan à Wuhan (Rép. pop. De Chine). Ils signalent également que des animaux vivants, dont des chiens viverrins, étaient vendus sur ce marché fin 2019, et que les prélèvements environnementaux positifs pour la recherche du SARS-CoV-2 étaient fortement associés aux lieux de vente d’animaux vivants.

     Auteurs : Worobey M. et al.
     Source : Zenodo

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

En caractérisant l’évolution du récepteur ACE2 parmi un ensemble de mammifères, les auteurs ont mis en évidence une évolution rapide de l’interface ACE2/domaine de liaison des virus de type SARS dans le clade des rongeurs, alors que cette interface n’a subi qu’une faible adaptation chez les primates et les autres mammifères non connus pour héberger des SARS. Cela les conduit à penser que des espèces de rongeurs pourraient avoir acquis un certain degré de tolérance ou de résistance aux infections par les virus de type SARS, alors que les mammifères sans adaptation tangible, dont les primates, seraient plus à même de manifester des symptômes de maladie.

     Auteurs : Gao G. et al.
     Source : Research Square

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 25 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)

Dans cet article, les auteurs présentent les résultats des recherches sur le SARS-CoV-2 effectuées à partir de prélèvements collectés de janvier à mars 2020 sur le marché de Huanan à Wuhan (Rép. pop. De Chine). Il s’agissait de prélèvements environnementaux ou bien d’origine animale (produits animaux conservés dans des chambres froides, chats libres, fèces de félins, un chien, une belette, 10 rats). Contrairement aux prélèvements environnementaux, aucun prélèvement animal n’a fourni un résultat positif aux épreuves diagnostiques réalisées.

     Auteur : Plateforme ESA
     Source : Plateforme ESA

     Date de publication : 18 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Cette note dresse à date le bilan détaillé des cas de SARS-CoV-2 confirmés chez des animaux domestiques : animaux de compagnie (chiens, chats, furets, rongeurs et lagomorphes) et animaux d’élevage (hors élevages de visons d’Amérique).

     Auteurs : Shahhosseini N. et al.
     Source : Gene Reports

     Date de publication : 18 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

En utilisant des méthodes bio-informatiques et en considérant l’arbre phylogénique des sarbecovirus ainsi que d’autres données de génomique, les auteurs défendent l’idée que le SARS-CoV-2 aurait résulté d’une recombinaison entre le virus de chauve-souris RaTG13 et le Pangolin-CoV et que l’infection humaine trouverait son origine chez le pangolin.

     Auteurs : Clayton E. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 17 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)

Les auteurs étudient les aspects structurels et génétiques de l’interaction entre la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et le récepteur cellulaire (ACE2) de différents groupes d’animaux qui y sont potentiellement sensibles, pour repérer ce qui influe sur l’éventail des hôtes du virus. Ils évoquent une possible persistance de variants du virus dans la faune sauvage avec les conséquences que cela peut avoir sur l’éradication de la COVID-19.

     Auteurs : Lytras S. et al.
     Source : Genome Biology and Evolution

     Date de publication : 8 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)

Les auteurs, ayant utilisé des méthodes d’analyse génétique et phylogénique pour étudier les sarbecovirus des chauves-souris en relation avec le SARS-CoV-2, confortent l’hypothèse selon laquelle les Rhinolophes fer à cheval (genre Rhinolophus), dont l’aire de distribution couvre la Chine méridionale et le Sud-Est asiatique, sont très probablement à l’origine de ce virus après de multiples recombinaisons qui se sont produites sur une centaine d’années.

     Auteur : Système canadien de surveillance de la santé animale.
     Source : Système canadien de surveillance de la santé animale

     Date de publication : 24 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Ce Tableau de bord répertorie les cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez les animaux au Canada que le Centre national des maladies animales exotiques de l’Agence canadienne d’inspection des aliments a confirmés. Il est interactif et permet d’afficher les données selon l’espèce, la province ainsi que la période de temps.

     Auteur :UK Health Security Agency
     Source : Public Health England publications

     Date de publication : 20 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)

Les auteurs étudient les aspects structurels et génétiques de l’interaction entre la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et le récepteur cellulaire (ACE2) de différents groupes d’animaux qui y sont potentiellement sensibles, pour repérer ce qui influe sur l’éventail des hôtes du virus. Ils évoquent une possible persistance de variants du virus dans la faune sauvage avec les conséquences que cela peut avoir sur l’éradication de la COVID-19.

     Auteurs : Islam A. et al.
     Source : PLOS ONE

     Date de publication : 15 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Cette étude, s’appuyant sur les séquences de gènes disponibles dans les banques de données internationales, a été réalisée en vue de mieux comprendre la répartition spatiale des souches de SARS-CoV-2 et des virus qui en sont proches chez les animaux domestiques et sauvages, leur diversité génétique, leurs similarités statistiquement significatives ainsi que les mutations génétiques qui sont survenues. 
 
     Auteurs : Sander A-L. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 15 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

En procédant à une nouvelle étude de coronavirus voisins du SARS-CoV-2 isolés chez des rhinolophidés européens, les auteurs identifient différents déterminants moléculaires favorables à l’émergence du site de clivage de la furine qui est propre au SARS-CoV-2, ce qui vient en appui à l’hypothèse de ce virus. 
 
     Auteurs : Fu Y. et al.
     Source : Research Square

     Date de publication : 13 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Cette étude porte sur les divergences de composition du génome et d’utilisation des codons des souches de SARS-CoV-2 isolées chez l’être humain et les animaux en vue de comprendre les phénomènes de sélection naturelle susceptibles de jouer un rôle dans l’évolution, l’adaptabilité et la transmission de ce virus. 
 
     Auteurs : Muylaert R. L. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 13 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Les auteurs ont développé un outil de modélisation relatif à la distribution des chauves-souris hôtes de sarbecovirus en tenant compte de caractéristiques climatiques et paysagères. Les facteurs majeurs de cette répartition étant la saisonnalité des températures et l’existence de grottes dans un contexte où la planète va se réchauffer, ils proposent des scénarios d’évolution de cette répartition d’ici 2100 avec en certains lieux disparition des espèces et en d’autres concentration de celles-ci à proximité des populations humaines. 
 
