A la Une
- Détails
- Catégorie parente: Ressources
- Catégorie : COVID-19 et monde animal
Date de publication : 26 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)
Date de publication : 26 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 mai 2022)
Date de publication : 9 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)
Date de publication : 30 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 mai 2022)
Date de publication : 29 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Date de publication : 25 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 23 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 23 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)
Date de publication : 23 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 avril 2022)
Date de publication : 9 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)
Date de publication : 9 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)
Date de publication : 1er mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Date de publication : 1er mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 23 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 19 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 18 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)
Date de publication : 16 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)
Date de publication : 16 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)
Date de publication : 14 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 mars 2022)
Date de publication : 12 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 7 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 31 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 février 2022)
Date de publication : 25 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 21 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 20 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 janvier 2022)
Date de publication : 12 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)
Date de publication : 11 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 février 2022)
Date de publication : 9 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 février 2022)
Date de publication : 13 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)
Il s’agit d’une enquête réalisée entre février et mai 2021 à Hong Kong (Rép. pop. de Chine) sur 217 rongeurs (189 Rattus norvegicus - le rat surmulot, et 28 R. tanezumi – appelé rat d’Asie) dans des zones où le SARS-CoV-2 avait été détecté dans les eaux usées. Aucun ARN du virus n’a été mis en évidence chez ces animaux et un seul d’entre eux a présenté un résultat positif en sérologie.Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 12 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)
Les auteurs signalent la confirmation d’un cas d’infection par le variant Delta du SARS-CoV-2 d’un léopard indien (Panthera pardus fusca) sauvage dont le cadavre a été découvert dans un village forestier de l’Uttar Pradesh (Inde).Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 10 janvier 2022– (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 janvier 2022)
Les auteurs décrivent la propagation du variant Alpha du SARS-CoV-2 parmi des gorilles et des félins du zoo de Prague (République tchèque). Ils évoquent les voies par lesquelles ces animaux ont pu être contaminés. Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 7 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 16 janvier 2022)
Date de publication : 23 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)
Confirmation, à partir de prélèvements pratiqués entre janvier et mars 2021, de l’infection par le SARS-CoV-2 de cerfs de Virginie (Odocoileus virginianus) vivant en liberté dans neuf sites du Nord-Est de l’État de l’Ohio (États-Unis d’Amérique). Trois lignées du virus ont été détectées. La transmission du virus de l’Homme aux animaux s’est produite plusieurs fois, et la transmission de cerf à cerf a pu aussi intervenir.
Date de publication : 21 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)
Confirmation d’un premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez un lynx du Canada (Lynx canadensis) ayant présenté une toux et de l’abattement dans un zoo de Pennsylvanie (États-Unis d’Amérique).Date de publication : 17 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)
Date de publication : 10 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 7 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)
Date de publication : 6 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Deux hippopotames du zoo d’Anvers (Belgique) ont présenté pour seuls symptômes des écoulements nasaux anormaux. Les épreuves diagnostiques réalisées à la demande du vétérinaire du zoo ont montré que ces animaux étaient infectés par le SARS-CoV-2.Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 3 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 1er décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Première détection de l’infection par le SARS-CoV-2 de cerfs de Virginie au Canada (dans la province de Québec), à partir de prélèvements collectés début novembre 2021. Comme aux États-Unis d’Amérique, les cerfs prélevés ne présentaient aucun signe de maladie.Date de publication : 29 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 29 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 12 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 11 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Première confirmation de cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez deux hyènes tachetées (Crocuta crocuta) détenues par le zoo de Denver (États-Unis d’Amérique). Cette infection, qui survient après celle de lions et de tigres, ne s’est traduite que par de légers symptômes chez ces hyènes.Date de publication : 10 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 décembre 2021)
