Influenza aviaire : Modélisation du risque d'infection des oiseaux à partir d'étangs contaminés

M René et D Bicout

Résumé:
De répartition mondiale, l'influenza aviaire est une maladie infectieuse due aux virus Influenza de type A, dont les réservoirs naturels sont des oiseaux sauvages des milieux aquatiques. On distingue les virus Hautement Pathogènes (HP) et Faiblement Pathogènes (FP) en fonction de leur pouvoir pathogène expérimental chez le poulet. L'extension géographique récente du virus Influenza aviaire H5N1 Hautement Pathogène et la répétition de contaminations humaines directes ravivent le spectre des grandes pandémies. Si la transmission oro-fécale des virus Influenza via l'eau des étangs contaminés est un mécanisme désormais reconnu pour la contamination des oiseaux sauvages, la capacité de persistance de ces virus dans ce milieu demeure peu documentée. L'objectif de cette étude est de modéliser le mécanisme d'entretien et de persistance des virus Influenza A FP et HP dans un écosystème constitué de canards sauvages et d'un étang afin d'évaluer le risque d'infection que représente l'eau des étangs contaminés pour les oiseaux sauvages et domestiques. L'amplification virale dans la population d'oiseaux a été étudiée selon un modèle SEIR et la survie des virus dans l'eau par une cinétique de déplétion. Les paramètres du modèle ont été déterminé à partir de la littérature. Appliquées aux conditions environnementales de la région de la Dombes, différentes simulations permettent de conclure à un risque d'infection via l'eau élevé pour des souches FP et à un entretien possible de l'infection dans l'écosystème pour certaines conditions de densité d'oiseaux et de renouvellement de populations sensibles. En ce qui concerne les virus HP, le risque d'infection par l'eau contaminée est faible avec un entretien de l'infection peu probable sauf conditions exceptionnelles. Ces résultats sont toutefois préliminaires du fait de la constante et imprévisible évolution des virus.

Mots-clé: étang, modélisation, risque d’infection, Virus Influenza aviaire