     Auteurs : Murphy H. L. et Ly H.
     Source : Virulence

     Date de publication : 10 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)

Les auteurs donnent un large aperçu des recherches en matière de surveillance entreprises dans divers endroits du monde pour évaluer le niveau d’exposition au SARS-CoV-2 de différents types d’animaux (de compagnie, de production, tenus en captivité ou sauvages). Ils passent aussi en revue les connaissances sur les possibilités de transmission du virus au sein des espèces et entre espèces et sur les conséquences que ces phénomènes pourraient avoir en matière de santé publique.

     Auteur : Baraniuk C.
     Source : The Scientist

     Date de publication : 9 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)

Le journaliste fait le point sur le développement de vaccins vétérinaires dirigés contre le SARS-CoV-2 dans le monde et leur usage chez des animaux domestiques ou sauvages (dans des zoos). 
 
     Auteurs : Chen P. et al.
     Source : Computational Biology and Chemistry

     Date de publication : 9 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)

Les auteurs modélisent les interactions entre le récepteur cellulaire ACE2 et la protéine de spicule du SARS-CoV-2 chez différentes espèces animales et les comparent à ce qui se passe avec l’ACE2 humaine. Ils établissent un classement entre ces espèces, fondé sur cette affinité de liaison, mais reconnaissent que des expérimentations in vivo seraient nécessaires pour valider les résultats de leurs analyses faites in silico.

      Auteurs : Chen D. et al
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 6 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Cette étude vise à identifier les profils d’expression des gènes permettant la pénétration virale dans les cellules, en se focalisant sur les modalités de co-expression de l’ACE2 et de la TMPRSS2 chez 11 espèces d’animaux non utilisées comme modèles en matière de recherche. Selon les auteurs, ce type d’approche pourrait s’avérer utile pour identifier les cellules potentiellement cibles du SARS-CoV-2 et donc les animaux susceptibles de jouer un rôle de réservoir.
 
      Auteurs : King S. B. et Singh M.
     Source : PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY

     Date de publication : 18 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont caractérisé l’évolution de l’ACE2 d’un ensemble de mammifères, et les comparaisons génomiques réalisées ont révélé un schéma d’évolution rapide de l’interface d’attachement ACE2/virus au sein du clade des rongeurs, tandis que parmi les autres mammifères non hôtes à ce jour de virus de type SARS l’interface n’a évolué que de manière très limitée. Cela suggère, selon eux, que certains rongeurs pourraient acquérir une tolérance ou résistance à l’infection par ce type de virus.
 
Predicting the zoonotic capacity of mammals to transmit SARS-CoV-2
     Auteurs : Fischhoff I. R. et al.
     Source : Proceedings of the Royal Society B

     Date de publication : 17 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs combinent une modélisation de la structure du récepteur ACE2 chez de nombreuses espèces de mammifères avec un recours à des méthodes d’intelligence artificielle axées sur leurs caractéristiques pour prédire la force de l’attachement entre le domaine de liaison du SARS-CoV-2 et le récepteur ACE2 chez chacune d’elles. Ils en tirent des conclusions quant à leur sensibilité vis-à-vis du virus et à leur capacité à transmettre le virus à l’Homme. 
 
     Auteurs : Meekins D. A. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 4 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)

Revue des connaissances relatives à la sensibilité des espèces animales domestiques et sauvages à une infection expérimentale par le SARS-CoV-2, avec description des signes cliniques observés, ainsi qu’à la possibilité de transmission du virus entre congénères. Y sont aussi présentées des informations sur les infections naturelles qui se sont produites lors de contacts entre personnes et animaux. 
 
     Auteurs : Lopes L. R. et al.
     Source : Animal Diseases

     Date de publication : 26 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs cherchent à déterminer, par des méthodes bio-informatiques appliquées à la structure de l’ACE2, quels animaux de la faune brésilienne seraient susceptibles de devenir des hôtes du SARS-CoV-2. Ils repèrent ainsi trois espèces : le puma (Puma concolor), le loup à crinière (Chrysocyon brachyurus) et le chien des buissons (Speothos venaticus) qui pourraient se contaminer en chassant le cerf de Virginie.
 
     Auteurs : Gan J. L. et al.
     Source : Biochemical Journal

     Date de publication : 24 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

Analyse de la variabilité existant entre les récepteurs cellulaires (ACE2) de plusieurs espèces animales et l’Homme pour essayer de comprendre les paramètres intervenant dans leur reconnaissance par le domaine d’attachement de la protéine de spicule du SARS-CoV-2. L’affinité la plus forte entre les deux se rencontre chez l’Homme et le hamster ; elle est moindre chez le chat et le bovin et s’avère faible chez la chauve-souris fer-à-cheval et le furet.
 
     Auteur : Cohen J.
     Source : Science

     Date de publication : 7 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)

L’auteur passe en revue de manière détaillée les termes du débat auquel ont déjà participé nombre de scientifiques sur l’origine possible du SARS-CoV-2 en fonction des informations historiques, phylogéniques, etc. disponibles. La transmission du virus à des individus à partir d’une source animale reste la plus probable, mais l’hypothèse d’une échappée du virus d’un laboratoire n’est pas définitivement écartée.
 
     Auteurs : Guo Q. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 31 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Mise au point d’une méthode d’intelligence artificielle par apprentissage profond permettant de déterminer dès l’émergence d’un nouveau virus pathogène, à partir de ses caractéristiques génomiques, ses hôtes potentiels, et application de la méthode au SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Lytras S. et al.
     Source : Science

     Date de publication : 27 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)

Cet article, qui associe auteurs britanniques et chinois, poursuit la réflexion sur l’origine zoonotique probable du SARS-CoV-2 en République populaire de Chine, entamée avec l’article intitulé « Exploring the natural origins of SARS-CoV-2 in the light of recombination » qui a été publié dans bioRxiv le 22 janvier 2021.
 