Les auteurs ont étudié le génome des coronavirus proches du SARS-CoV-2 isolés chez 163 pangolins saisis dans la province du Yunnan (Rép. pop. de Chine) pour importation illégale et fait l’analyse génomique d’un coronavirus isolé chez un pangolin à queue courte (Manis pendactyla). Leurs résultats, ajoutés à ceux d’autres auteurs, conduisent à penser qu’il existe une grande diversité génétique parmi les coronavirus de pangolins et que ces animaux seraient des hôtes naturels et non pas accidentels de ces virus.Date de publication : 9 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 3 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Résultats d’une enquête sérologique portant sur le SARS-CoV-2 réalisée chez des cerfs de Virginie vivant en liberté dans quatre États des États-Unis d’Amérique, qui indiquent que des groupes de ces animaux ont été exposés au virusDate de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 1er novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Recherche conduite dans trois comtés du Texas (États-Unis d’Amérique) en vue de mettre en évidence l’éventuel rôle de transport mécanique du SARS-CoV-2 par des insectes (diptères et blattes) dans une quarantaine de foyers (dont certains possédant des chiens ou des chats) où au moins un cas humain de COVID-19 a été diagnostiqué.Date de publication : 28 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 16 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
L’article fournit des informations sur les relations entre chauves-souris et coronavirus, les caractéristiques de ces derniers qui favorisent leur transmission à d’autres espèces, et les régions où cette transmission a une plus forte probabilité de se produire du fait des pratiques humaines (Asie Sud et du Sud-Est).Date de publication : 14 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 14 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 6 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 29 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 28 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Les auteurs ont mis en évidence chez l’Homme un gène qui lorsqu’il est absent contribue à des formes plus graves de COVID-19. Ce gène code pour une enzyme « détectrice » de l’ARN double brin, dont la forme prénylée est très active contre le SARS-CoV-2. Cette enzyme prénylée est absente chez les rhinolophidés, ce qui en ferait de très bons réservoirs à virus, sans qu’on puisse expliquer pourquoi cette absence favoriserait la tolérance virale chez ces chauves-souris et un pouvoir pathogène accru chez l’Homme.Date de publication : 25 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Les prélèvements effectués sur 60 singes néotropicaux vivant à proximité des villes de Manaus (État d’Amazonas) et São José do Rio Preto (État de São Paulo), deux lieux de fort impact de l’épidémie de COVID-19 au Brésil, n’ont pas mis en évidence l’infection de ces singes par le SARS-CoV-2Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 20 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)
Date de publication : 31 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)
Date de publication : 23 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)
Date de publication : 26 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)
Date de publication : 25 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Date de publication : 17 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 16 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)
Date de publication : 4 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)
Date de publication : 28 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)
Date de publication : 19 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)
Date de publication : 15 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)
Date de publication : 12 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)
Date de publication : 6 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)
Date de publication : 5 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)
Date de publication : 2 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 juillet 2021)
Date de publication : 29 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)
Date de publication : 25 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)
Date de publication : 15 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
L’objectif de ce document canadien est de fournir des recommandations générales aux autorités fédérales, provinciales et locales ainsi qu’aux agences et organisations s’occupant d’animaux sauvages afin de minimiser le risque de transmettre le SARS-CoV-2 à ceux-ci. Le document comprend aussi deux annexes, l’une pour les chercheurs et l’autre pour les établissements de soins animaliers ainsi que pour les agents chargés de la lutte contre les nuisibles.Date de publication : 14 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)
Date de publication : 10 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)
Date de publication : 9 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 juin 2021)
Date de publication : 9 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)
Date de publication : 7 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 juin 2021)
Date de publication : 3 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 28 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)
Date de publication : 21 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)
Date de publication : 19 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)
Date de publication : 18 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Date de publication : 16 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)
Date de publication : 12 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 mai 2021)
Date de publication : 3 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)
Date de publication : 28 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)
Date de publication : 20 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 mai 2021)
Date de publication : 18 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 2 mai 2021)
Date de publication : 9 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 25 avril 2021)
Date de publication : 7 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)
Date de publication : 1er avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)
Date de publication : 30 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)