     Auteur : Maxmen A.
     Source : Nature

     Date de publication : 27 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

L’auteur présente les résultats des investigations menées par les services de renseignement des États-Unis d’Amérique (dont la CIA et le FBI) sur l’origine de la COVID-19 et donne le lien pour prendre connaissance du résumé non classifié rédigé à l’issue de ces investigations. Celles-ci restent non conclusives, si ce n’est que le virus causal n’est pas une arme biologique et n’a vraisemblablement pas été le résultat de manipulations génétiques.
 
     Auteurs : Koopmans M. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 25 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)

Les chercheurs qui ont fait partie de l’équipe internationale constituée par l’OMS pour travailler avec les autorités de République populaire de Chine à la recherche de l’origine de la COVID-19 répondent à un certain nombre de critiques émises à l’encontre de leur rapport et listent les actions prioritaires qu’il est urgent d’entreprendre pour qu’il soit encore possible de déterminer cette origine, en particulier en ce qui concerne les animaux qui peuvent avoir joué le rôle de réservoirs ou d’hôtes intermédiaires.
 
    Auteurs : Rotondo J. C. et al.
     Source : Viruses

     Date de publication : 25 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Cet article vaut pour sa partie 5 qui passe en revue les hypothèses émises quant à la possible origine zoonotique de la COVID-19 ainsi que les recherches entreprises à ce jour sur ce sujet (analyses phylogéniques, comparaison de l’affinité de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 avec le récepteur cellulaire (ACE2) de différentes espèces de mammifères, etc.).
 
     Auteur : Holmes E. C. et al.
     Source : Cell

     Date de publication : 18 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)

Considérant les débats récents sur deux hypothèses concurrentes quant à l’origine du SARS-CoV-2, les auteurs passent en revue les connaissances scientifiques actuellement disponibles permettant de juger de la vraisemblance de l’une et l’autre hypothèse.
 
     Auteurs : Pach S. et al.
     Source : Molecular Informatics

     Date de publication : 10 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)

Pour tenter d’expliquer les différences de sensibilité vis-à-vis du SARS-CoV-2 constatées entre les espèces animales, les auteurs ont mis au point des modèles permettant de simuler au niveau atomique la dynamique de liaison entre la protéine de spicule du virus et le récepteur cellulaire (ACE2) de l’hôte.
 
     Auteurs : Casadevall A. et al.
     Source : mBio

     Date de publication : 2 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)

Les auteurs confrontent les deux hypothèses en présence quant à l’origine de la pandémie de COVID-19, à savoir une transmission virale à partir d’une source animale sauvage (chauve-souris via un mammifère hôte intermédiaire) ou bien un accident de laboratoire (infection d’un chercheur par un virus de chauve-souris puis sa transmission à d’autres personnes), mais doutent que la science puisse apporter une réponse définitive sur ce sujet.
 
     Auteurs : Brugère-Picoux J. et al.
     Source : Bulletin de l'Académie Nationale de Médecine

     Date de publication : 14 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

Synthèse générale sur les connaissances actuelles relatives à l’origine zoonotique de la COVID-19 et aux espèces animales pouvant être infectées naturellement ou expérimentalement par le SARS-CoV-2 ainsi que sur les recommandations de la Commission européenne en matière de surveillance épidémiologique à exercer en la matière dans un objectif de santé publique
 
     Auteurs : Lean F. Z. X. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 10 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 décembre 2021)

Les auteurs donnent les résultats de leurs études sur la distribution tissulaire de l’ACE2 dans différentes espèces animales (des carnivores, des ongulés, des primates et des chiroptères) réalisées à l’aide de techniques d’immunohistochimie appliquées à des coupes histologiques pour essayer de mieux comprendre les différences de sensibilité de ces espèces au SARS-CoV-2.

     Auteurs : Ekstrand K. et al..
     Source : Animals

     Date de publication : 8 juillet 2021 –(mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont passé en revue la littérature disponible sur la sensibilité des espèces animales au SARS-CoV-2 et sur les facteurs les plus pertinents permettant d’estimer celle-ci ainsi que la capacité de ces espèces à transmettre le virus. Cette revue s’intéresse en particulier au polymorphisme de la TMPRSS2 et de l’ACE2, deux protéines de l’hôte qui contribuent aux différences constatées entre espèces.
 
     Auteurs : Piplani S. et al..
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 24 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Les auteurs ont étudié la capacité plus ou moins grande de la protéine de spicule du SARS-CoV-2 à s’attacher à l’ACE2 de plusieurs espèces animales par comparaison à l’Homme en utilisant une méthode de modélisation structurale de ce récepteur associée à une simulation à l’échelle moléculaire du processus d’attachement. Ils mettent ainsi en évidence une corrélation entre affinité d’attachement et sensibilité à l’infection, et sur cette base discutent aussi l’hypothèse du pangolin comme hôte intermédiaire
 
     Auteurs : Maxmen A. et Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de mise sur un forum de discussion : 8 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)

Les auteurs examinent l’hypothèse selon laquelle le SARS-CoV-2 serait un virus échappé d’un laboratoire chinois ainsi que les arguments scientifiques avancés pour soutenir celle-ci.
 
     Auteur : Garry R. F.
     Source : Virological.org

     Date de mise sur un forum de discussion : 12 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)

S’appuyant sur les études les plus récentes conduites par l’OMS sur l’origine du SARS-CoV-2, l’auteur, en se basant sur les données épidémiologiques et génomiques disponibles, considère que l’hypothèse d’une fuite du virus d’un laboratoire est à écarter et qu’il convient de rechercher cette origine au sein des marchés d’animaux sauvages de Wuhan (Rép. pop. de Chine).
 