Date de publication : 19 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)
Date de publication : 12 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 mars 2021)
Date de publication : 10 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)
Date de publication : 1er mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)
Date de publication : 15 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)
Date de publication : 11 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)
Date de publication : 9 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)
Date de publication : 8 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)
Date de publication : 5 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)
Date de publication : 1er février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)
Date de publication : 29 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)
Date de publication : 26 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)
Date de publication : 21 janvier 2021 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)
Date de publication : 20 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)
Date de publication : 12 janvier 2021 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 février 2021)
Date de publication : 11 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)
Date de publication : 30 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)
Date de publication : 23 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 janvier 2021)
Date de publication : 17 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)
Date de publication : 11 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)
Date de publication : 11 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)
Date de publication : 9 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)
Date de publication : 3 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)
Date de publication : 2 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)
Date de publication : 2 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)
Date de publication : 29 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)
Date de publication : 29 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)
Date de publication : 27 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)
Date de publication : 13 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)
Date de publication : 9 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)
Date de publication : 6 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)
Date de publication : 5 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)
Date de publication : 3 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)
Date de publication : 2 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Date de publication : 25 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)
Date de publication : 5 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 juillet 2021)
Date de publication : 28 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 décembre 2020)
Date de publication : 28 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 juin 2021)
Date de publication : 27 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2020)
Date de publication : 7 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 octobre 2020)
Date de publication : 23 juin 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 octobre 2020)
Date de publication : 21 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 décembre 2020)
Date de publication : 2 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 mai 2021)
Ce rapport évalue le risque que des personnes transmettent le SARS-CoV-2 aux chauves-souris d’Amérique du Nord, en ciblant la saison d’activité de ces animaux dans la zone tempérée de la région (15 avril au 15 novembre) et en prenant pour modèle la petite chauve-souris brune (Myotis lucifugus).Date de publication : 18 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)
Date de publication : 14 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)
Etude du génome d’un coronavirus trouvé dans deux groupes de pangolins malais malades, probablement importés illégalement en République populaire de Chine. Ce coronavirus du pangolin était génétiquement associé au SARS-CoV-2 sans pour autant en être le précurseur.Date de publication : 12 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)
Date de publication : 11 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)
Date de publication : 7 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)
Date de publication : 26 mars 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 23 août 2020)
Dans cet article, est rapportée la présence d’un coronavirus très proche du SARS-CoV-2 chez des pangolins javanais (Manis javanica) saisis dans le sud de la République populaire de Chine pour importation illégale.
Date de publication : 21 février 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)
Aller à :
Accueil : COVID-19 et monde animal
Thème 1 : Le SARS-CoV-2 au sein des Coronavirus
Thème 2 : COVID-19 et animaux sauvages
Thème 3 : COVID-19 et animaux de compagnie
Thème 4 : COVID-19 et animaux de production
Thème 5 : COVID-19 et animaux de laboratoire
Thème 6 : Prévention de la contamination de l'Homme par le SARS-CoV-2 à partir des animaux
- Détails
- Catégorie parente: Ressources
- Catégorie : COVID-19 et monde animal
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 19 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)
Cet article s’appuie sur des analyses statistiques appliquées à un large éventail de simulations comparatives de dynamique moléculaire pour évaluer le risque de transmission des variants préoccupants du SARS-CoV-2 de l’être humain à la chauve-souris (Rhinolophus macrotis). Si la souche originelle et les premiers variants préoccupants de ce virus avaient montré une nette capacité à s’attacher tant à l’ACE2 humaine (hACE2) qu’à celle de chauve-souris, les variants Delta et Omicron marquent une évolution adaptative à l’hACE2. Les auteurs considèrent néanmoins qu’il existe toujours un risque significatif d’infection par des variants préoccupants entre espèces de mammifères avec la survenue de nouvelles vagues de COVID-19.
Date de publication : 4 avril 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Cette page Internet fournit des informations sur les espèces animales chez lesquelles l'infection par le SARS-CoV-2 a été identifiée aux États-Unis d’Amérique. Le tableau qu’elle contient est régulièrement actualisé.
Date de publication : 17 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 mars 2022)
En utilisant un outil informatique mis au point précédemment, les auteurs ont développé une méthode fondée sur de nouvelles variables tirées de la fréquence des codons liés au spicule des coronavirus (RSCU - Relative Synonymous Codon Usage, ou biais d’usage du code) pour expliquer la spécificité d’hôte du SARS-CoV-2. En utilisant cette méthode de modélisation, ils arrivent comme d’autres chercheurs à la conclusion que les chauves-souris sont très vraisemblablement les hôtes naturels à l’origine de ce virus.
Date de publication :11 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)
Constatant que la phylogénie et les constituants de l’ACE2 ne permettaient pas de conclure quant à la capacité d’entrée du SARS-CoV-2 dans les cellules de différents hôtes, les auteurs ont examiné six paramètres susceptibles d’intervenir dans l’attachement de la spicule virale à l’ACE2. Ils ont constaté que ces six paramètres ne conduisaient pas à discriminer des ordres de mammifères sensibles et d’autres qui ne le sont pas, et ont alors eu recours à un modèle de régression logistique faisant appel à ces six paramètres pour évaluer la sensibilité potentielle de différentes espèces d’animaux.
Date de publication : 4 mars 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 mars 2022)
Nouvelle méthode de bio-informatique pour déterminer quels sont les animaux potentiellement sensibles au SARS-CoV-2 en se fondant sur l’intensité de l’arrimage entre la protéine de spicule du virus et la protéine ACE2 plutôt que sur le séquençage et la structure de cette dernière. Est aussi simulée pour différentes espèces l’influence de certaines mutations sur l’affinité de liaison entre ACE2 et site d’attachement du SARS-CoV-2.
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)
Par analyse spatiale, les auteurs montrent que les premiers cas humains de COVID-19 apparus en décembre 2019 étaient distribués près et aux alentours du marché de Huanan à Wuhan (Rép. pop. De Chine). Ils signalent également que des animaux vivants, dont des chiens viverrins, étaient vendus sur ce marché fin 2019, et que les prélèvements environnementaux positifs pour la recherche du SARS-CoV-2 étaient fortement associés aux lieux de vente d’animaux vivants.
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)
En caractérisant l’évolution du récepteur ACE2 parmi un ensemble de mammifères, les auteurs ont mis en évidence une évolution rapide de l’interface ACE2/domaine de liaison des virus de type SARS dans le clade des rongeurs, alors que cette interface n’a subi qu’une faible adaptation chez les primates et les autres mammifères non connus pour héberger des SARS. Cela les conduit à penser que des espèces de rongeurs pourraient avoir acquis un certain degré de tolérance ou de résistance aux infections par les virus de type SARS, alors que les mammifères sans adaptation tangible, dont les primates, seraient plus à même de manifester des symptômes de maladie.
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 25 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 6 mars 2022)
Dans cet article, les auteurs présentent les résultats des recherches sur le SARS-CoV-2 effectuées à partir de prélèvements collectés de janvier à mars 2020 sur le marché de Huanan à Wuhan (Rép. pop. De Chine). Il s’agissait de prélèvements environnementaux ou bien d’origine animale (produits animaux conservés dans des chambres froides, chats libres, fèces de félins, un chien, une belette, 10 rats). Contrairement aux prélèvements environnementaux, aucun prélèvement animal n’a fourni un résultat positif aux épreuves diagnostiques réalisées.
Date de publication : 18 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Cette note dresse à date le bilan détaillé des cas de SARS-CoV-2 confirmés chez des animaux domestiques : animaux de compagnie (chiens, chats, furets, rongeurs et lagomorphes) et animaux d’élevage (hors élevages de visons d’Amérique).