     Auteurs : Huang C. et al.
     Source : Journal of Medical Virology

      Date de publication : 11 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)

Par des méthodes statistiques, les auteurs calculent la probabilité d’attachement du virus aux cellules d’un ensemble d’espèces de mammifères. Ils observent aussi que chez sept d’entre elles, les contacts hydrophobes constatés entre le virus et l’ACE2 chez l’Homme font défaut, soit une affinité moindre entre l’un et l’autre chez ces animaux. Pour autant, la structure tridimensionnelle de leur ACE2 rend possible l’attachement viral.
 
     Auteurs : Machado D. J. et al.
     Source : Cladistics

     Date de publication : 26 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)

Analyse phylogénique de génomes complets de différentes lignées d’Orthocoronavirinae conduisant notamment à comprendre les franchissements de la barrière d’espèce parmi 10 ordres dans le règne animal et à corroborer l’idée que des virus hébergés par les chiroptères sont les groupes compagnons des virus en relation avec le SARS-CoV, le SARS-CoV-2 et le MERS-CoV.
 
     Auteurs : Singh D. et Yi S. V.
     Source: Experimental & Molecular Medicine

     Date de publication : 16 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

L’article montre que le génome du SARS-CoV-2 porte la signature de nombreuses recombinaisons anciennes entre différentes souches ainsi que de mutations adaptatives, qui ont rendu en particulier sa protéine de spicule capable de s’attacher aux cellules de nombreuses espèces animales y compris l’Homme.
 
     Auteurs : Wang G. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 10 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)

Cette recherche a conduit à constater que dans l'ADN de 11 espèces d'animaux sauvages ou de laboratoire (chauve-souris Hipposideros pomona, toupaye, souris, hamster doré, etc.) le gène du site d'attachement cellulaire au SARS-CoV-2 (ACE2) est très similaire. En revanche, l'expression du gène (en ARNm et protéine) diffère grandement d'une espèce à l'autre.
 
     Auteurs : Michelitsch A. et al.
     Source : Advances in Virus Research

     Date de publication : 7 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021) 

Essai de classification selon une échelle semi-quantitative de la sensibilité des espèces animales au SARS-CoV-2 en tenant compte, après inoculation du virus, de la détection du génome viral, de la réponse sérologique, de l’apparition de signes cliniques et de la transmission à des congénères ou à l’Homme.
 
     Auteurs : Lei Z. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 5 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)

Cette étude s'intéresse aux divergences existant dans la composition du génome et l'utilisation des codons du SARS-CoV-2 chez l'Homme et différentes espèces d'animaux (chien, différents félins, furet, vison) en vue de comprendre le rôle potentiel de la sélection naturelle dans l'évolution du virus, sa capacité d'adaptation et sa transmission.
 
     Auteur : ProMED, d’après Al Jazeera  
     Source : ProMED

     Date de publication : 31 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Annonce (reprise vraisemblablement de l’agence TASS) de la mise au point en Russie d’un vaccin contre la COVID-19 destiné aux animaux. Ont été inclus dans les essais cliniques des animaux domestiques (chiens et chats) et des animaux à fourrure (visons, renards et renards polaires).
 
     Auteur : OMS  
     Source : OMS

     Date de publication : 30 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)

Rapport de l’équipe d’experts internationaux mise sur pied conjointement par l’OMS et la Rép. pop. de Chine qui s’est rendue du 14 janvier au 10 février 2021 dans la ville de Wuhan pour tenter de découvrir l’origine de l’épidémie de COVID-19. Y sont notamment fournies quelques informations sur la surveillance exercée dans ce pays chez les animaux sauvages et d’élevage, et y sont présentées les hypothèses émises par l’équipe d’experts sur l’origine possible du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Cheng R. R. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)

Partant d'outils théoriques originellement développés pour étudier la conformation des protéines et en prenant l'ACE2 de l'Homme pour référence, les auteurs montrent qu'il est possible de déterminer si une espèces animale particulière est sensible au SARS-CoV-2 à partir de la seule connaissance de la séquence protéique de leur ACE2.
 
     Auteurs : Liu Y. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 3 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)

En étudiant la capacité du récepteur cellulaire (ACE2) de diverses espèces à permettre l’entrée du SARS-CoV-2, les auteurs montrent que ce virus est capable d’infecter un large éventail de mammifères parmi lesquels des animaux de compagnie ou de rente ainsi que des animaux maintenus habituellement en captivité dans des zoos ou des parcs aquatiques.
 
     Auteur : OMS
     Source : OMS

     Date de publication : 28 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Rapport sur la mission conjointe OMS-République populaire de Chine qui s’est déroulée du 16 au 24 février 2021. Ce rapport contient très peu d’éléments sur l’origine de la maladie et les investigations réalisées ou à réaliser sur les animaux sauvages, notamment ceux qui ont pu se trouver sur le marché de Wuhan.
 
     Auteur : Lewis D.
     Source : Nature

     Date de publication : 26 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)

L’article évoque les différentes hypothèses avancées sur l’origine du SARS-CoV-2 en République populaire de Chine ou qui ont été mises en avant par des chercheurs chinois : viande congelée d’animaux de la faune sauvage, surface de denrées alimentaires contaminée, emballages de produits alimentaires. Une origine chez des animaux sauvages vivants reste néanmoins la plus probable.
 
     Auteur : Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de publication : 26 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)

Quelques questions importantes restant pendantes après la réalisation de la mission de l’OMS en République populaire de Chine. Deux d’entre elles concernent le rôle éventuel des animaux sauvages, ou de leurs viandes, vendus sur le marché de Huanan ou d’autres marchés à Wuhan, ainsi que l’éventuelle circulation du SARS-CoV-2 dans la faune chinoise avant que n’apparaisse la pandémie de COVID-19.
 
     Auteurs :  Sun J. et al.
     Source : RCS Advances

     Date de publication : 25 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)

Les auteurs ont réalisé des simulations de dynamique moléculaire concernant les complexes formés par la liaison entre l’ACE2 humaine (hACE2) et le domaine d’attachement de la spicule du SARS-CoV-2, du SARS-CoV, du pangolin-CoV et du RaTG13 de la chauve-souris. En examinant le réseau des ponts hydrogène formés lors de cette liaison et en estimant les énergies libres en jeu localement, les auteurs ont trouvé que le pangolin-CoV et le SARS-CoV-2 s’attachaient à l’hACE2 de manière similaire alors que la liaison avec les deux autres virus était moins forte. Les auteurs considèrent que ces recherches renforcent l’hypothèse selon laquelle le pangolin peut potentiellement jouer le rôle d’hôte intermédiaire du SARS-CoV-2.

     Auteurs : Wardeh M. et al.
     Source : Nature Communications

     Date de publication : 16 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Considérant les recombinaisons génétiques pouvant intervenir entre différentes souches de coronavirus infectant un même hôte, les auteurs examinent à l’aide de méthodes d’intelligence artificielle les possibilités de génération de nouveaux coronavirus chez les animaux domestiques et sauvages. L’une de leurs conclusions est que l’éventail des espèces potentiellement porteuses du SARS-CoV-2 pourrait être plus large que ce que les connaissances actuelles laissent penser.
 
     Auteur : ProMED, d’après le New York Times
     Source : ProMED

     Date de publication : 14 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)

Informations qui ont été fournies au New York Times par l’un des membres de la mission internationale de l’OMS qui s’est rendue en République populaire de Chine sur les conclusions qui ont pu en être tirées, en particulier en matière de vente d’animaux de la faune sauvage sur le marché aux poissons de Wuhan. Suivent des commentaires de ProMED sur les déclarations passées des autorités chinoises locales et du directeur du CDC chinois.
 
‘Major stones unturned’: COVID origin search must continue after WHO report, say scientists
     Auteurs : Mallapaty S. et al.  
     Source : Nature

     Date de publication : 10 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)

L’article propose un résumé des conclusions que le groupe d’experts en épidémiologie constitué par l’OMS a tirées de sa mission en République populaire de Chine. Le groupe a exclu la possibilité d’une échappée du SARS-CoV-2 d’un laboratoire et a formulé plusieurs recommandations visant à poursuivre les recherches à partir de prélèvements humains ou animaux pour tenter de déterminer l’origine de ce virus.
 
Animal Coronaviruses and SARS-COV-2 in Animals, What Do We Actually Know?
     Auteurs : Bonilauri P. et Rugna G.  
     Source : Life

     Date de publication : 5 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)

Revue des connaissances sur le SARS-CoV-2 chez les animaux domestiques et sauvages.
 
     Auteurs : Zhang T. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 2 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)

Etude de l’affinité entre l’ACE2 de différents types de gnathostomes (vertébrés à mâchoire) et le domaine d’attachement de la protéine de spicule du SARS-CoV-2. Cette affinité n’est que rarement élevée chez les animaux n’appartenant pas à la classe des mammifères. 
 
     Auteurs : Li P. et al.
     Source : Science Bulletin

     Date de publication : 19 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Comparaison du récepteur ACE2 dans différentes espèces animales domestiques ou sauvages pour le RaTG13 (coronavirus de la chauve-souris), le SARS-CoV, et le SARS-CoV-2.
 
     Auteur : ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control)
     Source : ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control)

     Date de publication : 18 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)

Il s’agit d’une note technique destinée à fournir aux laboratoires et aux décideurs des lignes directrices sur la mise en place de capacités de séquençage du SARS-CoV-2, sur les techniques à utiliser et sur l’usage de ce séquençage en matière de diagnostic, de recherche ainsi que d’enquêtes sur les foyers et de surveillance de la maladie, y compris dans le domaine animal.
 
     Auteurs : Zhou P. et Shi Z-L.
     Source : Science

     Date de publication : 8 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Ces deux chercheurs de la République populaire de Chine mettent l’accent sur l’aspect zoonotique du SARS-CoV-2, en commentant en particulier les évolutions de son génome au sein de chaque espèce atteinte et des effets que ces dernières peuvent avoir en termes de transmissibilité et de pathogénicité du virus ainsi que d’efficacité des vaccins destinés à l’Homme.
 
     Auteur : ProMED, d’après CBS, AFP, South China Morning Post et Yangtze Daily
     Source : ProMED

     Date de publication : 6 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

ProMED fait état des dernières informations concernant les négociations qui se poursuivent entre l’OMS et la République populaire de Chine sur la mission d’un groupe d’experts devant se rendre dans ce pays pour tenter de déterminer l’origine de la COVID-19. Sont aussi données des informations sur les mesures prises sur le marché aux produits de la mer de Wuhan.
 
     Auteur : Plateforme ESA
     Source : Plateforme ESA

     Date de publication : 5 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)

Cette note présente l'état des connaissances sur la COVID-19 et les animaux, actualisé au 05/01/2021.
 
     Auteurs : Castiglione G. M. et al.
     Source : bioRxiv

     Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 4 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Un mécanisme conservé au cours de l’évolution qui s’avère essentiel à l’activité catalytique de l’ACE2 est exploité par le SARS-CoV-2 pour se lier aux cellules, ce qui permet potentiellement à ce virus d’infecter un très large éventail d’espèces.
 
     Auteurs : Moustaqil M. et al.
     Source : Emerging Microbes & Infections

     Date de publication : 29 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 janvier 2021)

Les auteurs démontrent que des protéases du SARS-CoV-2 peuvent directement cliver des protéines intervenant dans la réponse immunitaire innée de l’hôte (IRF3, NLRP12 et TAB1). Ils étudient s’il y a ou non clivage de ces facteurs immuns dans différentes espèces animales et en tirent des conclusions sur la difficulté de trouver des modèles animaux adéquats de la COVID-19. Ils poursuivent leur étude sur ce sujet en prenant notamment en compte diverses espèces de chauves-souris.
 
     Auteurs : Kenney S. P. et al.
     Source : Veterinary Pathology

     Date de publication : 28 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 janvier 2021)

Les auteurs considèrent que les maladies animales dues à des coronavirus fournissent des exemples intéressants pour comprendre l’épidémie actuelle de SARS-CoV-2. Ils donnent des informations actualisées sur plusieurs maladies animales à coronavirus (espèce hôte originelle, passage d’une espèce animale à l’autre, risque pour les humains, etc.).
 