Date de publication : 18 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
En utilisant des méthodes bio-informatiques et en considérant l’arbre phylogénique des sarbecovirus ainsi que d’autres données de génomique, les auteurs défendent l’idée que le SARS-CoV-2 aurait résulté d’une recombinaison entre le virus de chauve-souris RaTG13 et le Pangolin-CoV et que l’infection humaine trouverait son origine chez le pangolin.
Date de publication : 17 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 mars 2022)
Les auteurs étudient les aspects structurels et génétiques de l’interaction entre la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et le récepteur cellulaire (ACE2) de différents groupes d’animaux qui y sont potentiellement sensibles, pour repérer ce qui influe sur l’éventail des hôtes du virus. Ils évoquent une possible persistance de variants du virus dans la faune sauvage avec les conséquences que cela peut avoir sur l’éradication de la COVID-19.
Date de publication : 8 février 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)
Les auteurs, ayant utilisé des méthodes d’analyse génétique et phylogénique pour étudier les sarbecovirus des chauves-souris en relation avec le SARS-CoV-2, confortent l’hypothèse selon laquelle les Rhinolophes fer à cheval (genre Rhinolophus), dont l’aire de distribution couvre la Chine méridionale et le Sud-Est asiatique, sont très probablement à l’origine de ce virus après de multiples recombinaisons qui se sont produites sur une centaine d’années.
Date de publication : 24 janvier 2022 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Ce Tableau de bord répertorie les cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez les animaux au Canada que le Centre national des maladies animales exotiques de l’Agence canadienne d’inspection des aliments a confirmés. Il est interactif et permet d’afficher les données selon l’espèce, la province ainsi que la période de temps.
Date de publication : 20 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 1er mai 2022)
Les auteurs étudient les aspects structurels et génétiques de l’interaction entre la protéine de spicule du SARS-CoV-2 et le récepteur cellulaire (ACE2) de différents groupes d’animaux qui y sont potentiellement sensibles, pour repérer ce qui influe sur l’éventail des hôtes du virus. Ils évoquent une possible persistance de variants du virus dans la faune sauvage avec les conséquences que cela peut avoir sur l’éradication de la COVID-19.
Date de publication : 15 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)
Cette étude, s’appuyant sur les séquences de gènes disponibles dans les banques de données internationales, a été réalisée en vue de mieux comprendre la répartition spatiale des souches de SARS-CoV-2 et des virus qui en sont proches chez les animaux domestiques et sauvages, leur diversité génétique, leurs similarités statistiquement significatives ainsi que les mutations génétiques qui sont survenues.Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 15 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)
En procédant à une nouvelle étude de coronavirus voisins du SARS-CoV-2 isolés chez des rhinolophidés européens, les auteurs identifient différents déterminants moléculaires favorables à l’émergence du site de clivage de la furine qui est propre au SARS-CoV-2, ce qui vient en appui à l’hypothèse de ce virus.Date de publication : 13 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)
Cette étude porte sur les divergences de composition du génome et d’utilisation des codons des souches de SARS-CoV-2 isolées chez l’être humain et les animaux en vue de comprendre les phénomènes de sélection naturelle susceptibles de jouer un rôle dans l’évolution, l’adaptabilité et la transmission de ce virus.Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 13 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)
Les auteurs ont développé un outil de modélisation relatif à la distribution des chauves-souris hôtes de sarbecovirus en tenant compte de caractéristiques climatiques et paysagères. Les facteurs majeurs de cette répartition étant la saisonnalité des températures et l’existence de grottes dans un contexte où la planète va se réchauffer, ils proposent des scénarios d’évolution de cette répartition d’ici 2100 avec en certains lieux disparition des espèces et en d’autres concentration de celles-ci à proximité des populations humaines. Date de publication : 10 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 février 2022)
Les auteurs donnent un large aperçu des recherches en matière de surveillance entreprises dans divers endroits du monde pour évaluer le niveau d’exposition au SARS-CoV-2 de différents types d’animaux (de compagnie, de production, tenus en captivité ou sauvages). Ils passent aussi en revue les connaissances sur les possibilités de transmission du virus au sein des espèces et entre espèces et sur les conséquences que ces phénomènes pourraient avoir en matière de santé publique.