     Auteurs : Conceicao C. et al.
     Source : PLOS BIOLOGY

     Date de publication : 21 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)

Les auteurs montrent que la glycoprotéine de spicule du SARS-CoV-2 a un tropisme marqué pour les récepteurs ACE2 non seulement de l’Homme mais aussi de nombre de mammifères, malgré les différences existant dans les séquences d’acides aminés de ces récepteurs. Ils identifient au sein de l’interface protéine de spicule – ACE2, par différentes méthodes, des résidus d’acides aminés qui sont susceptibles d’avoir joué un rôle essentiel dans l’apparition du SARS-CoV-2 chez l’Homme.

     Auteurs : Elaswad A. et al.
     Source : PeerJ

     Date de publication : 18 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)

Comparaison des génomes de souches du SARS-CoV-2 isolées chez différentes espèces animales avec ceux d’isolats humains provenant du même clade et de la même localisation géographique.
 
     Auteurs : Delgado Blanco J. et al.
     Source : PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY

     Date de publication : 7 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)

Les auteurs examinent la variabilité de l’interaction entre le domaine de liaison cellulaire chez différentes espèces animales ainsi que chez des individus et la protéine S de différents isolats du SARS-CoV-2 ; par modélisation, ils montrent que l’énergie d’interaction à ce niveau et d’autres facteurs décrits expliquent la sensibilité différente de ces espèces, l’Homme s’avérant le plus sensible.
 
     Auteurs : Rodrigues J. P. G. L. M. et al.
     Source : PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY

     Date de publication : 3 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)

Les auteurs ont notamment étudié par modélisation informatique les propriétés structurelles des récepteurs cellulaires ACE2 auxquels la protéine de spicule du SARS-CoV-2 se lie ainsi que les spécificités de ces récepteurs existant chez les espèces non sensibles au virus.
 
     Auteur : Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de publication : 2 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

L’auteur décrit la composition de l’équipe de chercheurs qu’a constituée l’OMS pour enquêter sur l’origine de la pandémie de COVID-19 en R. P. de Chine. Parmi ces chercheurs, originaires majoritairement d’Europe, figurent des virologistes ainsi que des spécialistes de santé publique et des zoonoses.
 
Multi‐species ELISA for the detection of antibodies against SARS‐CoV‐2 in animals
     Auteurs : Wernike K. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 15 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)

Mise au point d’un test ELISA indirect qui repose sur le domaine de liaison (RBD) de la protéine de spicule du SARS‐CoV‐2 et qui peut être utilisé pour de multiples espèces animales.
 
     Auteur : Mallapaty S.
     Source : Nature

     Date de publication : 11 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

L’auteur fait part des diverses difficultés auxquelles va être confrontée l’équipe internationale d’épidémiologistes constituée par l’OMS dans la recherche de l’origine de la COVID-19 au cours de ses investigations en République populaire de Chine.
 
     Auteurs : Buonocore M. et al.
     Source : Heliyon

     Date de publication : 5 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)

Par analyse des séquences d’amino-acides de la protéine ACE2 chez les animaux domestiques ou sauvages communément présents en Italie, les auteurs essayent de déterminer ceux d’entre eux qui pourraient jouer le rôle de réservoir du SARS-CoV-2 ou bien échanger le virus avec la population humaine.
 
     Auteur : OMS
     Source : OMS

     Date de publication : 5 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

Cahier des charges établi par l’OMS en accord avec les autorités de la République populaire de Chine pour la constitution d’une équipe internationale multidisciplinaire en vue de déterminer l’origine de la COVID-19. Ce cahier des charges comprend des volets portant sur les animaux sauvages libres ou tenus en captivité ainsi que sur les produits d’origine animale.
 
     Auteur : Pigenet Y.
     Source : CNRS Le journal

     Date de publication : 28 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)

Le virologue Étienne Decroly, Directeur de recherche au CNRS, fait le point sur les différentes hypothèses relatives à l’origine du SARS-CoV-2, dont celle de l’échappement accidentel d’un laboratoire.
 
     Auteurs : Guebre-Xabier M. et al.
     Source : Vaccine

     Date de publication : 23 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)

Essai d’un vaccin adjuvé dénommé NVX-CoV2373 contre la COVID-19 chez le macaque crabier (Macaca fascicularis).
 
     Auteurs : Hobbs E. C. et Reid T. J.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 22 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)

Revue détaillée de la littérature scientifique disponible (à la date de rédaction de l’article) sur la sensibilité au SARS-CoV-2 de différentes espèces animales.
 
     Auteurs : Jo W. K. et al.
     Source : Transboundary and Emerging Diseases

     Date de publication : 9 octobre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Les auteurs présentent un panorama des connaissances sur le SARS-CoV-2, en mettant l’accent sur son potentiel zoonotique, et discutent des stratégies disponibles dans le cadre d’une approche dite « une seule santé ».
 
     Auteurs : Lam S. D. et al.
     Source : Scientific Reports

     Date de publication : 5 octobre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 octobre 2020)

Les chercheurs montrent par modélisation de la façon dont la protéine de spicule du SARS-CoV-2 s’attache à la protéine ACE-2 que chez certaines espèces de mammifères, ce lien pourrait s’établir aussi fermement qu’il le fait en cas d’infection humaine, ce qui pose une nouvelle fois la question du rôle de réservoir qu’elles pourraient jouer.
 
     Auteurs : Alexander M. R. et al.
     Source : The FASEB Journal

     Date de publication : 4 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)

Les auteurs combinent la sensibilité connue de différentes espèces animales au SARS-CoV-2 avec des analyses de structure pour repérer des positions clés d’acides aminés du récepteur ACE2 dans ces espèces. Ils s’en servent pour construire une échelle de sensibilité au SARS-CoV-2 applicable à tout un ensemble d’espèces.
 
     Auteurs : Wu L. et al.
     Source : Cell Discovery

     Date de publication : 29 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)

Étude de la capacité de l’ACE2 de 26 espèces animales domestiques ou sauvages à se lier au domaine d’attachement du SARS-CoV-2, et examen au microscope électronique de cette liaison pour ce qui concerne le chat.
 
     Auteurs : Muñoz-Fontela C. et al.
     Source : Nature

     Date de publication : 23 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 octobre 2020)

Les auteurs résument les connaissances actuelles sur les espèces animales susceptibles ou non d’être utilisées comme modèles pour tester des candidats vaccins et des médicaments dans la lutte contre la COVID-19.
 
     Auteurs : Damas J. et al.
     Source : PNAS

     Date de publication : 8 septembre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 octobre 2020)

Après analyse comparative des séquences ACE2 de 410 espèces de vertébrés, les auteurs suggèrent qu’un grand nombre de mammifères pourraient éventuellement être infectés par le SARS-CoV-2. Ils considèrent que cela peut aider à identifier des hôtes intermédiaires du virus et soulignent les risques d’infection encourus par les espèces menacées d’extinction.
 
     Auteurs : Sansom Ph. et al.
     Source : The Naked Scientists
     Date de publication : 1er septembre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 septembre 2020)
 
     Auteurs : Zhao Xuesen et al.
     Source : Journal of Virology

     Date de publication : 31 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 octobre 2020)

Les auteurs ont étudié les récepteurs ACE2 de 14 espèces de mammifères et ont trouvé que plusieurs d’entre elles pouvaient être infectées par le type sauvage du SARS-CoV-2 ou son mutant caractérisé par une délétion au niveau du site de clivage de la furine dans la protéine de spicule.
     Auteur : Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
     Source : Centers for Disease Control and Prevention (CDC)

     Date de publication : 12 août 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)

Ce texte indique les règles à respecter aux Etats-Unis pour le dépistage/diagnostic de l'infection des animaux par le virus SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : Sallard E. et al.
     Source : Médecine/Sciences

     Date de publication : 10 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)

En se fondant sur des inférences phylogénétiques, l’analyse des séquences et les relations structure-fonction des protéines de coronavirus, éclairées par les connaissances disponibles, les auteurs discutent différents scénarios pour rendre compte de l’origine - naturelle ou synthétique - du SARS-CoV-2.
 
     Auteurs : El Masry I. et al.
     Source : FAO
     Date de publication : 20 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 août 2020)
     Auteurs : Zhai Xiaofeng et al.
     Source : Journal of Virology

     Date de publication : 16 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 octobre 2020)

Se basant sur les structures révélées par rayon X du récepteur ACE2 chez l’être humain, les auteurs examinent la possibilité de liaison entre ce récepteur tel que retrouvé chez différentes espèces animales et la protéine de spicule du SARS-CoV-2 (animaux de compagnie, animaux de ferme et animaux hôtes intermédiaires éventuels du virus).
 
     Auteur : Cohen J.
     Source : Science Magazine

     Date de publication : 10 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)

L'article mentionne la visite d'une équipe de l'OMS en République populaire de Chine, préalable à l'enquête épidémiologique qui devrait être organisée entre ce pays et l'organisation internationale sur l'origine (zoonotique) de la pandémie. Il reprend l'historique, les informations disponibles et les hypothèses émises à ce jour sur ce sujet. ProMED a repris cet article sur sa page d'accueil avec quelques commentaires.
 
     Auteur : DHS Science and Technology
     Source : Department of Homeland Security (DHS)

     Date de publication : 7 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)

Ce texte, actualisé chaque semaine, comporte au 7 juillet 2020 la liste en 20 pages des principales questions et réponses correspondantes sur le COVID-19 ; les animaux sont plus particulièrement évoqués pages 3, 5 et 16. A cette date, il est enrichi de 552 références bibliographiques accompagnées de leur lien.
 
     Auteur : OIE
     Source : OIE

     Date de publication : 3 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)

Il s’agit de lignes directrices élaborées par l’OIE sur les conditions dans lesquelles des animaux domestiques ou sauvages devraient être testés vis-à-vis du SARS-CoV-2 et les cas positifs signalés à cette organisation internationale.
 
     Auteurs : Li X. et al.
     Source : Science Advances

     Date de publication : 1er juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)

L’article avance des hypothèses quant aux recombinaisons qui ont pu se produire dans les gènes codant le domaine d’attachement au récepteur cellulaire de la protéine de spicule de coronavirus de chauves-souris et de pangolins, pour aboutir à l’infection de l’Homme par le SARS-CoV-2.
 
     Auteur : U.S. Food and Drug Administration
     Source : U.S. Food and Drug Administration

     Date de publication : 24 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2020)

Cette page donne accès à une liste de contrôle standardisée sur les prélèvements et données à collecter lors de l’autopsie d’un animal atteint ou suspect d’être atteint par le SARS-CoV-2.
 
     Auteur : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service
     Source : U.S. Department of Agriculture – Animal and Plant Health Inspection Service

     Date de publication : 18 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)

En cas de suspicion de foyer de SARS-CoV-2 chez les animaux, le document fixe les critères à utiliser pour déclarer un cas suspect, un cas probablement positif et un cas confirmé.
 
     Auteur : Cyranoski D.
     Source : Nature
     Date de publication : 5 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 Juillet 2020)
 
     Auteur : Académie des sciences – Cellule de crise Coronavirus
     Source : Académie des sciences

     Date de publication : 11 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 mars 2022)

Cette fiche explique de manière synthétique quelles sont les méthodes employées dans le cadre des recherches sur l’origine du SARS-CoV-2 et son évolution : séquençage, analyse informatique des séquences, construction des arbres phylogéniques. Elle évoque également l’éventuel rôle des chauves-souris et des pangolins dans la genèse vraisemblablement ancienne du SARS-CoV-2.