Date de publication : 9 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 décembre 2021)
Le journaliste fait le point sur le développement de vaccins vétérinaires dirigés contre le SARS-CoV-2 dans le monde et leur usage chez des animaux domestiques ou sauvages (dans des zoos). Date de publication : 9 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 avril 2022)
Les auteurs modélisent les interactions entre le récepteur cellulaire ACE2 et la protéine de spicule du SARS-CoV-2 chez différentes espèces animales et les comparent à ce qui se passe avec l’ACE2 humaine. Ils établissent un classement entre ces espèces, fondé sur cette affinité de liaison, mais reconnaissent que des expérimentations in vivo seraient nécessaires pour valider les résultats de leurs analyses faites in silico.
Date de publication : 6 décembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 18 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 17 novembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 4 octobre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 9 janvier 2022)
Revue des connaissances relatives à la sensibilité des espèces animales domestiques et sauvages à une infection expérimentale par le SARS-CoV-2, avec description des signes cliniques observés, ainsi qu’à la possibilité de transmission du virus entre congénères. Y sont aussi présentées des informations sur les infections naturelles qui se sont produites lors de contacts entre personnes et animaux.Date de publication : 26 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Les auteurs cherchent à déterminer, par des méthodes bio-informatiques appliquées à la structure de l’ACE2, quels animaux de la faune brésilienne seraient susceptibles de devenir des hôtes du SARS-CoV-2. Ils repèrent ainsi trois espèces : le puma (Puma concolor), le loup à crinière (Chrysocyon brachyurus) et le chien des buissons (Speothos venaticus) qui pourraient se contaminer en chassant le cerf de Virginie.Date de publication : 24 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)
Date de publication : 7 septembre 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 3 octobre 2021)
Date de publication : 31 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)
Date de publication : 27 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)
Date de publication : 27 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)
Date de publication : 25 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2021)
Date de publication : 25 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de publication : 18 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 26 septembre 2021)
Date de publication : 10 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 août 2021)
Date de publication : 2 août 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 août 2021)
Date de publication : 14 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)
Date de publication : 10 juillet 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 décembre 2021)
Date de publication : 8 juillet 2021 –(mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Les auteurs ont passé en revue la littérature disponible sur la sensibilité des espèces animales au SARS-CoV-2 et sur les facteurs les plus pertinents permettant d’estimer celle-ci ainsi que la capacité de ces espèces à transmettre le virus. Cette revue s’intéresse en particulier au polymorphisme de la TMPRSS2 et de l’ACE2, deux protéines de l’hôte qui contribuent aux différences constatées entre espèces.Date de publication : 24 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Date de mise sur un forum de discussion : 8 juin 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 juin 2021)
Date de mise sur un forum de discussion : 12 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)
Date de publication : 11 mai 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 19 décembre 2021)
Par des méthodes statistiques, les auteurs calculent la probabilité d’attachement du virus aux cellules d’un ensemble d’espèces de mammifères. Ils observent aussi que chez sept d’entre elles, les contacts hydrophobes constatés entre le virus et l’ACE2 chez l’Homme font défaut, soit une affinité moindre entre l’un et l’autre chez ces animaux. Pour autant, la structure tridimensionnelle de leur ACE2 rend possible l’attachement viral.Date de publication : 26 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 30 mai 2021)
Date de publication : 16 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 10 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)
Date de publication : 7 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 5 avril 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 avril 2021)
Date de publication : 31 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)
Date de publication : 30 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 11 avril 2021)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 26 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)
Date de publication : 3 mars 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 4 avril 2021)
Date de publication : 28 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)
Date de publication : 26 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 mars 2021)
Date de publication : 26 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)
Date de publication : 25 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 avril 2022)
Les auteurs ont réalisé des simulations de dynamique moléculaire concernant les complexes formés par la liaison entre l’ACE2 humaine (hACE2) et le domaine d’attachement de la spicule du SARS-CoV-2, du SARS-CoV, du pangolin-CoV et du RaTG13 de la chauve-souris. En examinant le réseau des ponts hydrogène formés lors de cette liaison et en estimant les énergies libres en jeu localement, les auteurs ont trouvé que le pangolin-CoV et le SARS-CoV-2 s’attachaient à l’hACE2 de manière similaire alors que la liaison avec les deux autres virus était moins forte. Les auteurs considèrent que ces recherches renforcent l’hypothèse selon laquelle le pangolin peut potentiellement jouer le rôle d’hôte intermédiaire du SARS-CoV-2.
Date de publication : 16 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)
Date de publication : 14 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 février 2021)
Date de publication : 10 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)
Date de publication : 5 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 28 février 2021)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 2 février 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 14 février 2021)
Date de publication : 19 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)
Date de publication : 18 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 janvier 2021)
Date de publication : 8 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)
Date de publication : 6 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)
Date de publication : 5 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)
Date de soumission en vue de publication (article en cours d’évaluation) : 4 janvier 2021 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)
Date de publication : 29 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 janvier 2021)
Date de publication : 28 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 10 janvier 2021)
Date de publication : 21 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 17 janvier 2021)
Les auteurs montrent que la glycoprotéine de spicule du SARS-CoV-2 a un tropisme marqué pour les récepteurs ACE2 non seulement de l’Homme mais aussi de nombre de mammifères, malgré les différences existant dans les séquences d’acides aminés de ces récepteurs. Ils identifient au sein de l’interface protéine de spicule – ACE2, par différentes méthodes, des résidus d’acides aminés qui sont susceptibles d’avoir joué un rôle essentiel dans l’apparition du SARS-CoV-2 chez l’Homme.
Date de publication : 18 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)
Date de publication : 7 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)
Date de publication : 3 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 7 mars 2021)
Date de publication : 2 décembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)
Date de publication : 15 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 24 janvier 2021)
Date de publication : 11 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)
Date de publication : 5 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)
Date de publication : 5 novembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)
Date de publication : 28 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)
Date de publication : 23 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)
Date de publication : 22 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 décembre 2020)
Date de publication : 9 octobre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)
Date de publication : 5 octobre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 octobre 2020)
Date de publication : 4 octobre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 29 novembre 2020)
Date de publication : 29 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)
Date de publication : 23 septembre 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 octobre 2020)
Date de publication : 8 septembre 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 18 octobre 2020)
Date de publication : 31 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 octobre 2020)
Date de publication : 12 août 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)
Date de publication : 10 août 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 septembre 2021)
Date de publication : 16 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 31 octobre 2020)
Date de publication : 10 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)
Date de publication : 7 juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 12 juillet 2020)
Date de publication : 3 juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 8 novembre 2020)
Date de publication : 1er juillet 2020 - (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 20 septembre 2020)
Date de publication : 1er juillet 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 21 mars 2021)
Date de publication : 24 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 5 septembre 2020)
Date de publication : 18 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 22 novembre 2020)
Date de publication : 11 juin 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 mars 2022)
Cette fiche explique de manière synthétique quelles sont les méthodes employées dans le cadre des recherches sur l’origine du SARS-CoV-2 et son évolution : séquençage, analyse informatique des séquences, construction des arbres phylogéniques. Elle évoque également l’éventuel rôle des chauves-souris et des pangolins dans la genèse vraisemblablement ancienne du SARS-CoV-2.
Date de publication : 27 mai 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 15 novembre 2020)
Date de mise sur un forum de discussion : 22 avril 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 13 juin 2021)
Date de publication : 17 mars 2020 – (mis en ligne sur le site de l’AEEMA le 27 décembre 2020)