     Auteurs : Cleary S. J. et al.
     Source : British Journal of Pharmacology

     Date de publication : 27 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)

Les auteurs passent en revue les modèles animaux pouvant servir aux recherches sur l’infection par le SARS‐CoV‐2 et les mécanismes pathogènes en jeu dans la COVID‐19. Ils proposent différents moyens de rendre ces modèles plus performants pour conduire les études de pathogénicité et d’évaluation de possibles traitements.
 
     Auteurs : Fam B. S. O. et al.
     Source : Genetics and Molecular Biology

     Date de mise sur un forum de discussion : 22 avril 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)

Analyse génomique comparative des orthologues de l’ACE2 de 70 espèces de mammifères placentaires (16 domestiques et 54 sauvages), en vue notamment de mettre en évidence l’influence des différences existant entre les séquences d’amino-acides de cette enzyme sur la possibilité d’infection de ces espèces et sur le franchissement de la barrière d’espèce.
 
     Auteurs : Decaro N. et al.
     Source : Research in Veterinary Science
     Date de publication : 7 avril 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 Juillet 2020)
 
     Auteurs : Andersen K. G. et al.
     Source : Nature Medicine

     Date de publication : 17 mars 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)

 Hypothèses sur l’origine zoonotique du SARS-CoV-2, les auteurs argumentant pour écarter celle d’une échappée du virus d’un laboratoire.
 
     Auteur : Brugère-Picoux J.
     Source : Association française pour l'avancement des sciences
     Date de publication : 31 janvier 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 Juillet 2020)
 
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APERÇU SUR L’ÉVOLUTION DE LA TUBERCULOSE BOVINE
EN FRANCE AU DÉBUT DU XXIe SIÈCLE (2001-2023)
Chillaud Thierry1
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RÉSUMÉ
Le présent article se propose de dresser l’historique de la tuberculose bovine en France métropolitaine de l’an 2001 à aujourd’hui en s’appuyant sur les articles scientifiques et autres documents sur ce thème qui sont librement accessibles sur l’internet. Il montre les difficultés auxquelles les services de l’État et leurs partenaires dans la surveillance et la lutte contre la maladie se sont heurtés au fil des ans ainsi que les différents plans et dispositifs qui ont été mis en place pour tenter de les surmonter. Force est de constater que malgré tous les efforts consentis, l’objectif d’éradication fixé depuis de nombreuses années est encore loin d’être en vue.
Mots-clés : Surveillance, prophylaxie, tuberculose, bovins, faune sauvage, évaluation.

ABSTRACT
This article aims to draw up the history of bovine tuberculosis in mainland France from 2001 to today, based on scientific articles and other documents on this theme which are freely accessible on the internet. It shows the difficulties that state services and their partners in monitoring and combating the disease have encountered over the years as well as the various plans and systems that have been put in place to try to overcome them. It is clear that despite all the efforts made, the eradication objective set for many years is still far from being in sight.
Keywords: Surveillance, control, tuberculosis, bovines, wildlife, evaluation.

I - INTRODUCTION


La France a été déclarée officiellement indemne de tuberculose bovine par décision de la Commission européenne 2001/26/CE du 27 décembre 2000 prise dans le cadre des dispositions de la directive 64/432/CEE du conseil du 26 juin 1964 relative à des problèmes de police sanitaire en matière d'échanges intracommunautaires d'animaux des espèces bovine et porcine (déclaration renouvelée par le règlement d’exécution (UE) 2021/620 de la Commission du 15 avril 2021 établissant les modalités d’application du règlement (UE) 2016/429 du Parlement européen et du Conseil en ce qui concerne l’approbation du statut «indemne de maladie» et du statut de non-vaccination de certains États membres ou de zones ou compartiments de ceux-ci au regard de certaines maladies répertoriées et l’approbation des programmes d’éradication de ces maladies répertoriées).

_______________
Article reçu le 5 mai 2024 ; accepté le xx xx 2024
1 Inspecteur général de santé publique vétérinaire à la retraite

Ce statut, tel que défini par ladite directive (moins de 0,1 % d'élevages bovins infectés), a été obtenu grâce à un programme de prophylaxie collective de la maladie lancé par l’État français à partir de 1954 sur l’ensemble du territoire national dans les élevages bovins. Il semblait marquer une sorte de consécration après des années d’efforts en association avec les parties prenantes (administration vétérinaire de terrain en collaboration avec les vétérinaires sanitaires et les éleveurs soutenus par leurs organisations représentatives). Les résultats de la lutte tels qu’ils apparaissaient à cette époque ont pu être qualifiés d’incontestable succès par des spécialistes [Bénet et al., 2006], même si ceux-ci soulignaient les limites de la stratégie appliquée jusque là, la simple recherche de l’infection en vue de son élimination ayant montré ses insuffisances vis-à-vis de la protection des élevages indemnes.
Quoi qu’il en soit, cette acquisition de statut pouvait laisser penser que l’éradication n’était pas loin d’être achevée, même si la notion de « territoire indemne » telle que définie par l’Union européenne pouvait donner lieu à discussion [Toma et al., 2001a] mais présentait l’avantage de faciliter les échanges de bovins vivants et de leurs produits dans le cadre de la réalisation du marché commun européen.
Est présentée ci-après la courbe d’évolution de la tuberculose bovine en France de 1995 à 2023. Force est de reconnaître que l’objectif de l’éradication n’a pas encore été atteint, et que s’est même produit une remontée de la prévalence apparente troupeaux entre 2004 et 2018 ainsi qu’une tendance à la remontée de l’incidence apparente troupeaux entre 2004 et 2020, ces phénomènes résultant d'une réelle ré-émergence dans certains territoires et d'une meilleure détection des foyers dans d'autres.
Compte tenu de ce constat, il est apparu intéressant de tenter de dresser un historique relatif à l’évolution de la tuberculose bovine en France depuis 2001 au travers des publications qui sont en accès libre sur l’Internet.

Figure 1 (non citée dans le texte)
Courbe d’évolution de la tuberculose bovine en France métropolitaine de 1995 à 2023
(Source : Direction générale de l’alimentation)

 

 

 

 

 

 

 

 

 
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